26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0770 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0770  hypothetical protein  100 
 
 		 234 aa  458  9.999999999999999e-129  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1314  hypothetical protein  71 
 
 		 231 aa  332  3e-90  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0204  hypothetical protein  75.65 
 
 		 230 aa  329  2e-89  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.803129 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0237  hypothetical protein  74.34 
 
 		 237 aa  316  2e-85  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.211231 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0484  XRE family transcriptional regulator  56.52 
 
 		 116 aa  56.6  0.0000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1410  transcriptional regulator-like protein  46.03 
 
 		 116 aa  54.7  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000126907  hitchhiker  0.000639527 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1910  conserved hypothetical protein  40 
 
 		 122 aa  53.5  0.000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0434  transcriptional regulator, XRE family  38.61 
 
 		 309 aa  51.6  0.000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.463605  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2423  hypothetical protein  36.08 
 
 		 134 aa  50.4  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0429086 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2542  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 		 307 aa  49.3  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2124  hypothetical protein  42.11 
 
 		 115 aa  47.8  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0397  transcriptional regulator, Fis family  41.43 
 
 		 110 aa  48.1  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0200714  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0295  transcriptional regulator-like  51.16 
 
 		 126 aa  47.4  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1152  hypothetical protein  44.26 
 
 		 108 aa  47.4  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.168928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0290  hypothetical protein  52.38 
 
 		 107 aa  46.6  0.0004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2998  hypothetical protein  44.26 
 
 		 102 aa  46.6  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2388  transcriptional regulator, XRE family  46 
 
 		 106 aa  46.6  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.673915  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2036  Fis family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 109 aa  46.2  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.494843  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0359  hypothetical protein  52.38 
 
 		 108 aa  45.4  0.0008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.114666  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1213  hypothetical protein  52.38 
 
 		 107 aa  45.1  0.0008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.735424 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2411  HTH DNA-binding protein  52.27 
 
 		 307 aa  45.1  0.0009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0357343  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2596  fis family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 114 aa  42.7  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0262  hypothetical protein  43.75 
 
 		 107 aa  42.7  0.005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.233822 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1469  Phosphomethylpyrimidine kinase  33.63 
 
 		 299 aa  42.4  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1846  transcriptional regulator, fis family  36.92 
 
 		 109 aa  42  0.008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2046  transcriptional regulator, fis family  41.51 
 
 		 117 aa  41.6  0.01  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.03951  normal  0.243031 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>