185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1594 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_1594  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  100 
 
 		 399 aa  812    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0137  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  52.41 
 
 		 398 aa  437  1e-121  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0139  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  52.15 
 
 		 398 aa  436  1e-121  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1419  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  46.9 
 
 		 411 aa  385  1e-106  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0240  phosphomethylpyrimidine kinase  28.76 
 
 		 449 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.180045 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1419  phosphomethylpyrimidine kinase  28.51 
 
 		 450 aa  152  1e-35  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.528826 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1881  phosphomethylpyrimidine kinase  28.25 
 
 		 444 aa  151  2e-35  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.000178657  normal  0.46671 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0542  phosphomethylpyrimidine kinase  29.11 
 
 		 432 aa  146  6e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0839  phosphomethylpyrimidine kinase  26.74 
 
 		 449 aa  142  9e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.218839 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0460  phosphomethylpyrimidine kinase  28.1 
 
 		 429 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0828  phosphomethylpyrimidine kinase  25.67 
 
 		 452 aa  125  2e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0200  phosphomethylpyrimidine kinase  28.92 
 
 		 444 aa  122  9e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.619111  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2182  phosphomethylpyrimidine kinase  25.99 
 
 		 456 aa  110  6e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0944  phosphomethylpyrimidine kinase  26 
 
 		 435 aa  108  1e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3232  phosphomethylpyrimidine kinase  23.4 
 
 		 453 aa  103  6e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0646  phosphomethylpyrimidine kinase  24.65 
 
 		 445 aa  102  1e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0762615  normal  0.306983 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1460  phosphomethylpyrimidine kinase  37.33 
 
 		 182 aa  101  2e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3501  hydroxymethylpyrimidine kinase  23.83 
 
 		 448 aa  94.4  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.604187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0564  hypothetical protein  30.39 
 
 		 179 aa  88.2  3e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0919  phosphomethylpyrimidine kinase  37.4 
 
 		 127 aa  84.3  0.000000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1282  phosphomethylpyrimidine kinase  21.36 
 
 		 461 aa  84.3  0.000000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0381  phosphomethylpyrimidine kinase  29.3 
 
 		 259 aa  81.6  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1022  Phosphomethylpyrimidine kinase  32.26 
 
 		 190 aa  80.5  0.00000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2988  phosphomethylpyrimidine kinase  24.54 
 
 		 461 aa  79  0.0000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0912  phosphomethylpyrimidine kinase  22.62 
 
 		 394 aa  79.3  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.84137 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2592  phosphomethylpyrimidine kinase  27.56 
 
 		 254 aa  74.3  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2109  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  27.15 
 
 		 647 aa  73.9  0.000000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.671125 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1221  hypothetical protein  31.65 
 
 		 193 aa  73.6  0.000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0930619 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1448  Phosphomethylpyrimidine kinase  35.06 
 
 		 314 aa  72.4  0.00000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00994121  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0697  AIR synthase related protein-like  30 
 
 		 528 aa  72.4  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000561591  hitchhiker  0.000000203748 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1769  phosphomethylpyrimidine kinase  22.35 
 
 		 396 aa  72.4  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0611594  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1601  phosphomethylpyrimidine kinase  25.85 
 
 		 251 aa  71.6  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0491  phosphomethylpyrimidine kinase  22.41 
 
 		 446 aa  70.1  0.00000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0241  phosphomethylpyrimidine kinase  25.51 
 
 		 249 aa  70.1  0.00000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.801075 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0192  phosphomethylpyrimidine kinase  28.03 
 
 		 269 aa  70.1  0.00000000007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2166  hypothetical protein  32.03 
 
 		 304 aa  68.9  0.0000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00217357 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1153  phosphomethylpyrimidine kinase  27.05 
 
 		 272 aa  67.8  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0935315  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0969  phosphomethylpyrimidine kinase  26.86 
 
 		 263 aa  67.8  0.0000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.922433  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2522  phosphomethylpyrimidine kinase  26.91 
 
 		 262 aa  65.9  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2468  Phosphomethylpyrimidine kinase  27.73 
 
 		 268 aa  66.2  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.946237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2130  phosphomethylpyrimidine kinase  28.81 
 
 		 276 aa  66.2  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00414672  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2168  phosphomethylpyrimidine kinase  28.81 
 
 		 276 aa  66.2  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0225656  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2419  Phosphomethylpyrimidine kinase  25.48 
 
 		 269 aa  65.9  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.795296  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0167  phosphomethylpyrimidine kinase  23.36 
 
 		 264 aa  64.7  0.000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00133155  hitchhiker  0.000172032 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1032  phosphomethylpyrimidine kinase  23.26 
 
 		 394 aa  65.5  0.000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2542  transcriptional regulator, XRE family  25.53 
 
 		 307 aa  64.7  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0434  transcriptional regulator, XRE family  27.27 
 
 		 309 aa  64.3  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.463605  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1513  Phosphomethylpyrimidine kinase  26.23 
 
 		 285 aa  63.5  0.000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0466134  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0179  putative phosphomethylpyrimidine kinase  24.59 
 
 		 264 aa  63.2  0.000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00139306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0623  Phosphomethylpyrimidine kinase  25.46 
 
 		 255 aa  63.2  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1338  phosphomethylpyrimidine kinase  29.49 
 
 		 264 aa  63.2  0.000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00019728  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3238  hypothetical protein  27.22 
 
