22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1934 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_1934  hypothetical protein  100 
 
 		 289 aa  585  1e-166  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0839  hypothetical protein  71.28 
 
 		 290 aa  434  1e-121  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.660796  normal  0.142658 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1384  hypothetical protein  67.47 
 
 		 289 aa  426  1e-118  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0941  hypothetical protein  65.05 
 
 		 290 aa  399  9.999999999999999e-111  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2166  hypothetical protein  29.05 
 
 		 304 aa  131  1.0000000000000001e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00217357 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1034  hypothetical protein  34.77 
 
 		 323 aa  124  2e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00255835 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1448  Phosphomethylpyrimidine kinase  30.98 
 
 		 314 aa  123  3e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00994121  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2413  transcriptional regulator, XRE family  28 
 
 		 299 aa  86.7  5e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0022  transcriptional regulator, XRE family  28.96 
 
 		 298 aa  79.7  0.00000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.55201  normal  0.925385 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2542  transcriptional regulator, XRE family  27.69 
 
 		 307 aa  79  0.00000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0434  transcriptional regulator, XRE family  27.69 
 
 		 309 aa  76.6  0.0000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.463605  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2715  transcriptional regulator, XRE family  28.23 
 
 		 299 aa  76.6  0.0000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.603714  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1469  Phosphomethylpyrimidine kinase  27 
 
 		 299 aa  73.2  0.000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2411  HTH DNA-binding protein  24.44 
 
 		 307 aa  69.7  0.00000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0357343  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1352  HTH DNA-binding protein  25.17 
 
 		 306 aa  67.4  0.0000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.111494 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0069  phosphomethylpyrimidine kinase  26.14 
 
 		 320 aa  66.6  0.0000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.844231  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0446  DNA binding protein  24.03 
 
 		 306 aa  63.9  0.000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.407825 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0176  hypothetical protein  29.75 
 
 		 119 aa  54.3  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1460  phosphomethylpyrimidine kinase  31.54 
 
 		 182 aa  51.6  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0828  phosphomethylpyrimidine kinase  24.66 
 
 		 452 aa  48.5  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1410  transcriptional regulator-like protein  29.36 
 
 		 116 aa  46.2  0.0006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000126907  hitchhiker  0.000639527 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1910  conserved hypothetical protein  35.29 
 
 		 122 aa  42.4  0.008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>