55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0446 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_0446  DNA binding protein  100 
 
 		 306 aa  590  1e-168  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.407825 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0022  transcriptional regulator, XRE family  59.21 
 
 		 298 aa  334  1e-90  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.55201  normal  0.925385 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2715  transcriptional regulator, XRE family  58.31 
 
 		 299 aa  329  3e-89  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.603714  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1469  Phosphomethylpyrimidine kinase  59.09 
 
 		 299 aa  320  1.9999999999999998e-86  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2413  transcriptional regulator, XRE family  57.47 
 
 		 299 aa  318  5e-86  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2542  transcriptional regulator, XRE family  44.22 
 
 		 307 aa  205  9e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0434  transcriptional regulator, XRE family  42.11 
 
 		 309 aa  200  1.9999999999999998e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.463605  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2411  HTH DNA-binding protein  40.33 
 
 		 307 aa  195  7e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0357343  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1352  HTH DNA-binding protein  41.06 
 
 		 306 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.111494 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1034  hypothetical protein  26.8 
 
 		 323 aa  88.6  1e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00255835 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1448  Phosphomethylpyrimidine kinase  25.5 
 
 		 314 aa  84  0.000000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00994121  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0069  phosphomethylpyrimidine kinase  27.92 
 
 		 320 aa  82.4  0.000000000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.844231  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0839  hypothetical protein  24.92 
 
 		 290 aa  80.9  0.00000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.660796  normal  0.142658 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2166  hypothetical protein  26.4 
 
 		 304 aa  79  0.00000000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00217357 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0460  phosphomethylpyrimidine kinase  29.35 
 
 		 429 aa  77.4  0.0000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2182  phosphomethylpyrimidine kinase  32.39 
 
 		 456 aa  75.9  0.0000000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1881  phosphomethylpyrimidine kinase  33.71 
 
 		 444 aa  75.5  0.000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.000178657  normal  0.46671 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0697  AIR synthase related protein-like  47.95 
 
 		 528 aa  74.7  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000561591  hitchhiker  0.000000203748 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1419  phosphomethylpyrimidine kinase  31.22 
 
 		 450 aa  74.7  0.000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.528826 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3501  hydroxymethylpyrimidine kinase  32.2 
 
 		 448 aa  74.3  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.604187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0828  phosphomethylpyrimidine kinase  32.79 
 
 		 452 aa  72  0.00000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1460  phosphomethylpyrimidine kinase  35.33 
 
 		 182 aa  70.9  0.00000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1384  hypothetical protein  25.08 
 
 		 289 aa  69.3  0.00000000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0839  phosphomethylpyrimidine kinase  43.68 
 
 		 449 aa  68.2  0.0000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.218839 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0564  hypothetical protein  34.69 
 
 		 179 aa  66.2  0.0000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1029  AIR synthase-like protein  33.55 
 
 		 465 aa  65.1  0.000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0402037  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0941  hypothetical protein  26.16 
 
 		 290 aa  64.7  0.000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0240  phosphomethylpyrimidine kinase  40 
 
 		 449 aa  60.1  0.00000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.180045 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0944  phosphomethylpyrimidine kinase  24.2 
 
 		 435 aa  59.3  0.00000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1934  hypothetical protein  22.85 
 
 		 289 aa  59.3  0.00000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0919  phosphomethylpyrimidine kinase  50.88 
 
 		 127 aa  58.5  0.0000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1221  hypothetical protein  28.85 
 
 		 193 aa  58.2  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0930619 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3238  hypothetical protein  28.24 
 
 		 199 aa  55.8  0.0000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.112934  normal  0.19984 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0542  phosphomethylpyrimidine kinase  21.76 
 
 		 432 aa  53.5  0.000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1282  phosphomethylpyrimidine kinase  37.01 
 
 		 461 aa  53.5  0.000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1022  Phosphomethylpyrimidine kinase  32.08 
 
 		 190 aa  52.8  0.000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0262  hypothetical protein  33.33 
 
 		 107 aa  52  0.00001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.233822 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2988  phosphomethylpyrimidine kinase  35.26 
 
 		 461 aa  52.4  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1419  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  31.11 
 
 		 411 aa  51.2  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0176  hypothetical protein  25 
 
 		 119 aa  50.8  0.00003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3232  phosphomethylpyrimidine kinase  34.01 
 
 		 453 aa  50.4  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1213  hypothetical protein  36.67 
 
 		 107 aa  48.9  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.735424 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0090  helix-turn-helix domain-containing protein  39.56 
 
 		 116 aa  48.9  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.592947  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1311  hypothetical protein  35.14 
 
 		 78 aa  48.1  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.174745  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0484  XRE family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 116 aa  48.1  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0491  phosphomethylpyrimidine kinase  34.69 
 
 		 446 aa  47.4  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0290  hypothetical protein  33.33 
 
 		 107 aa  47.4  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1594  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  24.88 
 
 		 399 aa  46.6  0.0006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0200  phosphomethylpyrimidine kinase  25.83 
 
 		 444 aa  46.2  0.0007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.619111  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2423  hypothetical protein  34.78 
 
 		 134 aa  45.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0429086 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2998  hypothetical protein  32.26 
 
 		 102 aa  45.1  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0646  phosphomethylpyrimidine kinase  30.68 
 
 		 445 aa  44.3  0.003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0762615  normal  0.306983 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2048  hypothetical protein  44.9 
 
 		 119 aa  43.1  0.006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000000899924  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0934  hypothetical protein  22.64 
 
 		 138 aa  42.7  0.008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.244199 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1910  conserved hypothetical protein  34.72 
 
 		 122 aa  42.7  0.009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>