 		 199 aa  62.4  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.112934  normal  0.19984 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1545  phosphomethylpyrimidine kinase  26.78 
 
 		 264 aa  62.8  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.104036  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0095  Phosphomethylpyrimidine kinase  22.58 
 
 		 253 aa  62  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000458496  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1124  phosphomethylpyrimidine kinase  26.92 
 
 		 270 aa  61.6  0.00000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0071  phosphomethylpyrimidine kinase  26.69 
 
 		 267 aa  61.2  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1176  phosphomethylpyrimidine kinase  27.27 
 
 		 267 aa  60.8  0.00000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.82174  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03000  hydroxymethylpyrimidine kinase/phosphomethylpyrimidine kinase  24.19 
 
 		 265 aa  60.5  0.00000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2517  phosphomethylpyrimidine kinase  24.9 
 
 		 260 aa  59.7  0.00000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1662  Phosphomethylpyrimidine kinase  25 
 
 		 263 aa  59.3  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3772  phosphomethylpyrimidine kinase  23.81 
 
 		 265 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0714273 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1700  phosphomethylpyrimidine kinase  25.31 
 
 		 273 aa  58.5  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.847021  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3018  phosphomethylpyrimidine kinase  24.89 
 
 		 270 aa  58.9  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1311  Phosphomethylpyrimidine kinase  24.88 
 
 		 242 aa  58.9  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.275611  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1397  phosphomethylpyrimidine kinase  26.29 
 
 		 265 aa  58.2  0.0000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000385147  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1992  phosphomethylpyrimidine kinase  25.82 
 
 		 270 aa  58.2  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0083  phosphomethylpyrimidine kinase  22.09 
 
 		 252 aa  57.8  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.165626  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0361  phosphomethylpyrimidine kinase  24.59 
 
 		 262 aa  57.4  0.0000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000143367  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0254  phosphomethylpyrimidine kinase/thiamin-phosphate pyrophosphorylase  24.69 
 
 		 529 aa  57  0.0000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0639  phosphomethylpyrimidine kinase  25.9 
 
 		 290 aa  57  0.0000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.784703  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0918  phosphomethylpyrimidine kinase  24.71 
 
 		 269 aa  56.6  0.0000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1225  phosphomethylpyrimidine kinase  25.32 
 
 		 270 aa  56.6  0.0000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0452  phosphomethylpyrimidine kinase  24.3 
 
 		 436 aa  56.6  0.0000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.70912 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1140  phosphomethylpyrimidine kinase  22.08 
 
 		 257 aa  56.6  0.0000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.837771 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4782  phosphomethylpyrimidine kinase  25.11 
 
 		 265 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.291324  normal  0.0384059 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0638  phosphomethylpyrimidine kinase  22.66 
 
 		 274 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0641  phosphomethylpyrimidine kinase  24.89 
 
 		 270 aa  56.2  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.328033  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09330  phosphomethylpyrimidine kinase  23.58 
 
 		 264 aa  55.1  0.000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.387333 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0688  phosphomethylpyrimidine kinase  21.12 
 
 		 253 aa  55.1  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1100  phosphomethylpyrimidine kinase  24.89 
 
 		 270 aa  55.1  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4658  phosphomethylpyrimidine kinase  25.11 
 
 		 265 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.46443  normal  0.665926 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1498  phosphomethylpyrimidine kinase  25.2 
 
 		 257 aa  55.1  0.000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.315358  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4798  phosphomethylpyrimidine kinase, putative  23.9 
 
 		 265 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.452059  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0914  phosphomethylpyrimidine kinase  25.13 
 
 		 269 aa  54.7  0.000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1034  hypothetical protein  24.84 
 
 		 323 aa  54.7  0.000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00255835 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3401  phosphomethylpyrimidine kinase  22.03 
 
 		 270 aa  54.3  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0125  phosphomethylpyrimidine kinase  21.86 
 
 		 285 aa  54.7  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.713324 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0649  phosphomethylpyrimidine kinase  23.79 
 
 		 267 aa  53.9  0.000005  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0890915  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12410  phosphomethylpyrimidine kinase  22.82 
 
 		 265 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1526  hypothetical protein  26.07 
 
 		 488 aa  53.5  0.000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1443  phosphomethylpyrimidine kinase  24.19 
 
 		 269 aa  53.5  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.600581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0014  phosphomethylpyrimidine kinase  23.81 
 
 		 260 aa  53.5  0.000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0011  phosphomethylpyrimidine kinase superfamily protein  24.58 
 
 		 244 aa  53.5  0.000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0399  phosphomethylpyrimidine kinase  23.51 
 
 		 254 aa  53.5  0.000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4836  phosphomethylpyrimidine kinase  22.87 
 
 		 265 aa  53.1  0.000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4945  phosphomethylpyrimidine kinase  21.6 
 
 		 265 aa  53.1  0.000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.505455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2411  HTH DNA-binding protein  25.85 
 
 		 307 aa  53.1  0.000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0357343  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1133  phosphomethylpyrimidine kinase  23.24 
 
 		 271 aa  53.1  0.000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00145  Thiamine monophosphate synthase  23.14 
 
 		 526 aa  52.8  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1606  phosphomethylpyrimidine kinase / thiamine-phosphate pyrophosphorylase  23.91 
 
 		 532 aa  52.8  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.41103  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>