24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0204 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_0204  hypothetical protein  100 
 
 
230 aa  449  1e-125  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.803129 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1314  hypothetical protein  76.52 
 
 
231 aa  358  5e-98  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0237  hypothetical protein  78.95 
 
 
237 aa  345  3e-94  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.211231 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0770  hypothetical protein  75.65 
 
 
234 aa  330  1e-89  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1410  transcriptional regulator-like protein  50 
 
 
116 aa  59.3  0.00000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000126907  hitchhiker  0.000639527 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0484  XRE family transcriptional regulator  54.17 
 
 
116 aa  56.2  0.0000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2423  hypothetical protein  49.18 
 
 
134 aa  54.3  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0429086 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1910  conserved hypothetical protein  42.25 
 
 
122 aa  54.3  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2124  hypothetical protein  45.9 
 
 
115 aa  48.9  0.00007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2998  hypothetical protein  45.16 
 
 
102 aa  48.5  0.00008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2388  transcriptional regulator, XRE family  51.02 
 
 
106 aa  48.1  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.673915  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2036  Fis family transcriptional regulator  53.33 
 
 
109 aa  47.4  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.494843  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0359  hypothetical protein  57.14 
 
 
108 aa  47  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.114666  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0434  transcriptional regulator, XRE family  48.94 
 
 
309 aa  46.6  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.463605  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0397  transcriptional regulator, Fis family  53.33 
 
 
110 aa  47  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0200714  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2046  transcriptional regulator, fis family  40.91 
 
 
117 aa  46.2  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.03951  normal  0.243031 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1152  hypothetical protein  38.75 
 
 
108 aa  46.6  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.168928  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1213  hypothetical protein  52.38 
 
 
107 aa  46.2  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.735424 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0290  hypothetical protein  50 
 
 
107 aa  45.8  0.0005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0262  hypothetical protein  40 
 
 
107 aa  45.4  0.0007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.233822 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2542  transcriptional regulator, XRE family  46.81 
 
 
307 aa  45.4  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0295  transcriptional regulator-like  52.38 
 
 
126 aa  45.1  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1717  hypothetical protein  40.35 
 
 
107 aa  43.9  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1469  Phosphomethylpyrimidine kinase  41.94 
 
 
299 aa  42  0.009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>