More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_0912 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009637  MmarC7_0912  phosphomethylpyrimidine kinase  100 
 
 
394 aa  779    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.84137 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1769  phosphomethylpyrimidine kinase  79.59 
 
 
396 aa  610  9.999999999999999e-175  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0611594  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1032  phosphomethylpyrimidine kinase  79.08 
 
 
394 aa  592  1e-168  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0944  phosphomethylpyrimidine kinase  50.35 
 
 
435 aa  386  1e-106  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0460  phosphomethylpyrimidine kinase  42.14 
 
 
429 aa  302  6.000000000000001e-81  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0542  phosphomethylpyrimidine kinase  26.5 
 
 
432 aa  138  2e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0828  phosphomethylpyrimidine kinase  25.94 
 
 
452 aa  129  7.000000000000001e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2182  phosphomethylpyrimidine kinase  24.82 
 
 
456 aa  125  1e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3501  hydroxymethylpyrimidine kinase  26.37 
 
 
448 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.604187  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0381  phosphomethylpyrimidine kinase  33.86 
 
 
259 aa  119  6e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1881  phosphomethylpyrimidine kinase  24.83 
 
 
444 aa  117  3e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.000178657  normal  0.46671 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1419  phosphomethylpyrimidine kinase  25.06 
 
 
450 aa  116  8.999999999999998e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.528826 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0240  phosphomethylpyrimidine kinase  25.06 
 
 
449 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.180045 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0071  phosphomethylpyrimidine kinase  32.81 
 
 
267 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0192  phosphomethylpyrimidine kinase  30.59 
 
 
269 aa  108  1e-22  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0452  phosphomethylpyrimidine kinase  24.88 
 
 
436 aa  108  1e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.70912 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0139  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  24.28 
 
 
398 aa  108  1e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0137  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  24.28 
 
 
398 aa  108  1e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0828  phosphomethylpyrimidine kinase  29.41 
 
 
264 aa  108  2e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.192548  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1545  phosphomethylpyrimidine kinase  33.47 
 
 
264 aa  108  2e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.104036  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1338  phosphomethylpyrimidine kinase  32.58 
 
 
264 aa  108  2e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00019728  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0125  phosphomethylpyrimidine kinase  27.73 
 
 
285 aa  106  6e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.713324 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0969  phosphomethylpyrimidine kinase  34.76 
 
 
263 aa  106  9e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.922433  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2061  phosphomethylpyrimidine kinase  28.57 
 
 
260 aa  105  1e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0150754  normal  0.0985623 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4470  phosphomethylpyrimidine kinase  26.15 
 
 
268 aa  103  4e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.668119  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1498  phosphomethylpyrimidine kinase  28.69 
 
 
257 aa  103  5e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.315358  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4934  phosphomethylpyrimidine kinase  26.15 
 
 
268 aa  103  6e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.566917  normal  0.666851 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1443  phosphomethylpyrimidine kinase  27.52 
 
 
269 aa  102  9e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.600581  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1153  phosphomethylpyrimidine kinase  27.47 
 
 
272 aa  102  1e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0935315  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3401  phosphomethylpyrimidine kinase  24.9 
 
 
270 aa  102  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2250  phosphomethylpyrimidine kinase  27.2 
 
 
268 aa  101  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.660572  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0649  phosphomethylpyrimidine kinase  30.15 
 
 
267 aa  101  2e-20  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0890915  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0839  phosphomethylpyrimidine kinase  24.04 
 
 
449 aa  100  4e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.218839 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4984  phosphomethylpyrimidine kinase  24.62 
 
 
268 aa  100  6e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.702252  normal  0.243702 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1183  phosphomethylpyrimidine kinase  25.1 
 
 
518 aa  100  6e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00808749  hitchhiker  0.00513051 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1992  phosphomethylpyrimidine kinase  29.46 
 
 
270 aa  99.4  9e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0184  phosphomethylpyrimidine kinase  27.97 
 
 
403 aa  99  1e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000409945  normal  0.070974 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2627  phosphomethylpyrimidine kinase  26.85 
 
 
279 aa  99.4  1e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3463  phosphomethylpyrimidine kinase  23.88 
 
 
297 aa  99.4  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4453  phosphomethylpyrimidine kinase  27.24 
 
 
270 aa  98.2  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.800707  normal  0.352817 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3018  phosphomethylpyrimidine kinase  29.83 
 
 
270 aa  98.2  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1176  phosphomethylpyrimidine kinase  30.97 
 
 
267 aa  98.6  2e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.82174  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2522  phosphomethylpyrimidine kinase  28.79 
 
 
262 aa  98.6  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0840  phosphomethylpyrimidine kinase  25.3 
 
 
265 aa  97.8  3e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2592  phosphomethylpyrimidine kinase  26.61 
 
 
254 aa  97.8  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1397  phosphomethylpyrimidine kinase  29.88 
 
 
265 aa  97.4  3e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000385147  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5600  hydroxy-methylpyrimidine kinase /hydroxy-phosphomethylpyrimidine kinase  26.77 
 
 
266 aa  97.8  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429432  normal  0.105983 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2331  phosphomethylpyrimidine kinase  27.03 
 
 
288 aa  97.1  4e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1453  phosphomethylpyrimidine kinase  25.37 
 
