21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_0839 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_0839  hypothetical protein  100 
 
 
290 aa  585  1e-166  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.660796  normal  0.142658 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1384  hypothetical protein  75.78 
 
 
289 aa  464  9.999999999999999e-131  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1934  hypothetical protein  71.28 
 
 
289 aa  419  1e-116  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0941  hypothetical protein  64.83 
 
 
290 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2166  hypothetical protein  31.21 
 
 
304 aa  139  7.999999999999999e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.00217357 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1448  Phosphomethylpyrimidine kinase  31.76 
 
 
314 aa  126  4.0000000000000003e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00994121  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1034  hypothetical protein  36.67 
 
 
323 aa  124  2e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00255835 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0434  transcriptional regulator, XRE family  26.81 
 
 
309 aa  83.6  0.000000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.463605  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0446  DNA binding protein  24.92 
 
 
306 aa  80.9  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.407825 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2413  transcriptional regulator, XRE family  26.97 
 
 
299 aa  80.1  0.00000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2542  transcriptional regulator, XRE family  26.25 
 
 
307 aa  79.7  0.00000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2411  HTH DNA-binding protein  25.95 
 
 
307 aa  79  0.00000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0357343  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1469  Phosphomethylpyrimidine kinase  27.85 
 
 
299 aa  75.1  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0022  transcriptional regulator, XRE family  26.32 
 
 
298 aa  74.7  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.55201  normal  0.925385 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2715  transcriptional regulator, XRE family  26.16 
 
 
299 aa  73.6  0.000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.603714  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0069  phosphomethylpyrimidine kinase  25.25 
 
 
320 aa  72  0.00000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.844231  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1352  HTH DNA-binding protein  24.17 
 
 
306 aa  65.1  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.111494 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0828  phosphomethylpyrimidine kinase  24.05 
 
 
452 aa  48.1  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0176  hypothetical protein  27.56 
 
 
119 aa  47.4  0.0003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1460  phosphomethylpyrimidine kinase  29.78 
 
 
182 aa  47.4  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3501  hydroxymethylpyrimidine kinase  28.09 
 
 
448 aa  43.5  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.604187  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>