260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1419 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_1419  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  100 
 
 		 411 aa  841    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0137  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  56.33 
 
 		 398 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0139  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  56.08 
 
 		 398 aa  468  1.0000000000000001e-131  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1594  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  46.9 
 
 		 399 aa  385  1e-106  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0460  phosphomethylpyrimidine kinase  30.45 
 
 		 429 aa  157  4e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0240  phosphomethylpyrimidine kinase  28.04 
 
 		 449 aa  153  7e-36  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.180045 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1881  phosphomethylpyrimidine kinase  26.74 
 
 		 444 aa  150  5e-35  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.000178657  normal  0.46671 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1419  phosphomethylpyrimidine kinase  26.74 
 
 		 450 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.528826 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0944  phosphomethylpyrimidine kinase  28.73 
 
 		 435 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0828  phosphomethylpyrimidine kinase  26.8 
 
 		 452 aa  138  2e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2182  phosphomethylpyrimidine kinase  26.73 
 
 		 456 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0200  phosphomethylpyrimidine kinase  26.27 
 
 		 444 aa  125  1e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.619111  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3501  hydroxymethylpyrimidine kinase  28.03 
 
 		 448 aa  125  2e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.604187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0839  phosphomethylpyrimidine kinase  26.5 
 
 		 449 aa  124  4e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.218839 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0542  phosphomethylpyrimidine kinase  26.12 
 
 		 432 aa  123  5e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0646  phosphomethylpyrimidine kinase  25.36 
 
 		 445 aa  122  1.9999999999999998e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0762615  normal  0.306983 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2988  phosphomethylpyrimidine kinase  24.59 
 
 		 461 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1460  phosphomethylpyrimidine kinase  37.34 
 
 		 182 aa  107  3e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3232  phosphomethylpyrimidine kinase  22.04 
 
 		 453 aa  106  8e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0564  hypothetical protein  33.54 
 
 		 179 aa  98.2  2e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0381  phosphomethylpyrimidine kinase  28.74 
 
 		 259 aa  94  5e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0912  phosphomethylpyrimidine kinase  24.71 
 
 		 394 aa  92.8  1e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.84137 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1022  Phosphomethylpyrimidine kinase  33.99 
 
 		 190 aa  90.5  4e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1282  phosphomethylpyrimidine kinase  22.4 
 
 		 461 aa  85.9  0.000000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0623  Phosphomethylpyrimidine kinase  29.39 
 
 		 255 aa  85.1  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0919  phosphomethylpyrimidine kinase  36.89 
 
 		 127 aa  84.3  0.000000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1769  phosphomethylpyrimidine kinase  26.51 
 
 		 396 aa  82.4  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0611594  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2109  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  25.49 
 
 		 647 aa  81.6  0.00000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.671125 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1176  phosphomethylpyrimidine kinase  27.19 
 
 		 267 aa  77.8  0.0000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.82174  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0697  AIR synthase related protein-like  28 
 
 		 528 aa  77.8  0.0000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000561591  hitchhiker  0.000000203748 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12410  phosphomethylpyrimidine kinase  28.45 
 
 		 265 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0361  phosphomethylpyrimidine kinase  26.64 
 
 		 262 aa  75.1  0.000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000143367  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3772  phosphomethylpyrimidine kinase  28.14 
 
 		 265 aa  73.9  0.000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0714273 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2592  phosphomethylpyrimidine kinase  26.87 
 
 		 254 aa  73.9  0.000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1397  phosphomethylpyrimidine kinase  30.25 
 
 		 265 aa  73.6  0.000000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000385147  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1032  phosphomethylpyrimidine kinase  23.33 
 
 		 394 aa  73.2  0.000000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0071  phosphomethylpyrimidine kinase  26.94 
 
 		 267 aa  73.6  0.000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0143  phosphomethylpyrimidine kinase  28.27 
 
 		 281 aa  73.2  0.000000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1133  phosphomethylpyrimidine kinase  28.02 
 
 		 271 aa  73.2  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0125  phosphomethylpyrimidine kinase  23.75 
 
 		 285 aa  72.4  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.713324 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2411  HTH DNA-binding protein  27.03 
 
 		 307 aa  72  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0357343  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2331  phosphomethylpyrimidine kinase  25.7 
 
 		 288 aa  71.6  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0179  putative phosphomethylpyrimidine kinase  26.04 
 
 		 264 aa  72  0.00000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00139306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3018  phosphomethylpyrimidine kinase  26.45 
 
 		 270 aa  71.6  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1311  Phosphomethylpyrimidine kinase  27.31 
 
 		 242 aa  71.2  0.00000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.275611  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2468  Phosphomethylpyrimidine kinase  26.83 
 
 		 268 aa  70.5  0.00000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.946237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1583  phosphomethylpyrimidine kinase  26.32 
 
 		 264 aa  70.1  0.00000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.152097  normal  0.0340338 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2542  transcriptional regulator, XRE family  24.43 
 
 		 307 aa  69.7  0.00000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1662  Phosphomethylpyrimidine kinase  27.97 
 
 		 263 aa  69.3  0.0000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0638  phosphomethylpyrimidine kinase  29.36 
 
 		 274 aa  69.7  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2168  phosphomethylpyrimidine kinase  24.91 
 
 		 276 aa  68.9  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0225656  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2130  phosphomethylpyrimidine kinase  24.91 
 
