33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1311 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_1311  hypothetical protein  100 
 
 		 78 aa  158  2e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.174745  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1221  hypothetical protein  51.35 
 
 		 193 aa  80.1  0.000000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0930619 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3238  hypothetical protein  48 
 
 		 199 aa  73.2  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.112934  normal  0.19984 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1034  hypothetical protein  48.61 
 
 		 323 aa  65.9  0.0000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00255835 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0828  phosphomethylpyrimidine kinase  47.3 
 
 		 452 aa  60.1  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3501  hydroxymethylpyrimidine kinase  47.22 
 
 		 448 aa  58.9  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.604187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2182  phosphomethylpyrimidine kinase  41.67 
 
 		 456 aa  56.6  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0022  transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 		 298 aa  55.8  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.55201  normal  0.925385 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2413  transcriptional regulator, XRE family  39.19 
 
 		 299 aa  54.7  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2715  transcriptional regulator, XRE family  40.58 
 
 		 299 aa  54.7  0.0000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.603714  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0564  hypothetical protein  41.89 
 
 		 179 aa  55.1  0.0000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1460  phosphomethylpyrimidine kinase  50.91 
 
 		 182 aa  54.3  0.0000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0434  transcriptional regulator, XRE family  40.3 
 
 		 309 aa  52.8  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.463605  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2166  hypothetical protein  40.68 
 
 		 304 aa  52.4  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00217357 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1448  Phosphomethylpyrimidine kinase  38.24 
 
 		 314 aa  50.4  0.000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00994121  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2542  transcriptional regulator, XRE family  35.14 
 
 		 307 aa  50.4  0.000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0069  phosphomethylpyrimidine kinase  35.14 
 
 		 320 aa  49.7  0.00001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.844231  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1881  phosphomethylpyrimidine kinase  50.82 
 
 		 444 aa  49.3  0.00002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.000178657  normal  0.46671 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1419  phosphomethylpyrimidine kinase  50.82 
 
 		 450 aa  49.3  0.00002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.528826 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0446  DNA binding protein  35.14 
 
 		 306 aa  48.1  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.407825 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2411  HTH DNA-binding protein  36.23 
 
 		 307 aa  47.8  0.00005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0357343  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0697  AIR synthase related protein-like  36.21 
 
 		 528 aa  47.4  0.00006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000561591  hitchhiker  0.000000203748 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0240  phosphomethylpyrimidine kinase  46.77 
 
 		 449 aa  46.6  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.180045 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1352  HTH DNA-binding protein  33.78 
 
 		 306 aa  46.2  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.111494 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1282  phosphomethylpyrimidine kinase  40.68 
 
 		 461 aa  45.1  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3232  phosphomethylpyrimidine kinase  40.68 
 
 		 453 aa  45.4  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1469  Phosphomethylpyrimidine kinase  40.54 
 
 		 299 aa  45.1  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1029  AIR synthase-like protein  43.64 
 
 		 465 aa  43.5  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0402037  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1022  Phosphomethylpyrimidine kinase  39.19 
 
 		 190 aa  42.4  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1419  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  41.07 
 
 		 411 aa  42.7  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1594  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  38.6 
 
 		 399 aa  41.6  0.004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0839  phosphomethylpyrimidine kinase  42.62 
 
 		 449 aa  41.2  0.005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.218839 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2988  phosphomethylpyrimidine kinase  40.68 
 
 		 461 aa  40.4  0.009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>