More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_30100 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_30100  phosphomethylpyrimidine kinase  100 
 
 
266 aa  536  1e-151  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0593  phosphomethylpyrimidine kinase  69.29 
 
 
280 aa  358  4e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0721  phosphomethylpyrimidine kinase  69.66 
 
 
285 aa  358  5e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1150  phosphomethylpyrimidine kinase  67.8 
 
 
277 aa  350  1e-95  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0407  normal  0.449815 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21390  phosphomethylpyrimidine kinase  66.54 
 
 
265 aa  348  4e-95  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.498075 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0186  phosphomethylpyrimidine kinase  66.54 
 
 
264 aa  345  6e-94  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2795  Phosphomethylpyrimidine kinase type-1  65.38 
 
 
283 aa  334  1e-90  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0136558  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4914  phosphomethylpyrimidine kinase  64.09 
 
 
266 aa  330  2e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.43081 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2928  Phosphomethylpyrimidine kinase type-1  66.16 
 
 
263 aa  324  8.000000000000001e-88  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.148017  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03020  phosphomethylpyrimidine kinase  61.13 
 
 
281 aa  310  1e-83  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5508  pyridoxal kinase  45.59 
 
 
274 aa  222  4e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5266  pyridoxal kinase  45.59 
 
 
274 aa  222  4e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5093  pyridoxal kinase  45.59 
 
 
274 aa  222  4e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5663  pyridoxal kinase  45.59 
 
 
274 aa  222  4e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5207  pyridoxal kinase  45.59 
 
 
274 aa  222  4e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5110  pyridoxal kinase  45.59 
 
 
274 aa  222  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5415  pyridoxal kinase  45.21 
 
 
274 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5537  pyridoxal kinase  45.21 
 
 
274 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5593  pyridoxal kinase  45.21 
 
 
274 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5542  pyridoxal kinase  45.21 
 
 
274 aa  219  3e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3927  pyridoxal kinase  44.44 
 
 
273 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3381  pyridoxal kinase  43.68 
 
 
270 aa  208  7e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0723053  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3514  pyridoxal kinase  43.3 
 
 
271 aa  204  1e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0990  phosphomethylpyrimidine kinase  44.44 
 
 
268 aa  202  4e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.199664  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2288  phosphomethylpyrimidine kinase  42.74 
 
 
269 aa  190  2e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0226  phosphomethylpyrimidine kinase  40.77 
 
 
277 aa  185  8e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0240  phosphomethylpyrimidine kinase  44 
 
 
449 aa  180  2e-44  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.180045 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0617  phosphomethylpyrimidine kinase  40.77 
 
 
276 aa  178  7e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0603  phosphomethylpyrimidine kinase  40.77 
 
 
276 aa  178  7e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1938  phosphomethylpyrimidine kinase  42.97 
 
 
267 aa  163  3e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0695148  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0693  phosphomethylpyrimidine kinase  39.09 
 
 
269 aa  162  4.0000000000000004e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2517  phosphomethylpyrimidine kinase  41.2 
 
 
260 aa  161  1e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1419  phosphomethylpyrimidine kinase  40.93 
 
 
450 aa  157  2e-37  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.528826 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0650  phosphomethylpyrimidine kinase  45.16 
 
 
273 aa  156  4e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.797575  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0700  phosphomethylpyrimidine kinase  44.35 
 
 
270 aa  155  6e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0644  phosphomethylpyrimidine kinase  44.35 
 
 
270 aa  155  6e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0734  phosphomethylpyrimidine kinase  44.35 
 
 
270 aa  155  6e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.24669  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0811  phosphomethylpyrimidine kinase  44.35 
 
 
270 aa  155  6e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46467e-47 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0888  phosphomethylpyrimidine kinase  44.76 
 
 
270 aa  155  7e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000310773  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0804  phosphomethylpyrimidine kinase  44.35 
 
 
270 aa  154  1e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.088589  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4540  phosphomethylpyrimidine kinase  43.95 
 
 
270 aa  154  1e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.48056 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0644  phosphomethylpyrimidine kinase  43.95 
 
 
270 aa  154  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0791  phosphomethylpyrimidine kinase  44.35 
 
 
270 aa  154  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0621  phosphomethylpyrimidine kinase  44.13 
 
 
270 aa  154  2e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1881  phosphomethylpyrimidine kinase  40.47 
 
 
444 aa  154  2e-36  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.000178657  normal  0.46671 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0452  phosphomethylpyrimidine kinase  38.65 
 
 
436 aa  152  8e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.70912 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2095  phosphomethylpyrimidine kinase  42.74 
 
 
285 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.376648  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2046  phosphomethylpyrimidine kinase  41.22 
 
 
266 aa  145  8.000000000000001e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1176  phosphomethylpyrimidine kinase  38.29 
 
 
267 aa  145  8.000000000000001e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.82174  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2346  phosphomethylpyrimidine kinase  42.97 
 
 
266 aa  144  1e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1153  phosphomethylpyrimidine kinase  37.75 
 
 
272 aa  142  5e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0935315  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1545  phosphomethylpyrimidine kinase  35.92 
 
