71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2542 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_2542  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 307 aa  605  9.999999999999999e-173  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0434  transcriptional regulator, XRE family  80.66 
 
 		 309 aa  501  1e-141  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.463605  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2411  HTH DNA-binding protein  61.79 
 
 		 307 aa  362  3e-99  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0357343  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1352  HTH DNA-binding protein  63.16 
 
 		 306 aa  358  6e-98  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.111494 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0446  DNA binding protein  44.22 
 
 		 306 aa  205  9e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.407825 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0022  transcriptional regulator, XRE family  39.52 
 
 		 298 aa  192  6e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.55201  normal  0.925385 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2715  transcriptional regulator, XRE family  38.38 
 
 		 299 aa  188  8e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.603714  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2413  transcriptional regulator, XRE family  38.18 
 
 		 299 aa  185  8e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1469  Phosphomethylpyrimidine kinase  39.46 
 
 		 299 aa  182  8.000000000000001e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1034  hypothetical protein  32.36 
 
 		 323 aa  132  7.999999999999999e-30  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00255835 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0069  phosphomethylpyrimidine kinase  30.32 
 
 		 320 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.844231  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1448  Phosphomethylpyrimidine kinase  29.18 
 
 		 314 aa  110  3e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00994121  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0828  phosphomethylpyrimidine kinase  40.52 
 
 		 452 aa  104  1e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2166  hypothetical protein  26.3 
 
 		 304 aa  95.9  7e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00217357 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1460  phosphomethylpyrimidine kinase  37.01 
 
 		 182 aa  91.3  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3501  hydroxymethylpyrimidine kinase  34.1 
 
 		 448 aa  89.4  8e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.604187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2182  phosphomethylpyrimidine kinase  33.33 
 
 		 456 aa  89  1e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0564  hypothetical protein  30.51 
 
 		 179 aa  80.9  0.00000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1419  phosphomethylpyrimidine kinase  35.19 
 
 		 450 aa  80.9  0.00000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.528826 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1881  phosphomethylpyrimidine kinase  35.8 
 
 		 444 aa  80.1  0.00000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.000178657  normal  0.46671 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0839  hypothetical protein  26.25 
 
 		 290 aa  79.7  0.00000000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.660796  normal  0.142658 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0941  hypothetical protein  28.05 
 
 		 290 aa  79  0.00000000000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1934  hypothetical protein  27.36 
 
 		 289 aa  71.6  0.00000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0240  phosphomethylpyrimidine kinase  32.72 
 
 		 449 aa  71.6  0.00000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.180045 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1384  hypothetical protein  27.24 
 
 		 289 aa  70.5  0.00000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0542  phosphomethylpyrimidine kinase  22.03 
 
 		 432 aa  70.5  0.00000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1419  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  24.43 
 
 		 411 aa  69.7  0.00000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0176  hypothetical protein  30.25 
 
 		 119 aa  68.9  0.0000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0697  AIR synthase related protein-like  27.67 
 
 		 528 aa  68.2  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000561591  hitchhiker  0.000000203748 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1221  hypothetical protein  28.99 
 
 		 193 aa  67  0.0000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0930619 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1594  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  25.53 
 
 		 399 aa  64.7  0.000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0139  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  28.03 
 
 		 398 aa  63.5  0.000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0919  phosphomethylpyrimidine kinase  34.71 
 
 		 127 aa  63.5  0.000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3238  hypothetical protein  25.53 
 
 		 199 aa  62.8  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.112934  normal  0.19984 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2988  phosphomethylpyrimidine kinase  35.48 
 
 		 461 aa  62.8  0.000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0137  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  28.03 
 
 		 398 aa  62.4  0.000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0934  hypothetical protein  31.53 
 
 		 138 aa  60.5  0.00000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.244199 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3232  phosphomethylpyrimidine kinase  33.57 
 
 		 453 aa  60.5  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0460  phosphomethylpyrimidine kinase  26.63 
 
 		 429 aa  60.1  0.00000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0944  phosphomethylpyrimidine kinase  24.07 
 
 		 435 aa  58.5  0.0000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0484  XRE family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 116 aa  57.8  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0839  phosphomethylpyrimidine kinase  30.49 
 
 		 449 aa  58.5  0.0000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.218839 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2046  transcriptional regulator, fis family  40 
 
 		 117 aa  57.4  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.03951  normal  0.243031 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1282  phosphomethylpyrimidine kinase  40 
 
 		 461 aa  54.7  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0397  transcriptional regulator, Fis family  48.15 
 
 		 110 aa  54.7  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0200714  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0295  transcriptional regulator-like  47.27 
 
 		 126 aa  53.9  0.000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1846  transcriptional regulator, fis family  35.58 
 
 		 109 aa  53.9  0.000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2036  Fis family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 109 aa  53.1  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.494843  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0090  helix-turn-helix domain-containing protein  31.91 
 
 		 116 aa  52.8  0.000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.592947  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1213  hypothetical protein  35 
 
 		 107 aa  52.4  0.000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.735424 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1022  Phosphomethylpyrimidine kinase  27.62 
 
 		 190 aa  52.4  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1029  AIR synthase-like protein  26.85 
 
 		 465 aa  52  0.00001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0402037  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2388  transcriptional regulator, XRE family  46.3 
 
 		 106 aa  51.2  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.673915  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0290  hypothetical protein  30.19 
 
 		 107 aa  50.8  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1311  hypothetical protein  35.14 
 
 		 78 aa  50.4  0.00004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.174745  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2048  hypothetical protein  39.73 
 
 		 119 aa  49.3  0.00008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000000899924  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0237  hypothetical protein  35.86 
 
 		 237 aa  49.3  0.00009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.211231 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0770  hypothetical protein  50 
 
 		 234 aa  49.3  0.00009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0491  phosphomethylpyrimidine kinase  36.84 
 
 		 446 aa  48.9  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2423  hypothetical protein  29.59 
 
 		 134 aa  48.5  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0429086 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1314  hypothetical protein  34.48 
 
 		 231 aa  48.1  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0533  hypothetical protein  29 
 
 		 121 aa  48.1  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2449  Fis family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 105 aa  47.8  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0359  hypothetical protein  46.3 
 
 		 108 aa  47.4  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.114666  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2596  fis family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 114 aa  47.4  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0262  hypothetical protein  26.8 
 
 		 107 aa  46.2  0.0007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.233822 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1910  conserved hypothetical protein  37.7 
 
 		 122 aa  45.8  0.0008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0204  hypothetical protein  46.81 
 
 		 230 aa  45.1  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.803129 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0646  phosphomethylpyrimidine kinase  25.48 
 
 		 445 aa  45.4  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0762615  normal  0.306983 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2998  hypothetical protein  31.31 
 
 		 102 aa  44.7  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2124  hypothetical protein  31.17 
 
 		 115 aa  42.4  0.01  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>