30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2998 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_2998  hypothetical protein  100 
 
 		 102 aa  206  1e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2124  hypothetical protein  58.43 
 
 		 115 aa  103  9e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0290  hypothetical protein  53.26 
 
 		 107 aa  102  2e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1152  hypothetical protein  56.38 
 
 		 108 aa  100  7e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.168928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2423  hypothetical protein  51.06 
 
 		 134 aa  99.8  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0429086 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1213  hypothetical protein  52.53 
 
 		 107 aa  98.6  3e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.735424 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0262  hypothetical protein  52.58 
 
 		 107 aa  97.8  4e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.233822 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0484  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 116 aa  95.5  2e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0176  hypothetical protein  36.84 
 
 		 119 aa  73.2  0.000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0359  hypothetical protein  32.99 
 
 		 108 aa  59.7  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.114666  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1846  transcriptional regulator, fis family  34.69 
 
 		 109 aa  58.9  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2048  hypothetical protein  38.1 
 
 		 119 aa  58.5  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000000899924  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2388  transcriptional regulator, XRE family  32.97 
 
 		 106 aa  55.8  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.673915  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2046  transcriptional regulator, fis family  34.88 
 
 		 117 aa  56.2  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.03951  normal  0.243031 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0397  transcriptional regulator, Fis family  32.61 
 
 		 110 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0200714  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0533  hypothetical protein  36.47 
 
 		 121 aa  55.5  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1469  Phosphomethylpyrimidine kinase  37.65 
 
 		 299 aa  53.5  0.0000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2413  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 299 aa  53.5  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1410  transcriptional regulator-like protein  33.71 
 
 		 116 aa  53.1  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000126907  hitchhiker  0.000639527 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2036  Fis family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 109 aa  53.1  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.494843  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0295  transcriptional regulator-like  33 
 
 		 126 aa  50.1  0.000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0204  hypothetical protein  45.16 
 
 		 230 aa  48.5  0.00003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.803129 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0237  hypothetical protein  52.17 
 
 		 237 aa  47  0.00009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.211231 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0770  hypothetical protein  44.26 
 
 		 234 aa  46.6  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1314  hypothetical protein  52.17 
 
 		 231 aa  46.6  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0022  transcriptional regulator, XRE family  32.94 
 
 		 298 aa  45.4  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.55201  normal  0.925385 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0446  DNA binding protein  32.26 
 
 		 306 aa  45.1  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.407825 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2542  transcriptional regulator, XRE family  31.31 
 
 		 307 aa  44.7  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0434  transcriptional regulator, XRE family  28.28 
 
 		 309 aa  41.2  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.463605  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0090  helix-turn-helix domain-containing protein  30.23 
 
 		 116 aa  40.4  0.008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.592947  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>