More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0593 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_0593  phosphomethylpyrimidine kinase  100 
 
 
280 aa  557  1e-158  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0721  phosphomethylpyrimidine kinase  91.21 
 
 
285 aa  503  1e-141  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03020  phosphomethylpyrimidine kinase  70.48 
 
 
281 aa  378  1e-104  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30100  phosphomethylpyrimidine kinase  69.29 
 
 
266 aa  358  4e-98  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21390  phosphomethylpyrimidine kinase  61.42 
 
 
265 aa  318  7e-86  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.498075 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0186  phosphomethylpyrimidine kinase  62.41 
 
 
264 aa  316  3e-85  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2795  Phosphomethylpyrimidine kinase type-1  61.65 
 
 
283 aa  310  2e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0136558  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1150  phosphomethylpyrimidine kinase  61.71 
 
 
277 aa  308  6.999999999999999e-83  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0407  normal  0.449815 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4914  phosphomethylpyrimidine kinase  61.22 
 
 
266 aa  308  9e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.43081 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2928  Phosphomethylpyrimidine kinase type-1  62.17 
 
 
263 aa  295  8e-79  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.148017  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5207  pyridoxal kinase  47.01 
 
 
274 aa  230  2e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5266  pyridoxal kinase  46.8 
 
 
274 aa  228  8e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5093  pyridoxal kinase  46.8 
 
 
274 aa  228  8e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5663  pyridoxal kinase  46.8 
 
 
274 aa  228  8e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5508  pyridoxal kinase  46.8 
 
 
274 aa  228  8e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5110  pyridoxal kinase  46.8 
 
 
274 aa  228  9e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5542  pyridoxal kinase  47.2 
 
 
274 aa  228  1e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5593  pyridoxal kinase  47.2 
 
 
274 aa  228  1e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5537  pyridoxal kinase  46.8 
 
 
274 aa  227  2e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5415  pyridoxal kinase  46.8 
 
 
274 aa  227  2e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3927  pyridoxal kinase  46.22 
 
 
273 aa  225  7e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3381  pyridoxal kinase  45.45 
 
 
270 aa  209  4e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0723053  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3514  pyridoxal kinase  45.85 
 
 
271 aa  206  3e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0990  phosphomethylpyrimidine kinase  43.65 
 
 
268 aa  200  1.9999999999999998e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.199664  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2288  phosphomethylpyrimidine kinase  41.73 
 
 
269 aa  187  1e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0603  phosphomethylpyrimidine kinase  41.96 
 
 
276 aa  174  9.999999999999999e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0617  phosphomethylpyrimidine kinase  41.96 
 
 
276 aa  174  9.999999999999999e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0226  phosphomethylpyrimidine kinase  41.18 
 
 
277 aa  174  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0240  phosphomethylpyrimidine kinase  42.02 
 
 
449 aa  171  1e-41  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.180045 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1938  phosphomethylpyrimidine kinase  43.36 
 
 
267 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0695148  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2517  phosphomethylpyrimidine kinase  39.6 
 
 
260 aa  159  4e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1419  phosphomethylpyrimidine kinase  40.08 
 
 
450 aa  157  1e-37  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.528826 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1881  phosphomethylpyrimidine kinase  39.61 
 
 
444 aa  154  1e-36  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.000178657  normal  0.46671 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0700  phosphomethylpyrimidine kinase  41.47 
 
 
270 aa  152  5e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0644  phosphomethylpyrimidine kinase  41.47 
 
 
270 aa  152  5e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0734  phosphomethylpyrimidine kinase  41.47 
 
 
270 aa  152  5e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.24669  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0811  phosphomethylpyrimidine kinase  41.47 
 
 
270 aa  152  5e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46467e-47 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0888  phosphomethylpyrimidine kinase  41.86 
 
 
270 aa  152  7e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000310773  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0804  phosphomethylpyrimidine kinase  41.86 
 
 
270 aa  152  8e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.088589  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0693  phosphomethylpyrimidine kinase  37.85 
 
 
269 aa  150  2e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0650  phosphomethylpyrimidine kinase  41.47 
 
 
273 aa  150  2e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.797575  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0644  phosphomethylpyrimidine kinase  41.09 
 
 
270 aa  150  3e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0071  phosphomethylpyrimidine kinase  36.47 
 
 
267 aa  150  3e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2046  phosphomethylpyrimidine kinase  41.18 
 
 
266 aa  149  4e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0791  phosphomethylpyrimidine kinase  40.7 
 
 
270 aa  148  8e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4540  phosphomethylpyrimidine kinase  40.31 
 
 
270 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.48056 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0366  phosphomethylpyrimidine kinase  40.8 
 
 
266 aa  147  2.0000000000000003e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.437548 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1992  phosphomethylpyrimidine kinase  37.21 
 
 
270 aa  144  2e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0621  phosphomethylpyrimidine kinase  40.4 
 
 
270 aa  143  4e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1338  phosphomethylpyrimidine kinase  34.52 
 
 
264 aa  142  6e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00019728  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1176  phosphomethylpyrimidine kinase  37 
 
