11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1717 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1717  hypothetical protein  100 
 
 		 107 aa  215  2e-55  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1910  conserved hypothetical protein  48.04 
 
 		 122 aa  111  3e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1314  hypothetical protein  38.6 
 
 		 231 aa  47.4  0.00006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2046  transcriptional regulator, fis family  41.46 
 
 		 117 aa  47.4  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.03951  normal  0.243031 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1410  transcriptional regulator-like protein  32.35 
 
 		 116 aa  47  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000126907  hitchhiker  0.000639527 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0237  hypothetical protein  36.84 
 
 		 237 aa  45.1  0.0003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.211231 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0204  hypothetical protein  40.35 
 
 		 230 aa  43.5  0.0009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.803129 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0934  hypothetical protein  34.78 
 
 		 138 aa  42.7  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.244199 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2423  hypothetical protein  37.1 
 
 		 134 aa  41.2  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0429086 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0484  XRE family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 116 aa  40.4  0.008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0770  hypothetical protein  35.94 
 
 		 234 aa  40  0.01  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>