44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1221 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1221  hypothetical protein  100 
 
 		 193 aa  392  1e-108  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0930619 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3238  hypothetical protein  51.32 
 
 		 199 aa  215  2.9999999999999998e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.112934  normal  0.19984 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0240  phosphomethylpyrimidine kinase  38.67 
 
 		 449 aa  111  7.000000000000001e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.180045 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1419  phosphomethylpyrimidine kinase  39.76 
 
 		 450 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.528826 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1881  phosphomethylpyrimidine kinase  38.55 
 
 		 444 aa  105  5e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.000178657  normal  0.46671 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0839  phosphomethylpyrimidine kinase  35.98 
 
 		 449 aa  99  4e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.218839 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1460  phosphomethylpyrimidine kinase  32.98 
 
 		 182 aa  98.2  7e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0564  hypothetical protein  34.88 
 
 		 179 aa  96.7  2e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2182  phosphomethylpyrimidine kinase  34.44 
 
 		 456 aa  94  1e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3501  hydroxymethylpyrimidine kinase  35.8 
 
 		 448 aa  85.5  5e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.604187  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1448  Phosphomethylpyrimidine kinase  29.61 
 
 		 314 aa  84.3  0.000000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00994121  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1311  hypothetical protein  51.35 
 
 		 78 aa  80.1  0.00000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.174745  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0828  phosphomethylpyrimidine kinase  33.91 
 
 		 452 aa  79  0.00000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0460  phosphomethylpyrimidine kinase  29.47 
 
 		 429 aa  77.8  0.00000000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1282  phosphomethylpyrimidine kinase  33.14 
 
 		 461 aa  77  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1022  Phosphomethylpyrimidine kinase  31.29 
 
 		 190 aa  75.5  0.0000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0542  phosphomethylpyrimidine kinase  23.78 
 
 		 432 aa  75.5  0.0000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2166  hypothetical protein  30.49 
 
 		 304 aa  75.5  0.0000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00217357 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1594  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  31.65 
 
 		 399 aa  73.6  0.000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3232  phosphomethylpyrimidine kinase  31.52 
 
 		 453 aa  72.4  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0919  phosphomethylpyrimidine kinase  32.52 
 
 		 127 aa  69.3  0.00000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2988  phosphomethylpyrimidine kinase  34.97 
 
 		 461 aa  69.3  0.00000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1034  hypothetical protein  27.89 
 
 		 323 aa  69.3  0.00000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00255835 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0944  phosphomethylpyrimidine kinase  28 
 
 		 435 aa  69.3  0.00000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1419  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  29.24 
 
 		 411 aa  68.9  0.00000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2542  transcriptional regulator, XRE family  28.99 
 
 		 307 aa  67  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2411  HTH DNA-binding protein  29.76 
 
 		 307 aa  64.3  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0357343  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2715  transcriptional regulator, XRE family  29.65 
 
 		 299 aa  62.4  0.000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.603714  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0137  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  29.38 
 
 		 398 aa  62.4  0.000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0434  transcriptional regulator, XRE family  28.25 
 
 		 309 aa  62  0.000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.463605  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0139  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  29.38 
 
 		 398 aa  61.6  0.000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1312  hypothetical protein  42.22 
 
 		 105 aa  60.5  0.00000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.406593  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2413  transcriptional regulator, XRE family  29.34 
 
 		 299 aa  58.9  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0446  DNA binding protein  28.85 
 
 		 306 aa  58.2  0.00000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.407825 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1029  AIR synthase-like protein  29.75 
 
 		 465 aa  58.2  0.00000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0402037  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0022  transcriptional regulator, XRE family  28.65 
 
 		 298 aa  57.4  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.55201  normal  0.925385 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0697  AIR synthase related protein-like  28.07 
 
 		 528 aa  56.2  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000561591  hitchhiker  0.000000203748 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1469  Phosphomethylpyrimidine kinase  29.94 
 
 		 299 aa  54.7  0.0000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1352  HTH DNA-binding protein  27.22 
 
 		 306 aa  53.1  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.111494 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0491  phosphomethylpyrimidine kinase  29.75 
 
 		 446 aa  51.6  0.000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0941  hypothetical protein  25.27 
 
 		 290 aa  51.2  0.00001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0646  phosphomethylpyrimidine kinase  25.86 
 
 		 445 aa  43.9  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0762615  normal  0.306983 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0069  phosphomethylpyrimidine kinase  37.14 
 
 		 320 aa  43.5  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.844231  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0839  hypothetical protein  22.65 
 
 		 290 aa  41.2  0.01  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.660796  normal  0.142658 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>