49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0022 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0022  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 298 aa  580  1.0000000000000001e-165  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.55201  normal  0.925385 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2413  transcriptional regulator, XRE family  66.44 
 
 		 299 aa  383  1e-105  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1469  Phosphomethylpyrimidine kinase  65.1 
 
 		 299 aa  372  1e-102  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2715  transcriptional regulator, XRE family  63.97 
 
 		 299 aa  365  1e-100  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.603714  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0446  DNA binding protein  59.21 
 
 		 306 aa  334  1e-90  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.407825 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2411  HTH DNA-binding protein  41.33 
 
 		 307 aa  203  3e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0357343  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0434  transcriptional regulator, XRE family  41.89 
 
 		 309 aa  201  9.999999999999999e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.463605  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2542  transcriptional regulator, XRE family  39.52 
 
 		 307 aa  192  6e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1352  HTH DNA-binding protein  39.8 
 
 		 306 aa  180  2.9999999999999997e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.111494 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1448  Phosphomethylpyrimidine kinase  29.43 
 
 		 314 aa  105  1e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00994121  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0069  phosphomethylpyrimidine kinase  28.33 
 
 		 320 aa  103  5e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.844231  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2166  hypothetical protein  27.96 
 
 		 304 aa  93.6  4e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00217357 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1034  hypothetical protein  25.74 
 
 		 323 aa  84.3  0.000000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00255835 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2182  phosphomethylpyrimidine kinase  34.88 
 
 		 456 aa  84.3  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0941  hypothetical protein  29.7 
 
 		 290 aa  83.2  0.000000000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0828  phosphomethylpyrimidine kinase  33.7 
 
 		 452 aa  83.2  0.000000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1384  hypothetical protein  29.77 
 
 		 289 aa  82.4  0.000000000000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1460  phosphomethylpyrimidine kinase  34.03 
 
 		 182 aa  77.8  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0839  hypothetical protein  26.32 
 
 		 290 aa  74.7  0.000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.660796  normal  0.142658 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1419  phosphomethylpyrimidine kinase  31.87 
 
 		 450 aa  73.9  0.000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.528826 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1881  phosphomethylpyrimidine kinase  32.96 
 
 		 444 aa  72.4  0.000000000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.000178657  normal  0.46671 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0460  phosphomethylpyrimidine kinase  30.17 
 
 		 429 aa  69.7  0.00000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0697  AIR synthase related protein-like  35.05 
 
 		 528 aa  67.8  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000561591  hitchhiker  0.000000203748 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1934  hypothetical protein  28.28 
 
 		 289 aa  68.2  0.0000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0200  phosphomethylpyrimidine kinase  33.93 
 
 		 444 aa  67.8  0.0000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.619111  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3501  hydroxymethylpyrimidine kinase  28.57 
 
 		 448 aa  67.8  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.604187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0240  phosphomethylpyrimidine kinase  29.41 
 
 		 449 aa  65.1  0.000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.180045 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0839  phosphomethylpyrimidine kinase  30 
 
 		 449 aa  63.9  0.000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.218839 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3238  hypothetical protein  27.27 
 
 		 199 aa  61.6  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.112934  normal  0.19984 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1419  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  26.14 
 
 		 411 aa  62  0.00000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0646  phosphomethylpyrimidine kinase  29.17 
 
 		 445 aa  59.7  0.00000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0762615  normal  0.306983 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0944  phosphomethylpyrimidine kinase  25.15 
 
 		 435 aa  57.8  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0176  hypothetical protein  32.73 
 
 		 119 aa  57.4  0.0000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1221  hypothetical protein  28.65 
 
 		 193 aa  57.4  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0930619 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1029  AIR synthase-like protein  27.59 
 
 		 465 aa  57.4  0.0000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0402037  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1311  hypothetical protein  41.67 
 
 		 78 aa  55.8  0.0000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.174745  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0542  phosphomethylpyrimidine kinase  19.44 
 
 		 432 aa  55.1  0.000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0564  hypothetical protein  37.5 
 
 		 179 aa  53.5  0.000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0919  phosphomethylpyrimidine kinase  35.53 
 
 		 127 aa  52.4  0.00001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1594  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  27.92 
 
 		 399 aa  51.2  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3232  phosphomethylpyrimidine kinase  31.54 
 
 		 453 aa  50.8  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0491  phosphomethylpyrimidine kinase  31.54 
 
 		 446 aa  48.5  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1022  Phosphomethylpyrimidine kinase  23.26 
 
 		 190 aa  47.8  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0139  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  25.97 
 
 		 398 aa  47  0.0004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0137  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  25.97 
 
 		 398 aa  46.2  0.0007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2998  hypothetical protein  32.94 
 
 		 102 aa  45.4  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0934  hypothetical protein  32.93 
 
 		 138 aa  45.1  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.244199 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0090  helix-turn-helix domain-containing protein  33.71 
 
 		 116 aa  44.7  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.592947  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0262  hypothetical protein  34.18 
 
 		 107 aa  43.5  0.004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.233822 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>