35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0262 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_0262  hypothetical protein  100 
 
 		 107 aa  213  9e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.233822 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0290  hypothetical protein  54.81 
 
 		 107 aa  119  9.999999999999999e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1213  hypothetical protein  57.73 
 
 		 107 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.735424 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2423  hypothetical protein  54.81 
 
 		 134 aa  110  7.000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0429086 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0484  XRE family transcriptional regulator  51.02 
 
 		 116 aa  110  7.000000000000001e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2124  hypothetical protein  49.55 
 
 		 115 aa  110  8.000000000000001e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1152  hypothetical protein  52.43 
 
 		 108 aa  103  5e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.168928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2998  hypothetical protein  52.58 
 
 		 102 aa  97.8  4e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0176  hypothetical protein  40.86 
 
 		 119 aa  81.6  0.000000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0397  transcriptional regulator, Fis family  38.32 
 
 		 110 aa  70.5  0.000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0200714  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2388  transcriptional regulator, XRE family  39.18 
 
 		 106 aa  65.9  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.673915  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0359  hypothetical protein  39.58 
 
 		 108 aa  63.9  0.0000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.114666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2046  transcriptional regulator, fis family  40 
 
 		 117 aa  63.9  0.0000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.03951  normal  0.243031 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2036  Fis family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 109 aa  63.5  0.0000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.494843  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0295  transcriptional regulator-like  33.33 
 
 		 126 aa  58.2  0.00000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1846  transcriptional regulator, fis family  32.98 
 
 		 109 aa  57.8  0.00000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2048  hypothetical protein  36.67 
 
 		 119 aa  57  0.00000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000000899924  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1410  transcriptional regulator-like protein  41.67 
 
 		 116 aa  55.8  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000126907  hitchhiker  0.000639527 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0533  hypothetical protein  31.91 
 
 		 121 aa  54.3  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0446  DNA binding protein  33.33 
 
 		 306 aa  52  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.407825 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1910  conserved hypothetical protein  25.77 
 
 		 122 aa  50.8  0.000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2715  transcriptional regulator, XRE family  31.11 
 
 		 299 aa  50.4  0.000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.603714  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0434  transcriptional regulator, XRE family  27.84 
 
 		 309 aa  50.1  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.463605  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1314  hypothetical protein  44.62 
 
 		 231 aa  48.9  0.00002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0090  helix-turn-helix domain-containing protein  32.32 
 
 		 116 aa  49.3  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.592947  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2449  Fis family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 105 aa  48.5  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1469  Phosphomethylpyrimidine kinase  35.44 
 
 		 299 aa  48.5  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0237  hypothetical protein  51.06 
 
 		 237 aa  48.1  0.00004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.211231 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2413  transcriptional regulator, XRE family  36.71 
 
 		 299 aa  47  0.00008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2542  transcriptional regulator, XRE family  26.8 
 
 		 307 aa  46.2  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0204  hypothetical protein  40 
 
 		 230 aa  45.8  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.803129 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1352  HTH DNA-binding protein  30 
 
 		 306 aa  45.4  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.111494 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0022  transcriptional regulator, XRE family  34.18 
 
 		 298 aa  43.5  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.55201  normal  0.925385 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0770  hypothetical protein  47.62 
 
 		 234 aa  42.7  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2596  fis family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 114 aa  40.8  0.007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>