41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0919 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_0919  phosphomethylpyrimidine kinase  100 
 
 
127 aa  255  1e-67  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0240  phosphomethylpyrimidine kinase  76.23 
 
 
449 aa  196  1.0000000000000001e-49  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.180045 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1881  phosphomethylpyrimidine kinase  71.31 
 
 
444 aa  192  1e-48  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.000178657  normal  0.46671 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1419  phosphomethylpyrimidine kinase  70.49 
 
 
450 aa  191  3e-48  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.528826 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0839  phosphomethylpyrimidine kinase  68.85 
 
 
449 aa  173  7e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.218839 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0564  hypothetical protein  43.8 
 
 
179 aa  93.2  1e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3501  hydroxymethylpyrimidine kinase  44.26 
 
 
448 aa  93.2  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.604187  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1022  Phosphomethylpyrimidine kinase  40.34 
 
 
190 aa  91.7  3e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0828  phosphomethylpyrimidine kinase  43.44 
 
 
452 aa  86.7  1e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0137  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  38.14 
 
 
398 aa  85.5  3e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1419  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  36.89 
 
 
411 aa  84.3  4e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1594  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  37.4 
 
 
399 aa  84.3  5e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0139  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  37.29 
 
 
398 aa  84  7e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2182  phosphomethylpyrimidine kinase  38.52 
 
 
456 aa  82.8  0.000000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1460  phosphomethylpyrimidine kinase  38.02 
 
 
182 aa  79  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3232  phosphomethylpyrimidine kinase  36.97 
 
 
453 aa  75.1  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2988  phosphomethylpyrimidine kinase  41.67 
 
 
461 aa  74.7  0.0000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0460  phosphomethylpyrimidine kinase  39.2 
 
 
429 aa  70.1  0.000000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1221  hypothetical protein  32.52 
 
 
193 aa  69.3  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0930619 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0646  phosphomethylpyrimidine kinase  35.59 
 
 
445 aa  68.2  0.00000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0762615  normal  0.306983 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2411  HTH DNA-binding protein  37.19 
 
 
307 aa  67.8  0.00000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0357343  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0944  phosphomethylpyrimidine kinase  32.59 
 
 
435 aa  67.4  0.00000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0542  phosphomethylpyrimidine kinase  32.5 
 
 
432 aa  66.6  0.0000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3238  hypothetical protein  34.68 
 
 
199 aa  64.3  0.0000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.112934  normal  0.19984 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1282  phosphomethylpyrimidine kinase  32.54 
 
 
461 aa  63.2  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0434  transcriptional regulator, XRE family  35.25 
 
 
309 aa  62.8  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.463605  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2542  transcriptional regulator, XRE family  34.71 
 
 
307 aa  63.5  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1034  hypothetical protein  32.8 
 
 
323 aa  58.9  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00255835 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0446  DNA binding protein  50.88 
 
 
306 aa  58.5  0.00000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.407825 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2715  transcriptional regulator, XRE family  44.44 
 
 
299 aa  57  0.00000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.603714  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0200  phosphomethylpyrimidine kinase  32.2 
 
 
444 aa  55.8  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.619111  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1469  Phosphomethylpyrimidine kinase  32.2 
 
 
299 aa  55.1  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0022  transcriptional regulator, XRE family  35.53 
 
 
298 aa  52.4  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.55201  normal  0.925385 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0491  phosphomethylpyrimidine kinase  30.83 
 
 
446 aa  51.6  0.000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1448  Phosphomethylpyrimidine kinase  39.34 
 
 
314 aa  50.1  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00994121  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2413  transcriptional regulator, XRE family  28.93 
 
 
299 aa  48.5  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2166  hypothetical protein  30.25 
 
 
304 aa  45.8  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.00217357 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1352  HTH DNA-binding protein  31.15 
 
 
306 aa  45.8  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.111494 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0697  AIR synthase related protein-like  31.82 
 
 
528 aa  45.1  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000561591  hitchhiker  0.000000203748 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1029  AIR synthase-like protein  33.85 
 
 
465 aa  43.1  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0402037  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1394  hypothetical protein  27.64 
 
 
185 aa  40  0.01  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.361977  normal  0.191695 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>