65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_1469 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_1469  Phosphomethylpyrimidine kinase  100 
 
 		 299 aa  584  1e-166  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2413  transcriptional regulator, XRE family  85.28 
 
 		 299 aa  508  1e-143  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0022  transcriptional regulator, XRE family  65.1 
 
 		 298 aa  384  1e-106  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.55201  normal  0.925385 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2715  transcriptional regulator, XRE family  62.54 
 
 		 299 aa  364  1e-100  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.603714  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0446  DNA binding protein  59.09 
 
 		 306 aa  335  7e-91  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.407825 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0434  transcriptional regulator, XRE family  41.61 
 
 		 309 aa  199  3.9999999999999996e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.463605  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2411  HTH DNA-binding protein  40.34 
 
 		 307 aa  196  3e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0357343  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2542  transcriptional regulator, XRE family  39.46 
 
 		 307 aa  193  2e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1352  HTH DNA-binding protein  41.58 
 
 		 306 aa  180  2e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.111494 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0069  phosphomethylpyrimidine kinase  28.34 
 
 		 320 aa  99  9e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.844231  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1448  Phosphomethylpyrimidine kinase  28.33 
 
 		 314 aa  98.6  1e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00994121  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0828  phosphomethylpyrimidine kinase  38.41 
 
 		 452 aa  95.9  8e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1034  hypothetical protein  27.45 
 
 		 323 aa  94.7  1e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00255835 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2182  phosphomethylpyrimidine kinase  34.32 
 
 		 456 aa  91.7  2e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2166  hypothetical protein  27.1 
 
 		 304 aa  90.5  3e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00217357 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0941  hypothetical protein  28.76 
 
 		 290 aa  87  4e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3501  hydroxymethylpyrimidine kinase  33.72 
 
 		 448 aa  82  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.604187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1460  phosphomethylpyrimidine kinase  35.06 
 
 		 182 aa  79  0.00000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0460  phosphomethylpyrimidine kinase  32.78 
 
 		 429 aa  78.2  0.0000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0839  hypothetical protein  27.85 
 
 		 290 aa  77.4  0.0000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.660796  normal  0.142658 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0697  AIR synthase related protein-like  29.89 
 
 		 528 aa  76.3  0.0000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000561591  hitchhiker  0.000000203748 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1384  hypothetical protein  28.86 
 
 		 289 aa  76.3  0.0000000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1419  phosphomethylpyrimidine kinase  33.33 
 
 		 450 aa  75.1  0.000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.528826 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1881  phosphomethylpyrimidine kinase  34.34 
 
 		 444 aa  74.7  0.000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.000178657  normal  0.46671 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0839  phosphomethylpyrimidine kinase  35.71 
 
 		 449 aa  72.4  0.00000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.218839 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0240  phosphomethylpyrimidine kinase  34.25 
 
 		 449 aa  68.6  0.0000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.180045 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0542  phosphomethylpyrimidine kinase  23.73 
 
 		 432 aa  68.2  0.0000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1419  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  26.9 
 
 		 411 aa  67  0.0000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1221  hypothetical protein  29.94 
 
 		 193 aa  64.7  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0930619 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1029  AIR synthase-like protein  30.77 
 
 		 465 aa  63.9  0.000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0402037  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1282  phosphomethylpyrimidine kinase  30.86 
 
 		 461 aa  63.9  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0944  phosphomethylpyrimidine kinase  27.78 
 
 		 435 aa  62.4  0.000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3232  phosphomethylpyrimidine kinase  33.12 
 
 		 453 aa  62.4  0.000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0564  hypothetical protein  30.77 
 
 		 179 aa  61.6  0.00000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1934  hypothetical protein  26.33 
 
 		 289 aa  62  0.00000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0200  phosphomethylpyrimidine kinase  28.07 
 
 		 444 aa  62  0.00000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.619111  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1594  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  24.23 
 
 		 399 aa  59.7  0.00000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1022  Phosphomethylpyrimidine kinase  27.43 
 
 		 190 aa  56.6  0.0000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0919  phosphomethylpyrimidine kinase  33.88 
 
 		 127 aa  56.6  0.0000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1311  hypothetical protein  40.54 
 
 		 78 aa  55.8  0.0000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.174745  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2988  phosphomethylpyrimidine kinase  29.56 
 
 		 461 aa  54.3  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0139  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  22.73 
 
 		 398 aa  53.9  0.000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3238  hypothetical protein  26.34 
 
 		 199 aa  54.3  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.112934  normal  0.19984 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2998  hypothetical protein  37.65 
 
 		 102 aa  53.9  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0491  phosphomethylpyrimidine kinase  40.38 
 
 		 446 aa  53.9  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0137  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  22.73 
 
 		 398 aa  53.5  0.000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0176  hypothetical protein  35.44 
 
 		 119 aa  52.8  0.000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0646  phosphomethylpyrimidine kinase  26.67 
 
 		 445 aa  51.6  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0762615  normal  0.306983 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0262  hypothetical protein  35.44 
 
 		 107 aa  48.9  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.233822 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0290  hypothetical protein  35.79 
 
 		 107 aa  48.5  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0484  XRE family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 116 aa  48.5  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1213  hypothetical protein  35.56 
 
 		 107 aa  46.2  0.0006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.735424 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0090  helix-turn-helix domain-containing protein  34.48 
 
 		 116 aa  46.2  0.0007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.592947  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1910  conserved hypothetical protein  31.33 
 
 		 122 aa  45.1  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0397  transcriptional regulator, Fis family  44.23 
 
 		 110 aa  45.1  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0200714  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1846  transcriptional regulator, fis family  32.53 
 
 		 109 aa  44.3  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2048  hypothetical protein  44.9 
 
 		 119 aa  43.9  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000000899924  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0295  transcriptional regulator-like  32.1 
 
 		 126 aa  44.3  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0359  hypothetical protein  35.44 
 
 		 108 aa  43.5  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.114666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2423  hypothetical protein  30.83 
 
 		 134 aa  43.5  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0429086 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2388  transcriptional regulator, XRE family  48 
 
 		 106 aa  43.1  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.673915  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0770  hypothetical protein  33.63 
 
 		 234 aa  43.1  0.005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2036  Fis family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 109 aa  42.7  0.006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.494843  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0237  hypothetical protein  43.48 
 
 		 237 aa  43.1  0.006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.211231 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0934  hypothetical protein  29.27 
 
 		 138 aa  42.7  0.008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.244199 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>