More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0693 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE0693  phosphomethylpyrimidine kinase  100 
 
 		 269 aa  550  1e-156  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0990  phosphomethylpyrimidine kinase  53.38 
 
 		 268 aa  291  5e-78  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.199664  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5207  pyridoxal kinase  52.27 
 
 		 274 aa  276  2e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3927  pyridoxal kinase  51.52 
 
 		 273 aa  276  3e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3381  pyridoxal kinase  51.88 
 
 		 270 aa  276  4e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0723053  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5266  pyridoxal kinase  51.89 
 
 		 274 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5093  pyridoxal kinase  51.89 
 
 		 274 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5110  pyridoxal kinase  51.89 
 
 		 274 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5508  pyridoxal kinase  51.89 
 
 		 274 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5663  pyridoxal kinase  51.89 
 
 		 274 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5593  pyridoxal kinase  51.89 
 
 		 274 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5542  pyridoxal kinase  51.89 
 
 		 274 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5415  pyridoxal kinase  51.89 
 
 		 274 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5537  pyridoxal kinase  51.89 
 
 		 274 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3514  pyridoxal kinase  50.75 
 
 		 271 aa  273  3e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2288  phosphomethylpyrimidine kinase  51.17 
 
 		 269 aa  248  7e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0226  phosphomethylpyrimidine kinase  45.66 
 
 		 277 aa  232  4.0000000000000004e-60  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0603  phosphomethylpyrimidine kinase  45.45 
 
 		 276 aa  228  1e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0617  phosphomethylpyrimidine kinase  45.45 
 
 		 276 aa  228  1e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30100  phosphomethylpyrimidine kinase  39.09 
 
 		 266 aa  184  1.0000000000000001e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1153  phosphomethylpyrimidine kinase  37.31 
 
 		 272 aa  181  1e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0935315  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1338  phosphomethylpyrimidine kinase  42.52 
 
 		 264 aa  180  2e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00019728  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1176  phosphomethylpyrimidine kinase  41.9 
 
 		 267 aa  180  2e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.82174  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0621  phosphomethylpyrimidine kinase  41.89 
 
 		 270 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1938  phosphomethylpyrimidine kinase  40.56 
 
 		 267 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0695148  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21390  phosphomethylpyrimidine kinase  37.36 
 
 		 265 aa  176  3e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.498075 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0650  phosphomethylpyrimidine kinase  40.68 
 
 		 273 aa  176  3e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.797575  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0811  phosphomethylpyrimidine kinase  40.68 
 
 		 270 aa  176  4e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46467e-47 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0700  phosphomethylpyrimidine kinase  40.68 
 
 		 270 aa  176  4e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0644  phosphomethylpyrimidine kinase  40.68 
 
 		 270 aa  176  4e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0734  phosphomethylpyrimidine kinase  40.68 
 
 		 270 aa  176  4e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.24669  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1545  phosphomethylpyrimidine kinase  40.94 
 
 		 264 aa  174  9.999999999999999e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.104036  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0186  phosphomethylpyrimidine kinase  38.46 
 
 		 264 aa  174  1.9999999999999998e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4914  phosphomethylpyrimidine kinase  38.43 
 
 		 266 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.43081 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0644  phosphomethylpyrimidine kinase  40.3 
 
 		 270 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0791  phosphomethylpyrimidine kinase  40.68 
 
 		 270 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0071  phosphomethylpyrimidine kinase  37.98 
 
 		 267 aa  173  2.9999999999999996e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3167  phosphomethylpyrimidine kinase  40.4 
 
 		 263 aa  172  3.9999999999999995e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1992  phosphomethylpyrimidine kinase  37.21 
 
 		 270 aa  172  3.9999999999999995e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0888  phosphomethylpyrimidine kinase  39.54 
 
 		 270 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000310773  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4540  phosphomethylpyrimidine kinase  40.68 
 
 		 270 aa  172  5e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.48056 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0565  phosphomethylpyrimidine kinase  41.15 
 
 		 264 aa  172  5e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00127347  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2517  phosphomethylpyrimidine kinase  38.28 
 
 		 260 aa  171  9e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2346  phosphomethylpyrimidine kinase  40.16 
 
 		 266 aa  171  1e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0804  phosphomethylpyrimidine kinase  39.54 
 
 		 270 aa  171  2e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.088589  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0721  phosphomethylpyrimidine kinase  38.25 
 
 		 285 aa  170  3e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0593  phosphomethylpyrimidine kinase  37.85 
 
 		 280 aa  170  3e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1692  phosphomethylpyrimidine kinase  39.42 
 
 		 283 aa  169  4e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0788599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2795  Phosphomethylpyrimidine kinase type-1  37.92 
 
 		 283 aa  167  1e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0136558  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2928  Phosphomethylpyrimidine kinase type-1  36.55 
 
 		 263 aa  167  1e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.148017  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1670  phosphomethylpyrimidine kinase  39.34 
 
 		 260 aa  167  2e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.42362 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03020  phosphomethylpyrimidine kinase  38.08 
 
