27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_2449 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_2449  Fis family transcriptional regulator  100 
 
 		 105 aa  213  5.9999999999999996e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2596  fis family transcriptional regulator  56.84 
 
 		 114 aa  117  6e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0496  hypothetical protein  56.16 
 
 		 77 aa  92.4  2e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0554271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0290  hypothetical protein  36.96 
 
 		 107 aa  58.2  0.00000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0533  hypothetical protein  31.96 
 
 		 121 aa  57.4  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1846  transcriptional regulator, fis family  33.7 
 
 		 109 aa  57  0.00000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1213  hypothetical protein  35.96 
 
 		 107 aa  55.8  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.735424 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0295  transcriptional regulator-like  31.68 
 
 		 126 aa  54.7  0.0000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0090  helix-turn-helix domain-containing protein  27.78 
 
 		 116 aa  54.7  0.0000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.592947  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2388  transcriptional regulator, XRE family  30.43 
 
 		 106 aa  54.7  0.0000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.673915  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0397  transcriptional regulator, Fis family  42.86 
 
 		 110 aa  53.9  0.0000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0200714  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2046  transcriptional regulator, fis family  31.52 
 
 		 117 aa  53.5  0.0000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.03951  normal  0.243031 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2048  hypothetical protein  29.47 
 
 		 119 aa  53.1  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000000899924  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2036  Fis family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 109 aa  52.8  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.494843  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0484  XRE family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 116 aa  52.8  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0359  hypothetical protein  44.64 
 
 		 108 aa  51.6  0.000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.114666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2423  hypothetical protein  32.97 
 
 		 134 aa  48.5  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0429086 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0262  hypothetical protein  31.52 
 
 		 107 aa  48.5  0.00003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.233822 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1152  hypothetical protein  34.44 
 
 		 108 aa  48.1  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.168928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2124  hypothetical protein  32.58 
 
 		 115 aa  48.1  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2542  transcriptional regulator, XRE family  32.1 
 
 		 307 aa  47.8  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0434  transcriptional regulator, XRE family  32.93 
 
 		 309 aa  46.6  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.463605  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1910  conserved hypothetical protein  26.6 
 
 		 122 aa  45.8  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0176  hypothetical protein  27.37 
 
 		 119 aa  42.7  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2411  HTH DNA-binding protein  34.25 
 
 		 307 aa  41.2  0.005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0357343  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0934  hypothetical protein  36.17 
 
 		 138 aa  40.4  0.007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.244199 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0022  transcriptional regulator, XRE family  35.62 
 
 		 298 aa  40  0.01  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.55201  normal  0.925385 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>