More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0492 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_0492  phosphomethylpyrimidine kinase  100 
 
 
262 aa  531  1e-150  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0101  phosphomethylpyrimidine kinase  47.24 
 
 
252 aa  246  2e-64  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0166  phosphomethylpyrimidine kinase  47.53 
 
 
253 aa  240  2e-62  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0750  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  45.63 
 
 
267 aa  186  4e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1992  phosphomethylpyrimidine kinase  37.7 
 
 
270 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0226  phosphomethylpyrimidine kinase  41.73 
 
 
277 aa  171  1e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3381  pyridoxal kinase  39.36 
 
 
270 aa  170  3e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0723053  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0617  phosphomethylpyrimidine kinase  41.34 
 
 
276 aa  169  4e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0603  phosphomethylpyrimidine kinase  41.34 
 
 
276 aa  169  4e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3927  pyridoxal kinase  37.8 
 
 
273 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3514  pyridoxal kinase  38.82 
 
 
271 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5110  pyridoxal kinase  37.4 
 
 
274 aa  159  3e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5266  pyridoxal kinase  37.4 
 
 
274 aa  159  4e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5093  pyridoxal kinase  37.4 
 
 
274 aa  159  4e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5663  pyridoxal kinase  37.4 
 
 
274 aa  159  4e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5508  pyridoxal kinase  37.4 
 
 
274 aa  159  4e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0990  phosphomethylpyrimidine kinase  36.86 
 
 
268 aa  159  5e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.199664  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1153  phosphomethylpyrimidine kinase  34.26 
 
 
272 aa  159  6e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0935315  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5207  pyridoxal kinase  36.61 
 
 
274 aa  158  7e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0071  phosphomethylpyrimidine kinase  36.65 
 
 
267 aa  158  7e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5542  pyridoxal kinase  37.01 
 
 
274 aa  157  1e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5415  pyridoxal kinase  37.01 
 
 
274 aa  157  1e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5537  pyridoxal kinase  37.01 
 
 
274 aa  157  1e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5593  pyridoxal kinase  37.01 
 
 
274 aa  157  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0542  phosphomethylpyrimidine kinase  35.48 
 
 
432 aa  155  7e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3167  phosphomethylpyrimidine kinase  38.49 
 
 
263 aa  154  1e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17923  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1176  phosphomethylpyrimidine kinase  37.3 
 
 
267 aa  154  2e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.82174  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2517  phosphomethylpyrimidine kinase  35.89 
 
 
260 aa  153  2e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1498  phosphomethylpyrimidine kinase  36.65 
 
 
257 aa  152  4e-36  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.315358  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1782  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  39.37 
 
 
278 aa  152  5e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000968277 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2522  phosphomethylpyrimidine kinase  36.96 
 
 
262 aa  152  5.9999999999999996e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1338  phosphomethylpyrimidine kinase  38.4 
 
 
264 aa  151  1e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00019728  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1583  phosphomethylpyrimidine kinase  37.5 
 
 
264 aa  150  1e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.152097  normal  0.0340338 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1545  phosphomethylpyrimidine kinase  37.35 
 
 
264 aa  150  2e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.104036  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2288  phosphomethylpyrimidine kinase  37.01 
 
 
269 aa  149  3e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4540  phosphomethylpyrimidine kinase  38.98 
 
 
270 aa  149  4e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.48056 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1700  phosphomethylpyrimidine kinase  34.14 
 
 
273 aa  149  5e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.847021  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0700  phosphomethylpyrimidine kinase  38.58 
 
 
270 aa  149  5e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0644  phosphomethylpyrimidine kinase  38.58 
 
 
270 aa  149  5e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0811  phosphomethylpyrimidine kinase  38.58 
 
 
270 aa  149  5e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46467e-47 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0791  phosphomethylpyrimidine kinase  38.58 
 
 
270 aa  149  5e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0734  phosphomethylpyrimidine kinase  38.58 
 
 
270 aa  149  5e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.24669  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1670  phosphomethylpyrimidine kinase  39.84 
 
 
260 aa  148  9e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.42362 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1124  phosphomethylpyrimidine kinase  37.35 
 
 
270 aa  147  2.0000000000000003e-34  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0888  phosphomethylpyrimidine kinase  37.8 
 
 
270 aa  146  3e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000310773  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0644  phosphomethylpyrimidine kinase  38.19 
 
 
270 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0804  phosphomethylpyrimidine kinase  37.4 
 
 
270 aa  144  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.088589  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0361  phosphomethylpyrimidine kinase  34.77 
 
 
262 aa  144  2e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000143367  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0565  phosphomethylpyrimidine kinase  36.17 
 
 
264 aa  144  2e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00127347  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1938  phosphomethylpyrimidine kinase  36.25 
 
 
267 aa  143  3e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0695148  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1419  phosphomethylpyrimidine kinase  32.69 
 
 
450 aa  142  4e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.528826 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0605  thiamine-phosphate pyrophosphorylase/phosphomethylpyrimidine kinase  34.58 
 
 
490 aa  142  5e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4914  phosphomethylpyrimidine kinase  32.4 
 