 
267 aa  141  9.999999999999999e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.82174  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1124  phosphomethylpyrimidine kinase  35.66 
 
 
270 aa  140  1.9999999999999998e-32  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1545  phosphomethylpyrimidine kinase  33.73 
 
 
264 aa  140  3e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.104036  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0452  phosphomethylpyrimidine kinase  38.74 
 
 
436 aa  139  3.9999999999999997e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.70912 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1153  phosphomethylpyrimidine kinase  33.94 
 
 
272 aa  139  4.999999999999999e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0935315  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0706  phosphomethylpyrimidine kinase  36.09 
 
 
268 aa  139  4.999999999999999e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34590  phosphomethylpyrimidine kinase  36.86 
 
 
268 aa  139  7e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2346  phosphomethylpyrimidine kinase  40.56 
 
 
266 aa  138  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0750  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  36.53 
 
 
267 aa  137  2e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2061  phosphomethylpyrimidine kinase  37.45 
 
 
260 aa  136  3.0000000000000003e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0150754  normal  0.0985623 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1155  phosphomethylpyrimidine kinase  38.55 
 
 
272 aa  135  8e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.172529  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2095  phosphomethylpyrimidine kinase  39.77 
 
 
285 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.376648  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3018  phosphomethylpyrimidine kinase  40.24 
 
 
270 aa  132  5e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2168  phosphomethylpyrimidine kinase  33.98 
 
 
276 aa  132  6e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0225656  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2909  phosphomethylpyrimidine kinase  41.77 
 
 
497 aa  132  6e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.112824 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0839  phosphomethylpyrimidine kinase  36.58 
 
 
449 aa  132  6e-30  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.218839 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2130  phosphomethylpyrimidine kinase  33.98 
 
 
276 aa  132  6e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00414672  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1583  phosphomethylpyrimidine kinase  38.65 
 
 
264 aa  132  6.999999999999999e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.152097  normal  0.0340338 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1700  phosphomethylpyrimidine kinase  33.08 
 
 
273 aa  131  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.847021  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0492  phosphomethylpyrimidine kinase  32.41 
 
 
262 aa  131  1.0000000000000001e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0605  thiamine-phosphate pyrophosphorylase/phosphomethylpyrimidine kinase  40.56 
 
 
490 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0565  phosphomethylpyrimidine kinase  34.8 
 
 
264 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00127347  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2522  phosphomethylpyrimidine kinase  36.47 
 
 
262 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3519  phosphomethylpyrimidine kinase  36.6 
 
 
275 aa  129  5.0000000000000004e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.728069  normal  0.293659 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0853  phosphomethylpyrimidine kinase  34.86 
 
 
288 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.114242  normal  0.0282488 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0997  phosphomethylpyrimidine kinase  34.86 
 
 
288 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00609101  normal  0.106083 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0840  phosphomethylpyrimidine kinase  38.26 
 
 
265 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3167  phosphomethylpyrimidine kinase  38 
 
 
263 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17923  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0101  phosphomethylpyrimidine kinase  30.83 
 
 
252 aa  125  6e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2763  phosphomethylpyrimidine kinase  38 
 
 
492 aa  124  1e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00755044  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4984  phosphomethylpyrimidine kinase  38.65 
 
 
268 aa  124  1e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.702252  normal  0.243702 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1397  phosphomethylpyrimidine kinase  34.52 
 
 
265 aa  124  2e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000385147  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0639  phosphomethylpyrimidine kinase  35.21 
 
 
290 aa  124  2e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.784703  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1782  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  33.97 
 
 
278 aa  124  2e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000968277 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4277  phosphomethylpyrimidine kinase  37.88 
 
 
279 aa  123  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1670  phosphomethylpyrimidine kinase  36.68 
 
 
260 aa  123  3e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.42362 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0486  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  37.87 
 
 
277 aa  123  4e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0641  phosphomethylpyrimidine kinase  35.83 
 
 
270 aa  123  4e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.328033  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0091  phosphomethylpyrimidine kinase  34.75 
 
 
270 aa  122  5e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1100  phosphomethylpyrimidine kinase  35.83 
 
 
270 aa  122  6e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1082  phosphomethylpyrimidine kinase  37.35 
 
 
271 aa  122  9e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.457786 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1225  phosphomethylpyrimidine kinase  35.83 
 
 
270 aa  121  9.999999999999999e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2250  phosphomethylpyrimidine kinase  35.57 
 
 
268 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.660572  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0647  phosphomethylpyrimidine kinase  38.15 
 
 
267 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.988766  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2300  phosphomethylpyrimidine kinase  38.15 
 
 
267 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.13158 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3765  phosphomethylpyrimidine kinase  36.61 
 
 
278 aa  121  9.999999999999999e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0235015 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1692  phosphomethylpyrimidine kinase  37.05 
 
 
283 aa  121  9.999999999999999e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0788599  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2787  phosphomethylpyrimidine kinase  37.41 
 
 
268 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0741888  normal  0.0618431 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1830  phosphomethylpyrimidine kinase  36.57 
 
 
261 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1443  phosphomethylpyrimidine kinase  37.45 
 
 
269 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.600581  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>