More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1032 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1769  phosphomethylpyrimidine kinase  83.21 
 
 
396 aa  642    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0611594  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1032  phosphomethylpyrimidine kinase  100 
 
 
394 aa  763    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0912  phosphomethylpyrimidine kinase  79.08 
 
 
394 aa  614  1e-175  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.84137 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0944  phosphomethylpyrimidine kinase  52.76 
 
 
435 aa  396  1e-109  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0460  phosphomethylpyrimidine kinase  44.12 
 
 
429 aa  317  3e-85  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0542  phosphomethylpyrimidine kinase  29.43 
 
 
432 aa  139  8.999999999999999e-32  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2182  phosphomethylpyrimidine kinase  24.48 
 
 
456 aa  130  3e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0828  phosphomethylpyrimidine kinase  25.12 
 
 
452 aa  130  3e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0381  phosphomethylpyrimidine kinase  36.08 
 
 
259 aa  129  8.000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3501  hydroxymethylpyrimidine kinase  26 
 
 
448 aa  126  7e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.604187  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0828  phosphomethylpyrimidine kinase  30.31 
 
 
264 aa  122  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.192548  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0125  phosphomethylpyrimidine kinase  28.12 
 
 
285 aa  120  3.9999999999999996e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.713324 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0192  phosphomethylpyrimidine kinase  30.8 
 
 
269 aa  119  7e-26  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0071  phosphomethylpyrimidine kinase  33.89 
 
 
267 aa  119  9e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0969  phosphomethylpyrimidine kinase  36.91 
 
 
263 aa  119  9.999999999999999e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.922433  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4934  phosphomethylpyrimidine kinase  28.35 
 
 
268 aa  116  5e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.566917  normal  0.666851 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4470  phosphomethylpyrimidine kinase  28.35 
 
 
268 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.668119  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2061  phosphomethylpyrimidine kinase  28.79 
 
 
260 aa  112  8.000000000000001e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0150754  normal  0.0985623 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4984  phosphomethylpyrimidine kinase  27.59 
 
 
268 aa  113  8.000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.702252  normal  0.243702 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1443  phosphomethylpyrimidine kinase  28.74 
 
 
269 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.600581  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1545  phosphomethylpyrimidine kinase  33.47 
 
 
264 aa  111  3e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.104036  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5600  hydroxy-methylpyrimidine kinase /hydroxy-phosphomethylpyrimidine kinase  27.95 
 
 
266 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429432  normal  0.105983 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3463  phosphomethylpyrimidine kinase  25.19 
 
 
297 aa  110  5e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1338  phosphomethylpyrimidine kinase  33.06 
 
 
264 aa  109  9.000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00019728  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2250  phosphomethylpyrimidine kinase  27.63 
 
 
268 aa  108  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.660572  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1419  phosphomethylpyrimidine kinase  24.94 
 
 
450 aa  108  2e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.528826 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2522  phosphomethylpyrimidine kinase  31.1 
 
 
262 aa  108  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1881  phosphomethylpyrimidine kinase  23.59 
 
 
444 aa  108  2e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.000178657  normal  0.46671 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0184  phosphomethylpyrimidine kinase  25.31 
 
 
403 aa  108  2e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000409945  normal  0.070974 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4453  phosphomethylpyrimidine kinase  28.35 
 
 
270 aa  107  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.800707  normal  0.352817 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1498  phosphomethylpyrimidine kinase  29.76 
 
 
257 aa  107  4e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.315358  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2331  phosphomethylpyrimidine kinase  28.08 
 
 
288 aa  107  4e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1554  phosphomethylpyrimidine kinase  27.63 
 
 
266 aa  106  6e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2239  phosphomethylpyrimidine kinase  27.63 
 
 
266 aa  106  6e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2391  phosphomethylpyrimidine kinase  27.63 
 
 
266 aa  106  6e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0961  phosphomethylpyrimidine kinase  27.63 
 
 
266 aa  106  6e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1544  phosphomethylpyrimidine kinase  27.63 
 
 
266 aa  106  6e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1135  phosphomethylpyrimidine kinase  27.63 
 
 
266 aa  106  6e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.878652  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3082  phosphomethylpyrimidine kinase  26.85 
 
 
266 aa  106  7e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.190737 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02031  phosphomethylpyrimidine kinase  27.63 
 
 
266 aa  105  1e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1082  phosphomethylpyrimidine kinase  28.35 
 
 
271 aa  105  1e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.457786 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01995  hypothetical protein  27.63 
 
 
266 aa  105  1e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0914  phosphomethylpyrimidine kinase  29 
 
 
269 aa  105  1e-21  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1397  phosphomethylpyrimidine kinase  30.28 
 
 
265 aa  105  2e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000385147  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0853  phosphomethylpyrimidine kinase  26.15 
 
 
288 aa  105  2e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.114242  normal  0.0282488 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0997  phosphomethylpyrimidine kinase  26.15 
 
 
288 aa  105  2e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00609101  normal  0.106083 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03000  hydroxymethylpyrimidine kinase/phosphomethylpyrimidine kinase  25.97 
 
 
265 aa  104  2e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1153  phosphomethylpyrimidine kinase  27.47 
 
 
272 aa  104  2e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0935315  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3401  phosphomethylpyrimidine kinase  25.2 
 
 
270 aa  105  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1176  phosphomethylpyrimidine kinase  31.6 
 
