43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0564 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0564  hypothetical protein  100 
 
 		 179 aa  368  1e-101  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1022  Phosphomethylpyrimidine kinase  56.42 
 
 		 190 aa  189  1e-47  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1419  phosphomethylpyrimidine kinase  47.28 
 
 		 450 aa  137  7.999999999999999e-32  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.528826 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1881  phosphomethylpyrimidine kinase  45.7 
 
 		 444 aa  137  1e-31  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.000178657  normal  0.46671 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0240  phosphomethylpyrimidine kinase  42.77 
 
 		 449 aa  123  2e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.180045 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0828  phosphomethylpyrimidine kinase  39.44 
 
 		 452 aa  118  3.9999999999999996e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0839  phosphomethylpyrimidine kinase  41.77 
 
 		 449 aa  118  6e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.218839 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3501  hydroxymethylpyrimidine kinase  40.22 
 
 		 448 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.604187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0137  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  33.52 
 
 		 398 aa  104  7e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0542  phosphomethylpyrimidine kinase  33.52 
 
 		 432 aa  104  8e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0139  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  32.95 
 
 		 398 aa  102  2e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1460  phosphomethylpyrimidine kinase  34.09 
 
 		 182 aa  102  3e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1419  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  33.54 
 
 		 411 aa  98.2  6e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1221  hypothetical protein  34.88 
 
 		 193 aa  96.7  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0930619 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0919  phosphomethylpyrimidine kinase  43.8 
 
 		 127 aa  93.2  2e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2182  phosphomethylpyrimidine kinase  33.54 
 
 		 456 aa  90.5  1e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1594  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  30.39 
 
 		 399 aa  88.2  6e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3238  hypothetical protein  35.4 
 
 		 199 aa  82.4  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.112934  normal  0.19984 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1034  hypothetical protein  29.14 
 
 		 323 aa  81.3  0.000000000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00255835 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0434  transcriptional regulator, XRE family  32.16 
 
 		 309 aa  81.3  0.000000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.463605  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2542  transcriptional regulator, XRE family  30.51 
 
 		 307 aa  80.9  0.000000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0460  phosphomethylpyrimidine kinase  33.54 
 
 		 429 aa  79.7  0.00000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2988  phosphomethylpyrimidine kinase  29.73 
 
 		 461 aa  78.2  0.00000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3232  phosphomethylpyrimidine kinase  28.81 
 
 		 453 aa  77  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2411  HTH DNA-binding protein  28.89 
 
 		 307 aa  76.6  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0357343  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0646  phosphomethylpyrimidine kinase  30.77 
 
 		 445 aa  75.5  0.0000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0762615  normal  0.306983 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1448  Phosphomethylpyrimidine kinase  32.4 
 
 		 314 aa  75.1  0.0000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00994121  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1282  phosphomethylpyrimidine kinase  26.94 
 
 		 461 aa  70.5  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1352  HTH DNA-binding protein  30.56 
 
 		 306 aa  68.9  0.00000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.111494 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0069  phosphomethylpyrimidine kinase  39.39 
 
 		 320 aa  68.6  0.00000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.844231  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2166  hypothetical protein  29.86 
 
 		 304 aa  67.8  0.00000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00217357 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0200  phosphomethylpyrimidine kinase  28.83 
 
 		 444 aa  67  0.0000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.619111  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2715  transcriptional regulator, XRE family  28.86 
 
 		 299 aa  66.2  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.603714  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0446  DNA binding protein  34.69 
 
 		 306 aa  66.2  0.0000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.407825 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1394  hypothetical protein  29.44 
 
 		 185 aa  61.6  0.000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.361977  normal  0.191695 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0944  phosphomethylpyrimidine kinase  27.75 
 
 		 435 aa  61.2  0.000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0697  AIR synthase related protein-like  28.18 
 
 		 528 aa  58.9  0.00000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000561591  hitchhiker  0.000000203748 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0491  phosphomethylpyrimidine kinase  28.26 
 
 		 446 aa  58.2  0.00000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2413  transcriptional regulator, XRE family  29.8 
 
 		 299 aa  57.8  0.00000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1311  hypothetical protein  41.89 
 
 		 78 aa  55.1  0.0000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.174745  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0022  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 298 aa  53.5  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.55201  normal  0.925385 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1029  AIR synthase-like protein  35.9 
 
 		 465 aa  51.6  0.000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0402037  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1469  Phosphomethylpyrimidine kinase  30.77 
 
 		 299 aa  48.5  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>