More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0166 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_0166  phosphomethylpyrimidine kinase  100 
 
 
253 aa  509  1e-143  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0101  phosphomethylpyrimidine kinase  61.35 
 
 
252 aa  322  5e-87  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0492  phosphomethylpyrimidine kinase  47.53 
 
 
262 aa  240  1e-62  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0750  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  43.7 
 
 
267 aa  169  3e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3381  pyridoxal kinase  40.15 
 
 
270 aa  160  1e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0723053  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3514  pyridoxal kinase  39.77 
 
 
271 aa  159  5e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5266  pyridoxal kinase  40.23 
 
 
274 aa  155  4e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5093  pyridoxal kinase  40.23 
 
 
274 aa  155  4e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5110  pyridoxal kinase  40.23 
 
 
274 aa  155  4e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5508  pyridoxal kinase  40.23 
 
 
274 aa  155  4e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5663  pyridoxal kinase  40.23 
 
 
274 aa  155  4e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5207  pyridoxal kinase  39.84 
 
 
274 aa  155  6e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5542  pyridoxal kinase  39.69 
 
 
274 aa  154  1e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5593  pyridoxal kinase  39.69 
 
 
274 aa  154  1e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5415  pyridoxal kinase  39.84 
 
 
274 aa  154  2e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5537  pyridoxal kinase  39.84 
 
 
274 aa  154  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1338  phosphomethylpyrimidine kinase  36.99 
 
 
264 aa  153  2e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00019728  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3927  pyridoxal kinase  39.45 
 
 
273 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2288  phosphomethylpyrimidine kinase  38.78 
 
 
269 aa  151  1e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1545  phosphomethylpyrimidine kinase  36.59 
 
 
264 aa  148  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.104036  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0071  phosphomethylpyrimidine kinase  34.96 
 
 
267 aa  146  4.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0990  phosphomethylpyrimidine kinase  37.6 
 
 
268 aa  146  4.0000000000000006e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.199664  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1992  phosphomethylpyrimidine kinase  36.51 
 
 
270 aa  144  2e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1176  phosphomethylpyrimidine kinase  35.92 
 
 
267 aa  144  2e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.82174  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1938  phosphomethylpyrimidine kinase  39.41 
 
 
267 aa  143  3e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0695148  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0700  phosphomethylpyrimidine kinase  38.79 
 
 
270 aa  142  4e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0644  phosphomethylpyrimidine kinase  38.79 
 
 
270 aa  142  4e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0811  phosphomethylpyrimidine kinase  38.79 
 
 
270 aa  142  4e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46467e-47 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0734  phosphomethylpyrimidine kinase  38.79 
 
 
270 aa  142  4e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.24669  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0644  phosphomethylpyrimidine kinase  38.79 
 
 
270 aa  142  6e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0603  phosphomethylpyrimidine kinase  35.77 
 
 
276 aa  140  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0617  phosphomethylpyrimidine kinase  35.77 
 
 
276 aa  140  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0650  phosphomethylpyrimidine kinase  37.5 
 
 
273 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.797575  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0226  phosphomethylpyrimidine kinase  34.96 
 
 
277 aa  138  1e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0791  phosphomethylpyrimidine kinase  38.36 
 
 
270 aa  138  1e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2517  phosphomethylpyrimidine kinase  32.26 
 
 
260 aa  137  1e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0888  phosphomethylpyrimidine kinase  37.5 
 
 
270 aa  138  1e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000310773  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4540  phosphomethylpyrimidine kinase  38.36 
 
 
270 aa  137  1e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.48056 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1498  phosphomethylpyrimidine kinase  36.44 
 
 
257 aa  137  2e-31  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.315358  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0647  phosphomethylpyrimidine kinase  36.17 
 
 
264 aa  137  2e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2346  phosphomethylpyrimidine kinase  37.45 
 
 
266 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0621  phosphomethylpyrimidine kinase  36.8 
 
 
270 aa  135  5e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1688  phosphomethylpyrimidine kinase  35.56 
 
 
269 aa  135  5e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.268945  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1583  phosphomethylpyrimidine kinase  35.77 
 
 
264 aa  135  5e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.152097  normal  0.0340338 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2046  phosphomethylpyrimidine kinase  35.22 
 
 
266 aa  135  8e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0804  phosphomethylpyrimidine kinase  37.07 
 
 
270 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.088589  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3167  phosphomethylpyrimidine kinase  35.34 
 
 
263 aa  133  1.9999999999999998e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17923  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1619  phosphomethylpyrimidine kinase  34.96 
 
 
269 aa  132  5e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.123369  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0091  phosphomethylpyrimidine kinase  38.15 
 
 
270 aa  132  6e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2522  phosphomethylpyrimidine kinase  34.94 
 
 
262 aa  132  6.999999999999999e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1700  phosphomethylpyrimidine kinase  34.94 
 
 
273 aa  131  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.847021  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1124  phosphomethylpyrimidine kinase  37.85 
 
 
270 aa  131  1.0000000000000001e-29  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0240  phosphomethylpyrimidine kinase  35.43 
 