 
264 aa  142  6e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.104036  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0071  phosphomethylpyrimidine kinase  38.52 
 
 
267 aa  141  8e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0839  phosphomethylpyrimidine kinase  38.55 
 
 
449 aa  141  9.999999999999999e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.218839 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1338  phosphomethylpyrimidine kinase  36.33 
 
 
264 aa  140  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00019728  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0706  phosphomethylpyrimidine kinase  38.22 
 
 
268 aa  139  7e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0366  phosphomethylpyrimidine kinase  40.57 
 
 
266 aa  136  4e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.437548 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0565  phosphomethylpyrimidine kinase  39.43 
 
 
264 aa  135  5e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00127347  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0605  thiamine-phosphate pyrophosphorylase/phosphomethylpyrimidine kinase  40.43 
 
 
490 aa  135  7.000000000000001e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2522  phosphomethylpyrimidine kinase  35.77 
 
 
262 aa  135  8e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1992  phosphomethylpyrimidine kinase  38.55 
 
 
270 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0853  phosphomethylpyrimidine kinase  38.8 
 
 
288 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.114242  normal  0.0282488 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0997  phosphomethylpyrimidine kinase  38.8 
 
 
288 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00609101  normal  0.106083 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3018  phosphomethylpyrimidine kinase  39.09 
 
 
270 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1670  phosphomethylpyrimidine kinase  40.49 
 
 
260 aa  131  9e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.42362 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2909  phosphomethylpyrimidine kinase  39.84 
 
 
497 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.112824 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3765  phosphomethylpyrimidine kinase  40.4 
 
 
278 aa  131  1.0000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0235015 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1443  phosphomethylpyrimidine kinase  37.86 
 
 
269 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.600581  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1583  phosphomethylpyrimidine kinase  38.67 
 
 
264 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.152097  normal  0.0340338 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1700  phosphomethylpyrimidine kinase  34.41 
 
 
273 aa  130  3e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.847021  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0840  phosphomethylpyrimidine kinase  41.04 
 
 
265 aa  130  3e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0828  phosphomethylpyrimidine kinase  35.08 
 
 
264 aa  128  9.000000000000001e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.192548  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3519  phosphomethylpyrimidine kinase  37.6 
 
 
275 aa  127  1.0000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.728069  normal  0.293659 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1397  phosphomethylpyrimidine kinase  35.1 
 
 
265 aa  127  1.0000000000000001e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000385147  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2791  phosphomethylpyrimidine kinase type-2  36.03 
 
 
264 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.166267  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0091  phosphomethylpyrimidine kinase  36.11 
 
 
270 aa  128  1.0000000000000001e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4126  phosphomethylpyrimidine kinase  41.94 
 
 
266 aa  127  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000167736 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1082  phosphomethylpyrimidine kinase  35.39 
 
 
271 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.457786 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4984  phosphomethylpyrimidine kinase  37.75 
 
 
268 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.702252  normal  0.243702 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1305  phosphomethylpyrimidine kinase  39.29 
 
 
323 aa  126  3e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.279698  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1155  phosphomethylpyrimidine kinase  40.49 
 
 
272 aa  127  3e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.172529  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0649  phosphomethylpyrimidine kinase  32.95 
 
 
267 aa  126  3e-28  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0890915  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3167  phosphomethylpyrimidine kinase  39.34 
 
 
263 aa  126  5e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17923  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2061  phosphomethylpyrimidine kinase  35 
 
 
260 aa  125  5e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0150754  normal  0.0985623 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1782  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  34.82 
 
 
278 aa  125  6e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000968277 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0486  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  39.11 
 
 
277 aa  125  9e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0647  phosphomethylpyrimidine kinase  38.52 
 
 
264 aa  124  1e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2168  phosphomethylpyrimidine kinase  33.6 
 
 
276 aa  124  1e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0225656  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2763  phosphomethylpyrimidine kinase  38.06 
 
 
492 aa  125  1e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00755044  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2130  phosphomethylpyrimidine kinase  33.6 
 
 
276 aa  124  1e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00414672  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0639  phosphomethylpyrimidine kinase  34.12 
 
 
290 aa  124  2e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.784703  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0492  phosphomethylpyrimidine kinase  32 
 
 
262 aa  124  2e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1124  phosphomethylpyrimidine kinase  35.39 
 
 
270 aa  123  3e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5600  hydroxy-methylpyrimidine kinase /hydroxy-phosphomethylpyrimidine kinase  36.29 
 
 
266 aa  123  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429432  normal  0.105983 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34590  phosphomethylpyrimidine kinase  35.18 
 
 
268 aa  122  4e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1310  phosphomethylpyrimidine kinase  36.44 
 
 
268 aa  122  5e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03000  hydroxymethylpyrimidine kinase/phosphomethylpyrimidine kinase  35.74 
 
 
265 aa  121  9.999999999999999e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1830  phosphomethylpyrimidine kinase  39.02 
 
 
261 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4453  phosphomethylpyrimidine kinase  36.99 
 
 
270 aa  120  3e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.800707  normal  0.352817 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2331  phosphomethylpyrimidine kinase  37.1 
 
 
288 aa  120  3e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>