20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0934 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_0934  hypothetical protein  100 
 
 		 138 aa  279  7.000000000000001e-75  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.244199 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0434  transcriptional regulator, XRE family  31.58 
 
 		 309 aa  64.3  0.0000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.463605  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2542  transcriptional regulator, XRE family  31.53 
 
 		 307 aa  60.5  0.000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2411  HTH DNA-binding protein  30.63 
 
 		 307 aa  59.7  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0357343  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1910  conserved hypothetical protein  33.33 
 
 		 122 aa  58.5  0.00000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0176  hypothetical protein  29.92 
 
 		 119 aa  55.5  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1352  HTH DNA-binding protein  29.17 
 
 		 306 aa  52  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.111494 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0090  helix-turn-helix domain-containing protein  38.46 
 
 		 116 aa  47  0.00008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.592947  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0022  transcriptional regulator, XRE family  32.93 
 
 		 298 aa  45.1  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.55201  normal  0.925385 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2048  hypothetical protein  26.8 
 
 		 119 aa  45.4  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000000899924  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1448  Phosphomethylpyrimidine kinase  32.03 
 
 		 314 aa  45.4  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00994121  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2413  transcriptional regulator, XRE family  30.49 
 
 		 299 aa  43.9  0.0007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2715  transcriptional regulator, XRE family  23.58 
 
 		 299 aa  43.9  0.0008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.603714  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1410  transcriptional regulator-like protein  27.5 
 
 		 116 aa  42  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000126907  hitchhiker  0.000639527 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1717  hypothetical protein  34.78 
 
 		 107 aa  42.7  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0446  DNA binding protein  22.64 
 
 		 306 aa  42.7  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.407825 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1469  Phosphomethylpyrimidine kinase  29.27 
 
 		 299 aa  42.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2449  Fis family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 105 aa  40.4  0.007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0069  phosphomethylpyrimidine kinase  35.19 
 
 		 320 aa  40.4  0.009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.844231  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0484  XRE family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 116 aa  40.4  0.009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>