More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0300 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0300  Phosphomethylpyrimidine kinase  100 
 
 
259 aa  520  1e-147  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000969067  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1153  phosphomethylpyrimidine kinase  35.83 
 
 
272 aa  153  2.9999999999999998e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0935315  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1992  phosphomethylpyrimidine kinase  36.18 
 
 
270 aa  148  1.0000000000000001e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1225  phosphomethylpyrimidine kinase  36.14 
 
 
270 aa  142  5e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0641  phosphomethylpyrimidine kinase  36.14 
 
 
270 aa  142  7e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.328033  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1100  phosphomethylpyrimidine kinase  36.14 
 
 
270 aa  142  7e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0125  phosphomethylpyrimidine kinase  31.33 
 
 
285 aa  139  3.9999999999999997e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.713324 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2522  phosphomethylpyrimidine kinase  34 
 
 
262 aa  139  6e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0565  phosphomethylpyrimidine kinase  34.82 
 
 
264 aa  139  6e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00127347  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2517  phosphomethylpyrimidine kinase  34.71 
 
 
260 aa  137  1e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1124  phosphomethylpyrimidine kinase  35.29 
 
 
270 aa  137  2e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5600  hydroxy-methylpyrimidine kinase /hydroxy-phosphomethylpyrimidine kinase  31.25 
 
 
266 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429432  normal  0.105983 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1397  phosphomethylpyrimidine kinase  33.33 
 
 
265 aa  136  4e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000385147  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0200  phosphomethylpyrimidine kinase  33.47 
 
 
444 aa  135  6.0000000000000005e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.619111  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0918  phosphomethylpyrimidine kinase  31.2 
 
 
269 aa  134  1.9999999999999998e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3577  phosphomethylpyrimidine kinase  29.44 
 
 
266 aa  133  3e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.385467 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3082  phosphomethylpyrimidine kinase  28.86 
 
 
266 aa  132  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.190737 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1498  phosphomethylpyrimidine kinase  33.61 
 
 
257 aa  132  6e-30  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.315358  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1176  phosphomethylpyrimidine kinase  33.88 
 
 
267 aa  132  6e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.82174  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0143  phosphomethylpyrimidine kinase  32.41 
 
 
281 aa  132  6e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1554  phosphomethylpyrimidine kinase  28.86 
 
 
266 aa  132  6.999999999999999e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0961  phosphomethylpyrimidine kinase  28.86 
 
 
266 aa  132  6.999999999999999e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2239  phosphomethylpyrimidine kinase  28.86 
 
 
266 aa  132  6.999999999999999e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2391  phosphomethylpyrimidine kinase  28.86 
 
 
266 aa  132  6.999999999999999e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1135  phosphomethylpyrimidine kinase  28.86 
 
 
266 aa  132  6.999999999999999e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.878652  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1544  phosphomethylpyrimidine kinase  28.86 
 
 
266 aa  132  6.999999999999999e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0853  phosphomethylpyrimidine kinase  30 
 
 
288 aa  131  9e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.114242  normal  0.0282488 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0997  phosphomethylpyrimidine kinase  30 
 
 
288 aa  131  9e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00609101  normal  0.106083 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0486  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  32.23 
 
 
277 aa  131  9e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3851  phosphomethylpyrimidine kinase  33.78 
 
 
497 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1670  phosphomethylpyrimidine kinase  37.95 
 
 
260 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.42362 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1443  phosphomethylpyrimidine kinase  32.13 
 
 
269 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.600581  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1545  phosphomethylpyrimidine kinase  34.55 
 
 
264 aa  130  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.104036  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1338  phosphomethylpyrimidine kinase  35.22 
 
 
264 aa  131  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00019728  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2711  phosphomethylpyrimidine kinase  29.44 
 
 
267 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.725967  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02031  phosphomethylpyrimidine kinase  28.86 
 
 
266 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1700  phosphomethylpyrimidine kinase  32.92 
 
 
273 aa  130  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.847021  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1082  phosphomethylpyrimidine kinase  30.36 
 
 
271 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.457786 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01995  hypothetical protein  28.86 
 
 
266 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4828  phosphomethylpyrimidine kinase  33.48 
 
 
273 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0828  phosphomethylpyrimidine kinase  31.6 
 
 
264 aa  130  3e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.192548  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0889  phosphomethylpyrimidine kinase  33.2 
 
 
293 aa  129  6e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000698623  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2250  phosphomethylpyrimidine kinase  31.08 
 
 
268 aa  128  7.000000000000001e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.660572  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4475  phosphomethylpyrimidine kinase  32.59 
 
 
259 aa  127  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.341855  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0647  phosphomethylpyrimidine kinase  33.78 
 
 
264 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0071  phosphomethylpyrimidine kinase  32.26 
 
 
267 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8003  phosphomethylpyrimidine kinase  30.57 
 
 
272 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.36597 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2378  phosphomethylpyrimidine kinase  28.11 
 
 
266 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.305846  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2470  phosphomethylpyrimidine kinase  30.42 
 
