36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0090 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_0090  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 116 aa  230  4.0000000000000004e-60  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.592947  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1910  conserved hypothetical protein  37.11 
 
 		 122 aa  62.4  0.000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1213  hypothetical protein  35.71 
 
 		 107 aa  58.2  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.735424 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2048  hypothetical protein  31.31 
 
 		 119 aa  56.6  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000000899924  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0434  transcriptional regulator, XRE family  31.25 
 
 		 309 aa  55.8  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.463605  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2449  Fis family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 105 aa  54.7  0.0000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2411  HTH DNA-binding protein  33.33 
 
 		 307 aa  54.3  0.0000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0357343  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2542  transcriptional regulator, XRE family  31.91 
 
 		 307 aa  52.8  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0290  hypothetical protein  32.32 
 
 		 107 aa  53.1  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0533  hypothetical protein  28 
 
 		 121 aa  51.6  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0176  hypothetical protein  32.04 
 
 		 119 aa  51.6  0.000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1152  hypothetical protein  32 
 
 		 108 aa  50.8  0.000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.168928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1352  HTH DNA-binding protein  33.33 
 
 		 306 aa  50.8  0.000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.111494 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0262  hypothetical protein  32.32 
 
 		 107 aa  49.3  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.233822 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0484  XRE family transcriptional regulator  25.49 
 
 		 116 aa  48.9  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0446  DNA binding protein  39.56 
 
 		 306 aa  48.9  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.407825 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2715  transcriptional regulator, XRE family  34.69 
 
 		 299 aa  48.1  0.00004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.603714  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0359  hypothetical protein  36.89 
 
 		 108 aa  47.8  0.00006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.114666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0934  hypothetical protein  38.46 
 
 		 138 aa  47  0.00008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.244199 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1286  transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 		 197 aa  46.2  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0709374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2124  hypothetical protein  40 
 
 		 115 aa  47  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2046  transcriptional regulator, fis family  30.39 
 
 		 117 aa  46.6  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.03951  normal  0.243031 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1469  Phosphomethylpyrimidine kinase  34.48 
 
 		 299 aa  45.8  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2413  transcriptional regulator, XRE family  36.49 
 
 		 299 aa  45.4  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0397  transcriptional regulator, Fis family  31.48 
 
 		 110 aa  45.8  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0200714  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1410  transcriptional regulator-like protein  37.04 
 
 		 116 aa  46.2  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000126907  hitchhiker  0.000639527 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2596  fis family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 114 aa  45.1  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1846  transcriptional regulator, fis family  29.13 
 
 		 109 aa  45.1  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0022  transcriptional regulator, XRE family  33.71 
 
 		 298 aa  44.7  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.55201  normal  0.925385 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2423  hypothetical protein  40 
 
 		 134 aa  44.7  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0429086 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0295  transcriptional regulator-like  28 
 
 		 126 aa  43.1  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2388  transcriptional regulator, XRE family  41.51 
 
 		 106 aa  42.4  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.673915  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2036  Fis family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 109 aa  42.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.494843  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0237  hypothetical protein  48.89 
 
 		 237 aa  40.8  0.006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.211231 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1398  hypothetical protein  28.3 
 
 		 106 aa  40.4  0.007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000179385 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2998  hypothetical protein  30.23 
 
 		 102 aa  40.4  0.008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>