63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1352 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1352  HTH DNA-binding protein  100 
 
 		 306 aa  596  1e-169  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.111494 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2542  transcriptional regulator, XRE family  63.16 
 
 		 307 aa  375  1e-103  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0434  transcriptional regulator, XRE family  63.49 
 
 		 309 aa  374  1e-102  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.463605  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2411  HTH DNA-binding protein  61.33 
 
 		 307 aa  368  1e-101  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0357343  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2413  transcriptional regulator, XRE family  42.12 
 
 		 299 aa  191  1e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0022  transcriptional regulator, XRE family  39.8 
 
 		 298 aa  187  2e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.55201  normal  0.925385 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0446  DNA binding protein  41.31 
 
 		 306 aa  187  2e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.407825 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1469  Phosphomethylpyrimidine kinase  41.58 
 
 		 299 aa  177  2e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2715  transcriptional regulator, XRE family  36.24 
 
 		 299 aa  173  3.9999999999999995e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.603714  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1034  hypothetical protein  28.57 
 
 		 323 aa  101  2e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00255835 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0069  phosphomethylpyrimidine kinase  28.57 
 
 		 320 aa  93.2  5e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.844231  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0828  phosphomethylpyrimidine kinase  33.73 
 
 		 452 aa  88.6  1e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3501  hydroxymethylpyrimidine kinase  33.72 
 
 		 448 aa  87  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.604187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2182  phosphomethylpyrimidine kinase  29.61 
 
 		 456 aa  82.8  0.000000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2166  hypothetical protein  24.57 
 
 		 304 aa  80.5  0.00000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00217357 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1419  phosphomethylpyrimidine kinase  33.89 
 
 		 450 aa  79  0.00000000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.528826 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1448  Phosphomethylpyrimidine kinase  27.55 
 
 		 314 aa  78.2  0.0000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00994121  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1881  phosphomethylpyrimidine kinase  34.44 
 
 		 444 aa  78.2  0.0000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.000178657  normal  0.46671 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0564  hypothetical protein  30.56 
 
 		 179 aa  75.5  0.000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1460  phosphomethylpyrimidine kinase  34.42 
 
 		 182 aa  71.6  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0941  hypothetical protein  25 
 
 		 290 aa  72  0.00000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0176  hypothetical protein  30 
 
 		 119 aa  68.9  0.0000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0542  phosphomethylpyrimidine kinase  25.32 
 
 		 432 aa  67.8  0.0000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0839  hypothetical protein  24.01 
 
 		 290 aa  67.4  0.0000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.660796  normal  0.142658 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1419  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  24.32 
 
 		 411 aa  66.6  0.0000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0240  phosphomethylpyrimidine kinase  34.01 
 
 		 449 aa  65.1  0.000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.180045 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1384  hypothetical protein  24.37 
 
 		 289 aa  64.7  0.000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1934  hypothetical protein  25 
 
 		 289 aa  64.7  0.000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0460  phosphomethylpyrimidine kinase  25.4 
 
 		 429 aa  63.9  0.000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0697  AIR synthase related protein-like  31.37 
 
 		 528 aa  63.2  0.000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000561591  hitchhiker  0.000000203748 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0944  phosphomethylpyrimidine kinase  26.18 
 
 		 435 aa  61.2  0.00000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1221  hypothetical protein  27.22 
 
 		 193 aa  60.8  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0930619 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2988  phosphomethylpyrimidine kinase  32.89 
 
 		 461 aa  59.3  0.00000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1022  Phosphomethylpyrimidine kinase  27.72 
 
 		 190 aa  56.2  0.0000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0139  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  25.52 
 
 		 398 aa  53.9  0.000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3238  hypothetical protein  30.82 
 
 		 199 aa  54.3  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.112934  normal  0.19984 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3232  phosphomethylpyrimidine kinase  29.01 
 
 		 453 aa  53.5  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0919  phosphomethylpyrimidine kinase  31.15 
 
 		 127 aa  53.5  0.000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0137  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  25.52 
 
 		 398 aa  52.8  0.000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0934  hypothetical protein  29.17 
 
 		 138 aa  51.6  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.244199 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0090  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 116 aa  51.2  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.592947  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2036  Fis family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 109 aa  49.7  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.494843  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0397  transcriptional regulator, Fis family  41.33 
 
 		 110 aa  49.3  0.00008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0200714  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1410  transcriptional regulator-like protein  41.51 
 
 		 116 aa  48.5  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000126907  hitchhiker  0.000639527 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1910  conserved hypothetical protein  46.3 
 
 		 122 aa  48.1  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2048  hypothetical protein  41.33 
 
 		 119 aa  48.1  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000000899924  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0290  hypothetical protein  32.95 
 
 		 107 aa  48.1  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1213  hypothetical protein  34 
 
 		 107 aa  47.4  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.735424 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0295  transcriptional regulator-like  43.4 
 
 		 126 aa  47.8  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0237  hypothetical protein  47.62 
 
 		 237 aa  47.8  0.0003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.211231 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2388  transcriptional regulator, XRE family  48.08 
 
 		 106 aa  47  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.673915  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0484  XRE family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 116 aa  46.6  0.0005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1846  transcriptional regulator, fis family  42.31 
 
 		 109 aa  46.2  0.0006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1311  hypothetical protein  33.78 
 
 		 78 aa  46.2  0.0007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.174745  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0533  hypothetical protein  31 
 
 		 121 aa  46.2  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0262  hypothetical protein  30 
 
 		 107 aa  45.4  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.233822 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1594  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  21.29 
 
 		 399 aa  45.4  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0359  hypothetical protein  48.98 
 
 		 108 aa  45.4  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.114666  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1282  phosphomethylpyrimidine kinase  31.19 
 
 		 461 aa  45.8  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2046  transcriptional regulator, fis family  44.23 
 
 		 117 aa  45.1  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.03951  normal  0.243031 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0491  phosphomethylpyrimidine kinase  32.89 
 
 		 446 aa  43.9  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0839  phosphomethylpyrimidine kinase  26.51 
 
 		 449 aa  43.5  0.005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.218839 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2423  hypothetical protein  30.86 
 
 		 134 aa  42.4  0.01  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0429086 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>