More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0137 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0137  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  100 
 
 		 398 aa  814    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0139  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  99.75 
 
 		 398 aa  812    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1419  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  56.33 
 
 		 411 aa  469  1.0000000000000001e-131  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1594  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  52.41 
 
 		 399 aa  437  1e-121  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0240  phosphomethylpyrimidine kinase  30.72 
 
 		 449 aa  161  1e-38  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.180045 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1881  phosphomethylpyrimidine kinase  29.39 
 
 		 444 aa  159  7e-38  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.000178657  normal  0.46671 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1419  phosphomethylpyrimidine kinase  28.91 
 
 		 450 aa  159  7e-38  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.528826 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0542  phosphomethylpyrimidine kinase  28.97 
 
 		 432 aa  151  3e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3501  hydroxymethylpyrimidine kinase  29.31 
 
 		 448 aa  150  4e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.604187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0839  phosphomethylpyrimidine kinase  29.21 
 
 		 449 aa  144  2e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.218839 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0460  phosphomethylpyrimidine kinase  27.66 
 
 		 429 aa  140  4.999999999999999e-32  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0828  phosphomethylpyrimidine kinase  26.91 
 
 		 452 aa  132  7.999999999999999e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2182  phosphomethylpyrimidine kinase  31.79 
 
 		 456 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0646  phosphomethylpyrimidine kinase  28.47 
 
 		 445 aa  131  2.0000000000000002e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0762615  normal  0.306983 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0944  phosphomethylpyrimidine kinase  26.41 
 
 		 435 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3232  phosphomethylpyrimidine kinase  27.79 
 
 		 453 aa  130  4.0000000000000003e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0200  phosphomethylpyrimidine kinase  25.33 
 
 		 444 aa  126  8.000000000000001e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.619111  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0912  phosphomethylpyrimidine kinase  24.28 
 
 		 394 aa  108  2e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.84137 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2988  phosphomethylpyrimidine kinase  25.06 
 
 		 461 aa  107  4e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0564  hypothetical protein  33.52 
 
 		 179 aa  104  3e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1282  phosphomethylpyrimidine kinase  25.06 
 
 		 461 aa  103  4e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1769  phosphomethylpyrimidine kinase  24.34 
 
 		 396 aa  101  2e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0611594  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1460  phosphomethylpyrimidine kinase  37.33 
 
 		 182 aa  99  1e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1022  Phosphomethylpyrimidine kinase  33.55 
 
 		 190 aa  98.6  2e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0381  phosphomethylpyrimidine kinase  31.2 
 
 		 259 aa  97.8  3e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0192  phosphomethylpyrimidine kinase  27.1 
 
 		 269 aa  95.9  1e-18  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0623  Phosphomethylpyrimidine kinase  28.4 
 
 		 255 aa  92  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1140  phosphomethylpyrimidine kinase  29.87 
 
 		 257 aa  90.5  5e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.837771 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1032  phosphomethylpyrimidine kinase  23.61 
 
 		 394 aa  89.4  9e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0254  phosphomethylpyrimidine kinase/thiamin-phosphate pyrophosphorylase  26.77 
 
 		 529 aa  88.2  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1601  phosphomethylpyrimidine kinase  25.1 
 
 		 251 aa  87.8  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3772  phosphomethylpyrimidine kinase  28.76 
 
 		 265 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0714273 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0919  phosphomethylpyrimidine kinase  38.14 
 
 		 127 aa  85.5  0.000000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0179  putative phosphomethylpyrimidine kinase  28.57 
 
 		 264 aa  84.7  0.000000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00139306  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0629  phosphomethylpyrimidine kinase, putative  26.22 
 
 		 290 aa  84.7  0.000000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.246036  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0071  phosphomethylpyrimidine kinase  30.71 
 
 		 267 aa  84  0.000000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0167  phosphomethylpyrimidine kinase  27.31 
 
 		 264 aa  83.2  0.000000000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00133155  hitchhiker  0.000172032 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2522  phosphomethylpyrimidine kinase  29.46 
 
 		 262 aa  82.8  0.000000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0014  phosphomethylpyrimidine kinase  27.87 
 
 		 260 aa  82  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4782  phosphomethylpyrimidine kinase  27.23 
 
 		 265 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.291324  normal  0.0384059 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4836  phosphomethylpyrimidine kinase  28.27 
 
 		 265 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4658  phosphomethylpyrimidine kinase  27.23 
 
 		 265 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.46443  normal  0.665926 
 
 
-
 
NC_002950  PG2109  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  28.8 
 
 		 647 aa  81.3  0.00000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.671125 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0095  Phosphomethylpyrimidine kinase  30.29 
 
 		 253 aa  81.3  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000458496  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1153  phosphomethylpyrimidine kinase  27.95 
 
 		 272 aa  80.9  0.00000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0935315  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1176  phosphomethylpyrimidine kinase  31.74 
 
 		 267 aa  80.9  0.00000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.82174  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1311  Phosphomethylpyrimidine kinase  26.89 
 
 		 242 aa  80.9  0.00000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.275611  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3401  phosphomethylpyrimidine kinase  27.2 
 
 		 270 aa  80.9  0.00000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2468  Phosphomethylpyrimidine kinase  28.05 
 
 		 268 aa  80.5  0.00000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.946237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12410  phosphomethylpyrimidine kinase  27.43 
 
 		 265 aa  80.1  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1133  phosphomethylpyrimidine kinase  27.66 
 
 		 271 aa  80.1  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0914  phosphomethylpyrimidine kinase  26.05 
 