 		 276 aa  68.9  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00414672  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1221  hypothetical protein  29.24 
 
 		 193 aa  68.9  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0930619 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1498  phosphomethylpyrimidine kinase  24.08 
 
 		 257 aa  68.2  0.0000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.315358  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3238  hypothetical protein  26.82 
 
 		 199 aa  67.8  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.112934  normal  0.19984 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1992  phosphomethylpyrimidine kinase  25.61 
 
 		 270 aa  68.2  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1601  phosphomethylpyrimidine kinase  25.2 
 
 		 251 aa  68.2  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1545  phosphomethylpyrimidine kinase  26.78 
 
 		 264 aa  67.4  0.0000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.104036  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2419  Phosphomethylpyrimidine kinase  27.23 
 
 		 269 aa  67  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.795296  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4658  phosphomethylpyrimidine kinase  27.78 
 
 		 265 aa  67  0.0000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.46443  normal  0.665926 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03000  hydroxymethylpyrimidine kinase/phosphomethylpyrimidine kinase  25.81 
 
 		 265 aa  67  0.0000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4782  phosphomethylpyrimidine kinase  27.78 
 
 		 265 aa  67  0.0000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.291324  normal  0.0384059 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0853  phosphomethylpyrimidine kinase  25.2 
 
 		 288 aa  67  0.0000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.114242  normal  0.0282488 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0997  phosphomethylpyrimidine kinase  25.2 
 
 		 288 aa  67  0.0000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00609101  normal  0.106083 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4836  phosphomethylpyrimidine kinase  28.94 
 
 		 265 aa  66.2  0.0000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0095  Phosphomethylpyrimidine kinase  24.1 
 
 		 253 aa  66.2  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000458496  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4470  phosphomethylpyrimidine kinase  24.69 
 
 		 268 aa  66.2  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.668119  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09280  phosphomethylpyrimidine kinase  28.76 
 
 		 271 aa  65.9  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.52325  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0969  phosphomethylpyrimidine kinase  28.45 
 
 		 263 aa  66.2  0.000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.922433  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2522  phosphomethylpyrimidine kinase  25.65 
 
 		 262 aa  66.2  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1457  hypothetical protein  23.46 
 
 		 488 aa  65.1  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1338  phosphomethylpyrimidine kinase  26.64 
 
 		 264 aa  65.1  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00019728  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4934  phosphomethylpyrimidine kinase  25.52 
 
 		 268 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.566917  normal  0.666851 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0167  phosphomethylpyrimidine kinase  26.27 
 
 		 264 aa  64.7  0.000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00133155  hitchhiker  0.000172032 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0192  phosphomethylpyrimidine kinase  24.89 
 
 		 269 aa  64.3  0.000000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1153  phosphomethylpyrimidine kinase  24.6 
 
 		 272 aa  64.7  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0935315  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0241  phosphomethylpyrimidine kinase  26.58 
 
 		 249 aa  64.7  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.801075 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1448  Phosphomethylpyrimidine kinase  34.44 
 
 		 314 aa  64.3  0.000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00994121  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0434  transcriptional regulator, XRE family  23.86 
 
 		 309 aa  64.3  0.000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.463605  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0014  phosphomethylpyrimidine kinase  27.91 
 
 		 260 aa  63.9  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1124  phosphomethylpyrimidine kinase  24.02 
 
 		 270 aa  64.3  0.000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0845  hypothetical protein  26.61 
 
 		 266 aa  63.9  0.000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.324232  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0629  phosphomethylpyrimidine kinase, putative  24.57 
 
 		 290 aa  63.5  0.000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.246036  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2517  phosphomethylpyrimidine kinase  23.46 
 
 		 260 aa  63.5  0.000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4945  phosphomethylpyrimidine kinase  29.11 
 
 		 265 aa  63.2  0.000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.505455  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1526  hypothetical protein  22.31 
 
 		 488 aa  62.8  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0209  phosphomethylpyrimidine kinase  25.96 
 
 		 304 aa  62.4  0.00000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.606568  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1140  phosphomethylpyrimidine kinase  24.66 
 
 		 257 aa  62.8  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.837771 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0639  phosphomethylpyrimidine kinase  26.67 
 
 		 290 aa  62.4  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.784703  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0565  phosphomethylpyrimidine kinase  25.94 
 
 		 264 aa  61.6  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00127347  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2166  hypothetical protein  29.41 
 
 		 304 aa  62  0.00000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00217357 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0022  transcriptional regulator, XRE family  26.14 
 
 		 298 aa  62  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.55201  normal  0.925385 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0688  phosphomethylpyrimidine kinase  24.9 
 
 		 253 aa  62  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1034  hypothetical protein  29.94 
 
 		 323 aa  62  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00255835 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0254  phosphomethylpyrimidine kinase/thiamin-phosphate pyrophosphorylase  24.35 
 
 		 529 aa  61.2  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0218  phosphomethylpyrimidine kinase  25.96 
 
 		 291 aa  61.2  0.00000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.940459  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2662  phosphomethylpyrimidine kinase  26.32 
 
 		 281 aa  61.2  0.00000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.993196 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3401  phosphomethylpyrimidine kinase  23.31 
 
 		 270 aa  61.2  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00145  Thiamine monophosphate synthase  24.59 
 
 		 526 aa  60.8  0.00000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1352  HTH DNA-binding protein  25 
 
 		 306 aa  60.8  0.00000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.111494 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>