22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0941 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0941  hypothetical protein  100 
 
 		 290 aa  589  1e-167  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1384  hypothetical protein  66.09 
 
 		 289 aa  423  1e-117  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0839  hypothetical protein  64.83 
 
 		 290 aa  421  1e-117  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.660796  normal  0.142658 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1934  hypothetical protein  65.05 
 
 		 289 aa  394  1e-108  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1448  Phosphomethylpyrimidine kinase  32.43 
 
 		 314 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00994121  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2166  hypothetical protein  30.74 
 
 		 304 aa  135  9e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00217357 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1034  hypothetical protein  36.09 
 
 		 323 aa  125  8.000000000000001e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00255835 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2413  transcriptional regulator, XRE family  28.05 
 
 		 299 aa  89  8e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1469  Phosphomethylpyrimidine kinase  29.67 
 
 		 299 aa  86.7  5e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0022  transcriptional regulator, XRE family  29.7 
 
 		 298 aa  85.9  7e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.55201  normal  0.925385 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2411  HTH DNA-binding protein  27.36 
 
 		 307 aa  85.9  8e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0357343  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2715  transcriptional regulator, XRE family  27.67 
 
 		 299 aa  85.1  0.000000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.603714  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2542  transcriptional regulator, XRE family  29.32 
 
 		 307 aa  84.7  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0434  transcriptional regulator, XRE family  28.06 
 
 		 309 aa  83.2  0.000000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.463605  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0069  phosphomethylpyrimidine kinase  27 
 
 		 320 aa  71.2  0.00000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.844231  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1352  HTH DNA-binding protein  25.16 
 
 		 306 aa  69.3  0.00000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.111494 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0446  DNA binding protein  26.16 
 
 		 306 aa  67.4  0.0000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.407825 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1460  phosphomethylpyrimidine kinase  29.94 
 
 		 182 aa  50.4  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1221  hypothetical protein  25.27 
 
 		 193 aa  50.8  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0930619 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0176  hypothetical protein  40.38 
 
 		 119 aa  47.4  0.0003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3238  hypothetical protein  24.87 
 
 		 199 aa  45.4  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.112934  normal  0.19984 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1410  transcriptional regulator-like protein  31.71 
 
 		 116 aa  43.1  0.006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000126907  hitchhiker  0.000639527 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>