 
280 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.176006  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1583  phosphomethylpyrimidine kinase  31.3 
 
 
264 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.152097  normal  0.0340338 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2382  phosphomethylpyrimidine kinase  28.74 
 
 
266 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.779831 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3091  phosphomethylpyrimidine kinase  29.03 
 
 
266 aa  126  3e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0488797  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2333  phosphomethylpyrimidine kinase  28.11 
 
 
266 aa  126  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0639  phosphomethylpyrimidine kinase  27.52 
 
 
290 aa  126  4.0000000000000003e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.784703  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1191  phosphomethylpyrimidine kinase  28.51 
 
 
267 aa  125  5e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.16328  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2289  phosphomethylpyrimidine kinase  28.11 
 
 
266 aa  125  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.426705  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2490  phosphomethylpyrimidine kinase  28.11 
 
 
266 aa  125  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2061  phosphomethylpyrimidine kinase  30.2 
 
 
260 aa  125  6e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0150754  normal  0.0985623 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2787  phosphomethylpyrimidine kinase  31.44 
 
 
268 aa  125  6e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0741888  normal  0.0618431 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0706  phosphomethylpyrimidine kinase  35.56 
 
 
268 aa  125  6e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1301  phosphomethylpyrimidine kinase  28.63 
 
 
267 aa  125  7e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.185406  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2979  phosphomethylpyrimidine kinase  27.78 
 
 
267 aa  125  7e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1102  phosphomethylpyrimidine kinase  28.68 
 
 
271 aa  124  2e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0215379  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2331  phosphomethylpyrimidine kinase  30.47 
 
 
288 aa  124  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3167  phosphomethylpyrimidine kinase  32.59 
 
 
263 aa  123  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17923  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1271  phosphomethylpyrimidine kinase  35.42 
 
 
271 aa  123  3e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000051939  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5022  phosphomethylpyrimidine kinase  33.18 
 
 
271 aa  123  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2046  phosphomethylpyrimidine kinase  31.95 
 
 
266 aa  122  5e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2710  phosphomethylpyrimidine kinase  26.83 
 
 
266 aa  122  5e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.227545  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3765  phosphomethylpyrimidine kinase  32.89 
 
 
278 aa  122  6e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0235015 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1203  phosphomethylpyrimidine kinase  28.63 
 
 
266 aa  121  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.564031  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1014  phosphomethylpyrimidine kinase  29.75 
 
 
279 aa  121  9.999999999999999e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2909  phosphomethylpyrimidine kinase  29.57 
 
 
497 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.112824 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1321  phosphomethylpyrimidine kinase  28.63 
 
 
266 aa  121  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0644  phosphomethylpyrimidine kinase  29.2 
 
 
270 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4453  phosphomethylpyrimidine kinase  30.42 
 
 
270 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.800707  normal  0.352817 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0617  phosphomethylpyrimidine kinase  28.63 
 
 
276 aa  120  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2095  phosphomethylpyrimidine kinase  32.74 
 
 
285 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.376648  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1628  phosphomethylpyrimidine kinase  31.6 
 
 
266 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.522982  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3441  phosphomethylpyrimidine kinase  30.43 
 
 
268 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.907993  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0603  phosphomethylpyrimidine kinase  28.63 
 
 
276 aa  120  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0621  phosphomethylpyrimidine kinase  30.17 
 
 
270 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3528  phosphomethylpyrimidine kinase  32.29 
 
 
484 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4540  phosphomethylpyrimidine kinase  29.65 
 
 
270 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.48056 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0791  phosphomethylpyrimidine kinase  29.2 
 
 
270 aa  120  3e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0492  phosphomethylpyrimidine kinase  33.47 
 
 
262 aa  119  3e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1938  phosphomethylpyrimidine kinase  32.44 
 
 
267 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0695148  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0700  phosphomethylpyrimidine kinase  29.2 
 
 
270 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0644  phosphomethylpyrimidine kinase  29.2 
 
 
270 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0734  phosphomethylpyrimidine kinase  29.2 
 
 
270 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.24669  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0811  phosphomethylpyrimidine kinase  29.2 
 
 
270 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46467e-47 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4984  phosphomethylpyrimidine kinase  30.49 
 
 
268 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.702252  normal  0.243702 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0888  phosphomethylpyrimidine kinase  28.32 
 
 
270 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000310773  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09330  phosphomethylpyrimidine kinase  32.52 
 
 
264 aa  119  4.9999999999999996e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.387333 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1782  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  31.54 
 
 
278 aa  119  6e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000968277 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0804  phosphomethylpyrimidine kinase  28.32 
 
 
270 aa  118  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.088589  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1004  phosphomethylpyrimidine kinase  32.49 
 
 
275 aa  117  9.999999999999999e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1310  phosphomethylpyrimidine kinase  29.26 
 
 
268 aa  117  9.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0649  phosphomethylpyrimidine kinase  28.57 
 
 
267 aa  117  9.999999999999999e-26  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0890915  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2435  phosphomethylpyrimidine kinase  30.17 
 
 
285 aa  117  9.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.884635  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>