 		 269 aa  79.3  0.0000000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0125  phosphomethylpyrimidine kinase  28.98 
 
 		 285 aa  79.3  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.713324 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1545  phosphomethylpyrimidine kinase  28.9 
 
 		 264 aa  79.3  0.0000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.104036  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1338  phosphomethylpyrimidine kinase  30.08 
 
 		 264 aa  78.2  0.0000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00019728  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3900  phosphomethylpyrimidine kinase  28.27 
 
 		 291 aa  78.2  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4945  phosphomethylpyrimidine kinase  27.66 
 
 		 265 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.505455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1992  phosphomethylpyrimidine kinase  26.25 
 
 		 270 aa  78.2  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0969  phosphomethylpyrimidine kinase  25.1 
 
 		 263 aa  77.4  0.0000000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.922433  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0638  phosphomethylpyrimidine kinase  27.23 
 
 		 274 aa  77  0.0000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0083  phosphomethylpyrimidine kinase  29.22 
 
 		 252 aa  77  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.165626  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2419  Phosphomethylpyrimidine kinase  26.58 
 
 		 269 aa  77  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.795296  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09280  phosphomethylpyrimidine kinase  28.14 
 
 		 271 aa  77  0.0000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.52325  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2061  phosphomethylpyrimidine kinase  32.61 
 
 		 260 aa  76.6  0.0000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0150754  normal  0.0985623 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03000  hydroxymethylpyrimidine kinase/phosphomethylpyrimidine kinase  28.22 
 
 		 265 aa  76.3  0.0000000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1513  Phosphomethylpyrimidine kinase  28.05 
 
 		 285 aa  75.9  0.000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0466134  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3463  phosphomethylpyrimidine kinase  27.52 
 
 		 297 aa  75.5  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2592  phosphomethylpyrimidine kinase  29.15 
 
 		 254 aa  75.9  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3018  phosphomethylpyrimidine kinase  29.66 
 
 		 270 aa  75.5  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1745  hydroxymethylpyrimidine kinase  26.88 
 
 		 479 aa  75.5  0.000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4798  phosphomethylpyrimidine kinase, putative  27.85 
 
 		 265 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.452059  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0491  phosphomethylpyrimidine kinase  23.61 
 
 		 446 aa  74.7  0.000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4340  phosphomethylpyrimidine kinase  28.27 
 
 		 265 aa  73.9  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.994514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0441  phosphomethylpyrimidine kinase  25.1 
 
 		 252 aa  73.9  0.000000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1498  phosphomethylpyrimidine kinase  25.79 
 
 		 257 aa  73.2  0.000000000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.315358  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0393  phosphomethylpyrimidine kinase  28.03 
 
 		 262 aa  73.2  0.000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.845054  normal  0.232819 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1124  phosphomethylpyrimidine kinase  28.63 
 
 		 270 aa  73.2  0.000000000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0853  phosphomethylpyrimidine kinase  27.2 
 
 		 288 aa  73.2  0.000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.114242  normal  0.0282488 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0997  phosphomethylpyrimidine kinase  27.2 
 
 		 288 aa  73.2  0.000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00609101  normal  0.106083 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2662  phosphomethylpyrimidine kinase  26.05 
 
 		 281 aa  73.2  0.000000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.993196 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0441  thiamine-phosphate pyrophosphorylase/thiamine-phosphate pyrophosphorylase  26.29 
 
 		 479 aa  72.8  0.000000000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00801461  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0957  phosphomethylpyrimidine kinase  29.28 
 
 		 269 aa  71.2  0.00000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.297451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2627  phosphomethylpyrimidine kinase  28.75 
 
 		 279 aa  71.6  0.00000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1457  hypothetical protein  28.14 
 
 		 488 aa  70.9  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0241  phosphomethylpyrimidine kinase  27.15 
 
 		 249 aa  70.9  0.00000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.801075 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1310  phosphomethylpyrimidine kinase  27.59 
 
 		 268 aa  70.5  0.00000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1583  phosphomethylpyrimidine kinase  27.06 
 
 		 264 aa  70.5  0.00000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.152097  normal  0.0340338 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09330  phosphomethylpyrimidine kinase  27.31 
 
 		 264 aa  70.1  0.00000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.387333 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1397  phosphomethylpyrimidine kinase  25.36 
 
 		 265 aa  70.1  0.00000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000385147  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2517  phosphomethylpyrimidine kinase  25.31 
 
 		 260 aa  69.7  0.00000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0552  phosphomethylpyrimidine kinase  28.7 
 
 		 269 aa  69.7  0.00000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00628299 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00145  Thiamine monophosphate synthase  25.31 
 
 		 526 aa  69.7  0.00000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2555  phosphomethylpyrimidine kinase  25.93 
 
 		 280 aa  68.9  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0452  phosphomethylpyrimidine kinase  24.76 
 
 		 436 aa  69.7  0.0000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.70912 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2331  phosphomethylpyrimidine kinase  27.64 
 
 		 288 aa  69.3  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3133  phosphomethylpyrimidine kinase  28.51 
 
 		 277 aa  69.3  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0372  phosphomethylpyrimidine kinase  29.32 
 
 		 285 aa  69.3  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.591258  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4934  phosphomethylpyrimidine kinase  29.49 
 
 		 268 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.566917  normal  0.666851 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1526  hypothetical protein  27.39 
 
 		 488 aa  68.6  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1636  phosphomethylpyrimidine kinase  28.03 
 
 		 499 aa  68.6  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0431333  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>