52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1460 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1460  phosphomethylpyrimidine kinase  100 
 
 		 182 aa  366  1e-100  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0828  phosphomethylpyrimidine kinase  50.85 
 
 		 452 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2182  phosphomethylpyrimidine kinase  44.26 
 
 		 456 aa  145  3e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3501  hydroxymethylpyrimidine kinase  43.82 
 
 		 448 aa  144  5e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.604187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0460  phosphomethylpyrimidine kinase  39.56 
 
 		 429 aa  135  2e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1394  hypothetical protein  41.67 
 
 		 185 aa  123  1e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.361977  normal  0.191695 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0240  phosphomethylpyrimidine kinase  42.31 
 
 		 449 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.180045 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0542  phosphomethylpyrimidine kinase  34.08 
 
 		 432 aa  114  6e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1881  phosphomethylpyrimidine kinase  39.78 
 
 		 444 aa  114  6.9999999999999995e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.000178657  normal  0.46671 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1419  phosphomethylpyrimidine kinase  38.46 
 
 		 450 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.528826 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1282  phosphomethylpyrimidine kinase  38.55 
 
 		 461 aa  112  4.0000000000000004e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2988  phosphomethylpyrimidine kinase  40.78 
 
 		 461 aa  109  2.0000000000000002e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1022  Phosphomethylpyrimidine kinase  41.3 
 
 		 190 aa  109  2.0000000000000002e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3232  phosphomethylpyrimidine kinase  38.61 
 
 		 453 aa  108  3e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1419  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  37.34 
 
 		 411 aa  107  8.000000000000001e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0564  hypothetical protein  34.09 
 
 		 179 aa  102  3e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0944  phosphomethylpyrimidine kinase  33.33 
 
 		 435 aa  102  3e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1594  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  37.33 
 
 		 399 aa  101  6e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0137  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  37.33 
 
 		 398 aa  99  3e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1221  hypothetical protein  32.98 
 
 		 193 aa  98.2  6e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0930619 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0139  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  36.67 
 
 		 398 aa  97.4  9e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1227  hypothetical protein  38.56 
 
 		 170 aa  96.3  2e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.908108  normal  0.984444 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0478  hypothetical protein  44.35 
 
 		 173 aa  94.7  6e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.97578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0839  phosphomethylpyrimidine kinase  34.81 
 
 		 449 aa  93.2  2e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.218839 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1490  hypothetical protein  34.46 
 
 		 182 aa  93.2  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2542  transcriptional regulator, XRE family  37.01 
 
 		 307 aa  91.3  7e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1034  hypothetical protein  34.27 
 
 		 323 aa  87.8  7e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00255835 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0434  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 309 aa  85.5  4e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.463605  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3238  hypothetical protein  33.12 
 
 		 199 aa  80.5  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.112934  normal  0.19984 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1448  Phosphomethylpyrimidine kinase  29.7 
 
 		 314 aa  79.7  0.00000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00994121  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0200  phosphomethylpyrimidine kinase  33.76 
 
 		 444 aa  79  0.00000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.619111  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0919  phosphomethylpyrimidine kinase  38.02 
 
 		 127 aa  79  0.00000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2413  transcriptional regulator, XRE family  34.42 
 
 		 299 aa  78.2  0.00000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0022  transcriptional regulator, XRE family  34.03 
 
 		 298 aa  77.8  0.00000000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.55201  normal  0.925385 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0697  AIR synthase related protein-like  28.73 
 
 		 528 aa  74.7  0.0000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000561591  hitchhiker  0.000000203748 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2715  transcriptional regulator, XRE family  33.1 
 
 		 299 aa  71.2  0.000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.603714  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2411  HTH DNA-binding protein  31.25 
 
 		 307 aa  71.2  0.000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0357343  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0446  DNA binding protein  35.33 
 
 		 306 aa  70.9  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.407825 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0491  phosphomethylpyrimidine kinase  32.93 
 
 		 446 aa  69.7  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0646  phosphomethylpyrimidine kinase  33.81 
 
 		 445 aa  68.2  0.00000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0762615  normal  0.306983 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1469  Phosphomethylpyrimidine kinase  35.06 
 
 		 299 aa  66.6  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2166  hypothetical protein  32.47 
 
 		 304 aa  66.2  0.0000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00217357 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1352  HTH DNA-binding protein  34.42 
 
 		 306 aa  65.1  0.0000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.111494 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1029  AIR synthase-like protein  30.61 
 
 		 465 aa  62.4  0.000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0402037  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1311  hypothetical protein  50.91 
 
 		 78 aa  54.3  0.0000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.174745  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0941  hypothetical protein  29.94 
 
 		 290 aa  50.8  0.00001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0069  phosphomethylpyrimidine kinase  32.76 
 
 		 320 aa  49.7  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.844231  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0912  phosphomethylpyrimidine kinase  25.66 
 
 		 394 aa  49.3  0.00003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.84137 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1032  phosphomethylpyrimidine kinase  24.55 
 
 		 394 aa  47.8  0.00008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0839  hypothetical protein  29.78 
 
 		 290 aa  47.4  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.660796  normal  0.142658 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1934  hypothetical protein  33.65 
 
 		 289 aa  46.6  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0364  phosphomethylpyrimidine kinase  26.57 
 
 		 437 aa  41.6  0.006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.422328  normal  0.381325 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>