 
449 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.180045 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03020  phosphomethylpyrimidine kinase  32.14 
 
 
281 aa  130  1.0000000000000001e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2095  phosphomethylpyrimidine kinase  34.78 
 
 
285 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.376648  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1419  phosphomethylpyrimidine kinase  35.41 
 
 
450 aa  130  3e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.528826 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1102  phosphomethylpyrimidine kinase  34.13 
 
 
271 aa  129  6e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0215379  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1830  phosphomethylpyrimidine kinase  32.48 
 
 
261 aa  129  6e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0143  phosphomethylpyrimidine kinase  35.86 
 
 
281 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0186  phosphomethylpyrimidine kinase  35.89 
 
 
264 aa  127  2.0000000000000002e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0361  phosphomethylpyrimidine kinase  35.25 
 
 
262 aa  127  2.0000000000000002e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000143367  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1915  phosphomethylpyrimidine kinase  31.62 
 
 
261 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4470  phosphomethylpyrimidine kinase  33.6 
 
 
268 aa  126  3e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.668119  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3528  phosphomethylpyrimidine kinase  36.44 
 
 
484 aa  126  3e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3462  phosphomethylpyrimidine kinase  36.02 
 
 
484 aa  126  3e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0125  phosphomethylpyrimidine kinase  34 
 
 
285 aa  126  3e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.713324 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1881  phosphomethylpyrimidine kinase  35.06 
 
 
444 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.000178657  normal  0.46671 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1153  phosphomethylpyrimidine kinase  34.01 
 
 
272 aa  126  4.0000000000000003e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0935315  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2049  phosphomethylpyrimidine kinase  31.62 
 
 
261 aa  125  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.281496  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34590  phosphomethylpyrimidine kinase  32.81 
 
 
268 aa  125  4.0000000000000003e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21390  phosphomethylpyrimidine kinase  33.47 
 
 
265 aa  125  5e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.498075 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1670  phosphomethylpyrimidine kinase  34.91 
 
 
260 aa  124  1e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.42362 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4934  phosphomethylpyrimidine kinase  32.39 
 
 
268 aa  124  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.566917  normal  0.666851 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0366  phosphomethylpyrimidine kinase  33.47 
 
 
266 aa  124  2e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.437548 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0915  phosphomethylpyrimidine kinase  32.61 
 
 
274 aa  123  3e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.522742  normal  0.315595 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4914  phosphomethylpyrimidine kinase  33.33 
 
 
266 aa  122  4e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.43081 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0565  phosphomethylpyrimidine kinase  38.36 
 
 
264 aa  123  4e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00127347  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0605  phosphomethylpyrimidine kinase  33.07 
 
 
267 aa  122  4e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00132  phosphomethylpyrimidine kinase  31.62 
 
 
269 aa  122  8e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.256062  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4984  phosphomethylpyrimidine kinase  33.47 
 
 
268 aa  121  8e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.702252  normal  0.243702 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0605  thiamine-phosphate pyrophosphorylase/phosphomethylpyrimidine kinase  34.73 
 
 
490 aa  121  9e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0840  phosphomethylpyrimidine kinase  34.52 
 
 
265 aa  120  9.999999999999999e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0839  phosphomethylpyrimidine kinase  36.96 
 
 
449 aa  121  9.999999999999999e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.218839 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0853  phosphomethylpyrimidine kinase  33.47 
 
 
288 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.114242  normal  0.0282488 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0997  phosphomethylpyrimidine kinase  33.47 
 
 
288 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00609101  normal  0.106083 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1457  hypothetical protein  32.94 
 
 
488 aa  120  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1505  phosphomethylpyrimidine kinase  31.88 
 
 
269 aa  120  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0164576  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2909  phosphomethylpyrimidine kinase  35.74 
 
 
497 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.112824 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1155  phosphomethylpyrimidine kinase  33.47 
 
 
272 aa  119  3.9999999999999996e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.172529  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6681  phosphomethylpyrimidine kinase  33.46 
 
 
269 aa  119  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.432529 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0452  phosphomethylpyrimidine kinase  33.33 
 
 
436 aa  119  7e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.70912 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1305  phosphomethylpyrimidine kinase  33.73 
 
 
323 aa  119  7e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.279698  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03000  hydroxymethylpyrimidine kinase/phosphomethylpyrimidine kinase  32.17 
 
 
265 aa  119  7e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0918  phosphomethylpyrimidine kinase  33.47 
 
 
269 aa  118  7e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0372  phosphomethylpyrimidine kinase  32.82 
 
 
285 aa  118  7e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.591258  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3765  phosphomethylpyrimidine kinase  32.91 
 
 
278 aa  118  7.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0235015 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0552  phosphomethylpyrimidine kinase  34.6 
 
 
269 aa  118  9e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00628299 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5022  phosphomethylpyrimidine kinase  32.34 
 
 
271 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1628  phosphomethylpyrimidine kinase  32.28 
 
 
266 aa  116  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.522982  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0721  phosphomethylpyrimidine kinase  31.8 
 
 
285 aa  116  3e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>