43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3238 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3238  hypothetical protein  100 
 
 		 199 aa  404  1.0000000000000001e-112  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.112934  normal  0.19984 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1221  hypothetical protein  51.32 
 
 		 193 aa  215  2.9999999999999998e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0930619 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1881  phosphomethylpyrimidine kinase  41.48 
 
 		 444 aa  111  8.000000000000001e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.000178657  normal  0.46671 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1419  phosphomethylpyrimidine kinase  39.77 
 
 		 450 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.528826 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0240  phosphomethylpyrimidine kinase  38.46 
 
 		 449 aa  101  7e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.180045 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0839  phosphomethylpyrimidine kinase  34.04 
 
 		 449 aa  100  1e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.218839 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2182  phosphomethylpyrimidine kinase  30.81 
 
 		 456 aa  86.7  2e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0542  phosphomethylpyrimidine kinase  33.54 
 
 		 432 aa  84  0.000000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0564  hypothetical protein  35.4 
 
 		 179 aa  82.4  0.000000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1022  Phosphomethylpyrimidine kinase  34.36 
 
 		 190 aa  80.5  0.00000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1460  phosphomethylpyrimidine kinase  33.12 
 
 		 182 aa  80.5  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3501  hydroxymethylpyrimidine kinase  33.73 
 
 		 448 aa  80.1  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.604187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1034  hypothetical protein  33.53 
 
 		 323 aa  75.5  0.0000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00255835 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1282  phosphomethylpyrimidine kinase  30.41 
 
 		 461 aa  75.1  0.0000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0828  phosphomethylpyrimidine kinase  30.48 
 
 		 452 aa  74.7  0.0000000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1448  Phosphomethylpyrimidine kinase  28.73 
 
 		 314 aa  73.9  0.000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00994121  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2166  hypothetical protein  30 
 
 		 304 aa  74.3  0.000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00217357 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1311  hypothetical protein  48 
 
 		 78 aa  73.2  0.000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.174745  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2988  phosphomethylpyrimidine kinase  30.91 
 
 		 461 aa  67.4  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1419  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  26.82 
 
 		 411 aa  67.8  0.0000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0646  phosphomethylpyrimidine kinase  31.67 
 
 		 445 aa  67  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0762615  normal  0.306983 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0919  phosphomethylpyrimidine kinase  34.68 
 
 		 127 aa  64.3  0.000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0137  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  26.88 
 
 		 398 aa  63.9  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0139  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  26.88 
 
 		 398 aa  63.5  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1312  hypothetical protein  39.56 
 
 		 105 aa  63.2  0.000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.406593  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2542  transcriptional regulator, XRE family  25.53 
 
 		 307 aa  62.8  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1594  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  27.22 
 
 		 399 aa  62.4  0.000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0022  transcriptional regulator, XRE family  27.27 
 
 		 298 aa  61.6  0.000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.55201  normal  0.925385 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3232  phosphomethylpyrimidine kinase  26.99 
 
 		 453 aa  60.1  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1029  AIR synthase-like protein  27.92 
 
 		 465 aa  57.4  0.0000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0402037  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2413  transcriptional regulator, XRE family  27.42 
 
 		 299 aa  56.6  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2411  HTH DNA-binding protein  27.81 
 
 		 307 aa  56.2  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0357343  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2715  transcriptional regulator, XRE family  26.74 
 
 		 299 aa  56.2  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.603714  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0446  DNA binding protein  28.24 
 
 		 306 aa  55.8  0.0000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.407825 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0460  phosphomethylpyrimidine kinase  26.9 
 
 		 429 aa  55.1  0.0000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0434  transcriptional regulator, XRE family  25.29 
 
 		 309 aa  54.3  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.463605  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0491  phosphomethylpyrimidine kinase  28.03 
 
 		 446 aa  52  0.000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0200  phosphomethylpyrimidine kinase  25.42 
 
 		 444 aa  51.2  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.619111  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0944  phosphomethylpyrimidine kinase  22.09 
 
 		 435 aa  50.1  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1469  Phosphomethylpyrimidine kinase  27.96 
 
 		 299 aa  48.1  0.00009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1352  HTH DNA-binding protein  28.93 
 
 		 306 aa  47.4  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.111494 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0941  hypothetical protein  24.87 
 
 		 290 aa  45.8  0.0004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0697  AIR synthase related protein-like  29.49 
 
 		 528 aa  45.8  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000561591  hitchhiker  0.000000203748 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>