 		 281 aa  163  2.0000000000000002e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2522  phosphomethylpyrimidine kinase  37.6 
 
 		 262 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1419  phosphomethylpyrimidine kinase  37.69 
 
 		 450 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.528826 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1150  phosphomethylpyrimidine kinase  36.44 
 
 		 277 aa  163  3e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0407  normal  0.449815 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1700  phosphomethylpyrimidine kinase  38.4 
 
 		 273 aa  162  7e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.847021  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2046  phosphomethylpyrimidine kinase  39.62 
 
 		 266 aa  161  1e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1881  phosphomethylpyrimidine kinase  36.92 
 
 		 444 aa  161  1e-38  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.000178657  normal  0.46671 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2095  phosphomethylpyrimidine kinase  35.32 
 
 		 285 aa  160  2e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.376648  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3018  phosphomethylpyrimidine kinase  40 
 
 		 270 aa  159  3e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2130  phosphomethylpyrimidine kinase  38.78 
 
 		 276 aa  159  4e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00414672  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2168  phosphomethylpyrimidine kinase  38.78 
 
 		 276 aa  159  4e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0225656  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1498  phosphomethylpyrimidine kinase  39.62 
 
 		 257 aa  159  4e-38  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.315358  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0452  phosphomethylpyrimidine kinase  36.23 
 
 		 436 aa  158  7e-38  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.70912 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0240  phosphomethylpyrimidine kinase  38.08 
 
 		 449 aa  158  8e-38  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.180045 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0647  phosphomethylpyrimidine kinase  37.84 
 
 		 264 aa  157  1e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0366  phosphomethylpyrimidine kinase  38.82 
 
 		 266 aa  155  5.0000000000000005e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.437548 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1124  phosphomethylpyrimidine kinase  36.54 
 
 		 270 aa  154  2e-36  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0639  phosphomethylpyrimidine kinase  35.61 
 
 		 290 aa  154  2e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.784703  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0361  phosphomethylpyrimidine kinase  35.94 
 
 		 262 aa  152  4e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000143367  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0867  phosphomethylpyrimidine kinase  43.8 
 
 		 264 aa  152  4e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2787  phosphomethylpyrimidine kinase  40.3 
 
 		 268 aa  152  8e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0741888  normal  0.0618431 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2979  phosphomethylpyrimidine kinase  36.36 
 
 		 267 aa  150  2e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0091  phosphomethylpyrimidine kinase  38.4 
 
 		 270 aa  150  2e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3091  phosphomethylpyrimidine kinase  36.6 
 
 		 266 aa  150  2e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0488797  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3082  phosphomethylpyrimidine kinase  36.15 
 
 		 266 aa  150  3e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.190737 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1554  phosphomethylpyrimidine kinase  36.15 
 
 		 266 aa  149  4e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1135  phosphomethylpyrimidine kinase  36.15 
 
 		 266 aa  149  4e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.878652  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2391  phosphomethylpyrimidine kinase  36.15 
 
 		 266 aa  149  4e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0961  phosphomethylpyrimidine kinase  36.15 
 
 		 266 aa  149  4e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2239  phosphomethylpyrimidine kinase  36.15 
 
 		 266 aa  149  4e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1203  phosphomethylpyrimidine kinase  36.6 
 
 		 266 aa  149  4e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.564031  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1544  phosphomethylpyrimidine kinase  36.15 
 
 		 266 aa  149  4e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1321  phosphomethylpyrimidine kinase  36.6 
 
 		 266 aa  149  5e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1305  phosphomethylpyrimidine kinase  37.84 
 
 		 323 aa  148  9e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.279698  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02031  phosphomethylpyrimidine kinase  35.77 
 
 		 266 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01995  hypothetical protein  35.77 
 
 		 266 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0969  phosphomethylpyrimidine kinase  36.5 
 
 		 263 aa  148  1.0000000000000001e-34  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.922433  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0706  phosphomethylpyrimidine kinase  37.84 
 
 		 268 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0486  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  36.64 
 
 		 277 aa  147  2.0000000000000003e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2289  phosphomethylpyrimidine kinase  36.23 
 
 		 266 aa  146  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.426705  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2490  phosphomethylpyrimidine kinase  36.23 
 
 		 266 aa  146  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4126  phosphomethylpyrimidine kinase  37.45 
 
 		 266 aa  146  4.0000000000000006e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000167736 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2378  phosphomethylpyrimidine kinase  36.23 
 
 		 266 aa  146  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.305846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1583  phosphomethylpyrimidine kinase  37.5 
 
 		 264 aa  146  4.0000000000000006e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.152097  normal  0.0340338 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0840  phosphomethylpyrimidine kinase  38.85 
 
 		 265 aa  145  5e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1301  phosphomethylpyrimidine kinase  35.61 
 
 		 267 aa  145  5e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.185406  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5022  phosphomethylpyrimidine kinase  34.85 
 
 		 271 aa  145  5e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3739  phosphomethylpyrimidine kinase  33.33 
 
 		 280 aa  145  6e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2791  phosphomethylpyrimidine kinase type-2  35.52 
 
 		 264 aa  145  6e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.166267  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>