 
289 aa  97.4  4e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0659513  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0623  Phosphomethylpyrimidine kinase  28.33 
 
 
255 aa  97.1  5e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03000  hydroxymethylpyrimidine kinase/phosphomethylpyrimidine kinase  25.97 
 
 
265 aa  96.7  6e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1140  phosphomethylpyrimidine kinase  28.63 
 
 
257 aa  96.3  8e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.837771 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1082  phosphomethylpyrimidine kinase  25.77 
 
 
271 aa  95.9  1e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.457786 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0845  hypothetical protein  27.2 
 
 
266 aa  95.5  1e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.324232  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1311  Phosphomethylpyrimidine kinase  30.09 
 
 
242 aa  95.5  1e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.275611  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1662  Phosphomethylpyrimidine kinase  31.22 
 
 
263 aa  94.7  2e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0143  phosphomethylpyrimidine kinase  29.39 
 
 
281 aa  95.1  2e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1305  phosphomethylpyrimidine kinase  26.44 
 
 
323 aa  94  4e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.279698  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0853  phosphomethylpyrimidine kinase  24.71 
 
 
288 aa  94  4e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.114242  normal  0.0282488 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0997  phosphomethylpyrimidine kinase  24.71 
 
 
288 aa  94  4e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00609101  normal  0.106083 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0491  phosphomethylpyrimidine kinase  21.6 
 
 
446 aa  94  5e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0914  phosphomethylpyrimidine kinase  27.07 
 
 
282 aa  93.2  8e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0556569  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1554  phosphomethylpyrimidine kinase  24.71 
 
 
266 aa  92.4  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2391  phosphomethylpyrimidine kinase  24.71 
 
 
266 aa  92.4  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1636  phosphomethylpyrimidine kinase  23.66 
 
 
499 aa  92  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0431333  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2239  phosphomethylpyrimidine kinase  24.71 
 
 
266 aa  92.4  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0961  phosphomethylpyrimidine kinase  24.71 
 
 
266 aa  92.4  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0399  phosphomethylpyrimidine kinase  28.45 
 
 
254 aa  92.4  1e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1419  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  24.71 
 
 
411 aa  92.8  1e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3082  phosphomethylpyrimidine kinase  24.71 
 
 
266 aa  92  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.190737 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1544  phosphomethylpyrimidine kinase  24.71 
 
 
266 aa  92.4  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1135  phosphomethylpyrimidine kinase  24.71 
 
 
266 aa  92.4  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.878652  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02031  phosphomethylpyrimidine kinase  24.71 
 
 
266 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1935  phosphomethylpyrimidine kinase  25.52 
 
 
283 aa  91.7  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2046  phosphomethylpyrimidine kinase  30.45 
 
 
266 aa  91.3  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01995  hypothetical protein  24.71 
 
 
266 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2711  phosphomethylpyrimidine kinase  24.05 
 
 
267 aa  90.9  3e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.725967  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0914  phosphomethylpyrimidine kinase  27.38 
 
 
269 aa  90.9  3e-17  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2662  phosphomethylpyrimidine kinase  26.77 
 
 
281 aa  90.9  3e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.993196 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0091  phosphomethylpyrimidine kinase  25.67 
 
 
270 aa  91.3  3e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5542  pyridoxal kinase  31.64 
 
 
274 aa  90.5  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4828  phosphomethylpyrimidine kinase  29.71 
 
 
273 aa  90.5  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0366  phosphomethylpyrimidine kinase  27.61 
 
 
266 aa  90.9  4e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.437548 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3232  phosphomethylpyrimidine kinase  21.68 
 
 
453 aa  90.9  4e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0639  phosphomethylpyrimidine kinase  28.51 
 
 
290 aa  90.5  4e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.784703  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2517  phosphomethylpyrimidine kinase  28.57 
 
 
260 aa  90.9  4e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5266  pyridoxal kinase  31.25 
 
 
274 aa  90.5  5e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5093  pyridoxal kinase  31.25 
 
 
274 aa  90.5  5e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5110  pyridoxal kinase  31.25 
 
 
274 aa  90.5  5e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5593  pyridoxal kinase  31.64 
 
 
274 aa  90.5  5e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5508  pyridoxal kinase  31.25 
 
 
274 aa  90.5  5e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5663  pyridoxal kinase  31.25 
 
 
274 aa  90.5  5e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27340  multifunctional hydroxymethylpyrimidine phosphokinase/4-amino-5-aminomethyl-2-methylpyrimidine hydrolase  22.53 
 
 
599 aa  89.7  7e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0700  phosphomethylpyrimidine kinase  31.02 
 
 
270 aa  89.7  7e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0644  phosphomethylpyrimidine kinase  31.02 
 
 
270 aa  89.7  7e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0734  phosphomethylpyrimidine kinase  31.02 
 
 
270 aa  89.7  7e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.24669  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1670  phosphomethylpyrimidine kinase  28.63 
 
 
260 aa  89.7  7e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.42362 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0811  phosphomethylpyrimidine kinase  31.02 
 
 
270 aa  89.7  7e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46467e-47 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5537  pyridoxal kinase  31.25 
 
 
274 aa  89.7  8e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0641  phosphomethylpyrimidine kinase  29.01 
 
 
270 aa  89.7  8e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.328033  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>