25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1394 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_1394  hypothetical protein  100 
 
 
185 aa  374  1e-103  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.361977  normal  0.191695 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1460  phosphomethylpyrimidine kinase  41.67 
 
 
182 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1490  hypothetical protein  33.52 
 
 
182 aa  94.7  6e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0478  hypothetical protein  44.63 
 
 
173 aa  92.8  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.97578  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1227  hypothetical protein  33.14 
 
 
170 aa  84  0.000000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.908108  normal  0.984444 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0828  phosphomethylpyrimidine kinase  35.56 
 
 
452 aa  80.9  0.00000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3501  hydroxymethylpyrimidine kinase  32.22 
 
 
448 aa  75.1  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.604187  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0564  hypothetical protein  29.44 
 
 
179 aa  75.1  0.0000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0460  phosphomethylpyrimidine kinase  25.27 
 
 
429 aa  62.4  0.000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2182  phosphomethylpyrimidine kinase  29.93 
 
 
456 aa  61.6  0.000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0240  phosphomethylpyrimidine kinase  31.13 
 
 
449 aa  58.2  0.00000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.180045 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1419  phosphomethylpyrimidine kinase  30.46 
 
 
450 aa  57.4  0.0000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.528826 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1034  hypothetical protein  27.01 
 
 
323 aa  56.2  0.0000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00255835 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1881  phosphomethylpyrimidine kinase  31.13 
 
 
444 aa  57  0.0000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.000178657  normal  0.46671 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1022  Phosphomethylpyrimidine kinase  27.91 
 
 
190 aa  55.5  0.0000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0542  phosphomethylpyrimidine kinase  23.08 
 
 
432 aa  54.7  0.0000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0839  phosphomethylpyrimidine kinase  27.15 
 
 
449 aa  49.3  0.00003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.218839 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0919  phosphomethylpyrimidine kinase  27.64 
 
 
127 aa  49.3  0.00003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1594  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  23.33 
 
 
399 aa  47.8  0.00009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1221  hypothetical protein  24.86 
 
 
193 aa  47  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0930619 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1419  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  23.13 
 
 
411 aa  46.2  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3232  phosphomethylpyrimidine kinase  26.96 
 
 
453 aa  45.4  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2166  hypothetical protein  25.35 
 
 
304 aa  45.1  0.0006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.00217357 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0364  phosphomethylpyrimidine kinase  30.07 
 
 
437 aa  43.5  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.422328  normal  0.381325 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2988  phosphomethylpyrimidine kinase  36.36 
 
 
461 aa  42  0.006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>