16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0496 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_0496  hypothetical protein  100 
 
 		 77 aa  154  3e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0554271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2596  fis family transcriptional regulator  60.27 
 
 		 114 aa  95.9  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2449  Fis family transcriptional regulator  56.16 
 
 		 105 aa  92.4  2e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0290  hypothetical protein  37.14 
 
 		 107 aa  49.3  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2046  transcriptional regulator, fis family  41.54 
 
 		 117 aa  48.1  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.03951  normal  0.243031 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0484  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 116 aa  46.6  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1846  transcriptional regulator, fis family  41.03 
 
 		 109 aa  45.8  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2124  hypothetical protein  40.91 
 
 		 115 aa  45.1  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2388  transcriptional regulator, XRE family  74.07 
 
 		 106 aa  44.7  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.673915  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2036  Fis family transcriptional regulator  70.37 
 
 		 109 aa  44.3  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.494843  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0397  transcriptional regulator, Fis family  70.37 
 
 		 110 aa  44.3  0.0006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0200714  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0295  transcriptional regulator-like  66.67 
 
 		 126 aa  43.9  0.0007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0359  hypothetical protein  40 
 
 		 108 aa  43.9  0.0008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.114666  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1213  hypothetical protein  37.88 
 
 		 107 aa  43.5  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.735424 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2423  hypothetical protein  36.92 
 
 		 134 aa  41.6  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0429086 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2048  hypothetical protein  34.33 
 
 		 119 aa  40.8  0.006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000000899924  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>