 
267 aa  104  3e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.82174  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3018  phosphomethylpyrimidine kinase  30.86 
 
 
270 aa  104  3e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0399  phosphomethylpyrimidine kinase  30.54 
 
 
254 aa  104  3e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1183  phosphomethylpyrimidine kinase  25.77 
 
 
518 aa  104  3e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00808749  hitchhiker  0.00513051 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1935  phosphomethylpyrimidine kinase  26.53 
 
 
283 aa  103  4e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0240  phosphomethylpyrimidine kinase  23.94 
 
 
449 aa  103  5e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.180045 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0452  phosphomethylpyrimidine kinase  25.17 
 
 
436 aa  103  5e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.70912 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0840  phosphomethylpyrimidine kinase  28.79 
 
 
265 aa  102  1e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1992  phosphomethylpyrimidine kinase  30.5 
 
 
270 aa  102  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1662  Phosphomethylpyrimidine kinase  31.82 
 
 
263 aa  102  1e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2711  phosphomethylpyrimidine kinase  25.48 
 
 
267 aa  101  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.725967  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1583  phosphomethylpyrimidine kinase  27.17 
 
 
264 aa  100  3e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.152097  normal  0.0340338 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1787  phosphomethylpyrimidine kinase  26.12 
 
 
308 aa  100  4e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23579  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1453  phosphomethylpyrimidine kinase  25.09 
 
 
289 aa  100  5e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0659513  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0845  hypothetical protein  26.67 
 
 
266 aa  99.8  7e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.324232  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0209  phosphomethylpyrimidine kinase  26.67 
 
 
304 aa  99.4  9e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.606568  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3232  phosphomethylpyrimidine kinase  22.61 
 
 
453 aa  99  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1628  phosphomethylpyrimidine kinase  26.38 
 
 
266 aa  99  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.522982  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0218  phosphomethylpyrimidine kinase  26.67 
 
 
291 aa  98.6  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.940459  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4828  phosphomethylpyrimidine kinase  30.04 
 
 
273 aa  98.6  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2592  phosphomethylpyrimidine kinase  25.3 
 
 
254 aa  98.2  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3649  phosphomethylpyrimidine kinase type-2  26.64 
 
 
267 aa  98.6  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1191  phosphomethylpyrimidine kinase  25.1 
 
 
267 aa  98.2  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.16328  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2710  phosphomethylpyrimidine kinase  27.27 
 
 
266 aa  97.8  3e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.227545  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1310  phosphomethylpyrimidine kinase  28.35 
 
 
268 aa  97.8  3e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0914  phosphomethylpyrimidine kinase  27.82 
 
 
282 aa  97.8  3e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0556569  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1305  phosphomethylpyrimidine kinase  27.86 
 
 
323 aa  97.4  4e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.279698  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0915  phosphomethylpyrimidine kinase  26.94 
 
 
274 aa  97.4  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.522742  normal  0.315595 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0143  phosphomethylpyrimidine kinase  29.69 
 
 
281 aa  97.1  5e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1140  phosphomethylpyrimidine kinase  28.63 
 
 
257 aa  97.1  5e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.837771 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0649  phosphomethylpyrimidine kinase  27.97 
 
 
267 aa  97.1  5e-19  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0890915  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2378  phosphomethylpyrimidine kinase  25.1 
 
 
266 aa  96.7  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.305846  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1636  phosphomethylpyrimidine kinase  23.88 
 
 
499 aa  96.7  7e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0431333  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10848  probable phosphomethylpyrimidine kinase (ThiD)  28.9 
 
 
269 aa  96.7  7e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0191434  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1124  phosphomethylpyrimidine kinase  32.79 
 
 
270 aa  96.3  8e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09330  phosphomethylpyrimidine kinase  26.25 
 
 
264 aa  96.3  9e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.387333 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0091  phosphomethylpyrimidine kinase  28.17 
 
 
270 aa  96.3  9e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2627  phosphomethylpyrimidine kinase  27.91 
 
 
279 aa  95.9  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27340  multifunctional hydroxymethylpyrimidine phosphokinase/4-amino-5-aminomethyl-2-methylpyrimidine hydrolase  23.51 
 
 
599 aa  95.9  1e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1700  phosphomethylpyrimidine kinase  28.03 
 
 
273 aa  94.7  2e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.847021  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3577  phosphomethylpyrimidine kinase  26.07 
 
 
266 aa  95.1  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.385467 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0139  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  23.61 
 
 
398 aa  94.7  2e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1311  Phosphomethylpyrimidine kinase  29.65 
 
 
242 aa  94.7  2e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.275611  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2909  phosphomethylpyrimidine kinase  29.71 
 
 
497 aa  95.1  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.112824 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2333  phosphomethylpyrimidine kinase  25.48 
 
 
266 aa  94.7  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0137  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  23.61 
 
 
398 aa  94.7  2e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2289  phosphomethylpyrimidine kinase  25.1 
 
 
266 aa  95.5  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.426705  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2490  phosphomethylpyrimidine kinase  25.1 
 
 
266 aa  95.5  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1321  phosphomethylpyrimidine kinase  25.57 
 
 
266 aa  94.7  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2470  phosphomethylpyrimidine kinase  26.25 
 
 
280 aa  94.7  3e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.176006  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2392  multifunctional hydroxymethylpyrimidine phosphokinase/4-amino-5-aminomethyl-2-methylpyrimidine hydrolase  26.79 
 
 
531 aa  94.4  3e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0171536  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>