 
266 aa  142  5e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.43081 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1881  phosphomethylpyrimidine kinase  32.68 
 
 
444 aa  142  5e-33  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.000178657  normal  0.46671 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0650  phosphomethylpyrimidine kinase  37.01 
 
 
273 aa  142  7e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.797575  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0621  phosphomethylpyrimidine kinase  37.65 
 
 
270 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3528  phosphomethylpyrimidine kinase  35.17 
 
 
484 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21390  phosphomethylpyrimidine kinase  33.47 
 
 
265 aa  140  3e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.498075 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1271  phosphomethylpyrimidine kinase  38 
 
 
271 aa  140  3e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000051939  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3462  phosphomethylpyrimidine kinase  35.59 
 
 
484 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0125  phosphomethylpyrimidine kinase  35.21 
 
 
285 aa  139  4.999999999999999e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.713324 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0186  phosphomethylpyrimidine kinase  34.01 
 
 
264 aa  138  7e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2294  phosphomethylpyrimidine kinase  37.45 
 
 
269 aa  137  1e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0240  phosphomethylpyrimidine kinase  32.81 
 
 
449 aa  137  2e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.180045 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0647  phosphomethylpyrimidine kinase  35.06 
 
 
264 aa  137  2e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2046  phosphomethylpyrimidine kinase  35.37 
 
 
266 aa  136  3.0000000000000003e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0641  phosphomethylpyrimidine kinase  35.54 
 
 
270 aa  136  3.0000000000000003e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.328033  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0918  phosphomethylpyrimidine kinase  35.77 
 
 
269 aa  135  4e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1100  phosphomethylpyrimidine kinase  35.54 
 
 
270 aa  135  6.0000000000000005e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3519  phosphomethylpyrimidine kinase  34.88 
 
 
275 aa  134  9.999999999999999e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.728069  normal  0.293659 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1150  phosphomethylpyrimidine kinase  32.13 
 
 
277 aa  134  9.999999999999999e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0407  normal  0.449815 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2595  phosphomethylpyrimidine kinase  34.4 
 
 
494 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.61105  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1619  phosphomethylpyrimidine kinase  32.64 
 
 
269 aa  133  3e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.123369  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1225  phosphomethylpyrimidine kinase  34.71 
 
 
270 aa  133  3.9999999999999996e-30  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1688  phosphomethylpyrimidine kinase  32.64 
 
 
269 aa  132  3.9999999999999996e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.268945  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1830  phosphomethylpyrimidine kinase  33.99 
 
 
261 aa  132  5e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2130  phosphomethylpyrimidine kinase  31.25 
 
 
276 aa  132  5e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00414672  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2909  phosphomethylpyrimidine kinase  35.2 
 
 
497 aa  132  5e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.112824 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2168  phosphomethylpyrimidine kinase  31.25 
 
 
276 aa  132  5e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0225656  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3765  phosphomethylpyrimidine kinase  34.59 
 
 
278 aa  132  5e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0235015 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03020  phosphomethylpyrimidine kinase  31.87 
 
 
281 aa  132  6e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3739  phosphomethylpyrimidine kinase  30.56 
 
 
280 aa  131  1.0000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0593  phosphomethylpyrimidine kinase  32.41 
 
 
280 aa  131  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0452  phosphomethylpyrimidine kinase  33.2 
 
 
436 aa  130  2.0000000000000002e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.70912 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0366  phosphomethylpyrimidine kinase  33.73 
 
 
266 aa  130  2.0000000000000002e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.437548 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0649  phosphomethylpyrimidine kinase  33.98 
 
 
267 aa  130  2.0000000000000002e-29  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0890915  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3851  phosphomethylpyrimidine kinase  36 
 
 
497 aa  129  3e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0840  phosphomethylpyrimidine kinase  33.73 
 
 
265 aa  129  4.0000000000000003e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1915  phosphomethylpyrimidine kinase  33.2 
 
 
261 aa  129  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2049  phosphomethylpyrimidine kinase  33.2 
 
 
261 aa  129  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.281496  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3018  phosphomethylpyrimidine kinase  35.25 
 
 
270 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0552  phosphomethylpyrimidine kinase  35.44 
 
 
269 aa  127  1.0000000000000001e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00628299 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2763  phosphomethylpyrimidine kinase  34.13 
 
 
492 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00755044  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0192  phosphomethylpyrimidine kinase  32.18 
 
 
269 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5600  hydroxy-methylpyrimidine kinase /hydroxy-phosphomethylpyrimidine kinase  33.46 
 
 
266 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429432  normal  0.105983 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0915  phosphomethylpyrimidine kinase  33.33 
 
 
274 aa  127  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.522742  normal  0.315595 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2331  phosphomethylpyrimidine kinase  31.15 
 
 
288 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4984  phosphomethylpyrimidine kinase  34.12 
 
 
268 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.702252  normal  0.243702 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4277  phosphomethylpyrimidine kinase  31.84 
 
 
279 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0721  phosphomethylpyrimidine kinase  31.5 
 
 
285 aa  127  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>