More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_0362 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007577  PMT9312_0362  phosphomethylpyrimidine kinase  100 
 
 
259 aa  523  1e-147  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03941  phosphomethylpyrimidine kinase  91.12 
 
 
259 aa  451  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03951  phosphomethylpyrimidine kinase  89.58 
 
 
259 aa  441  1e-123  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.941064  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04031  phosphomethylpyrimidine kinase  77.99 
 
 
262 aa  395  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.278475  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5022  phosphomethylpyrimidine kinase  47.1 
 
 
271 aa  222  4e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0366  phosphomethylpyrimidine kinase  49.42 
 
 
274 aa  214  9.999999999999999e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4277  phosphomethylpyrimidine kinase  47.47 
 
 
279 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2379  phosphomethylpyrimidine kinase  48.46 
 
 
263 aa  212  4.9999999999999996e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.17679 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2522  phosphomethylpyrimidine kinase  42.37 
 
 
262 aa  211  1e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3765  phosphomethylpyrimidine kinase  47.66 
 
 
278 aa  209  3e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0235015 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3519  phosphomethylpyrimidine kinase  47.47 
 
 
275 aa  207  1e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.728069  normal  0.293659 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2049  phosphomethylpyrimidine kinase  45.95 
 
 
261 aa  203  2e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.281496  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1830  phosphomethylpyrimidine kinase  45.95 
 
 
261 aa  202  3e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09330  phosphomethylpyrimidine kinase  45.53 
 
 
264 aa  203  3e-51  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.387333 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2331  phosphomethylpyrimidine kinase  41.02 
 
 
288 aa  203  3e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1915  phosphomethylpyrimidine kinase  45.56 
 
 
261 aa  202  5e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0853  phosphomethylpyrimidine kinase  41.76 
 
 
288 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.114242  normal  0.0282488 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0997  phosphomethylpyrimidine kinase  41.76 
 
 
288 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00609101  normal  0.106083 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2517  phosphomethylpyrimidine kinase  40.47 
 
 
260 aa  197  9e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1153  phosphomethylpyrimidine kinase  42.02 
 
 
272 aa  196  2.0000000000000003e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0935315  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1992  phosphomethylpyrimidine kinase  40.86 
 
 
270 aa  196  3e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2470  phosphomethylpyrimidine kinase  43.75 
 
 
280 aa  195  5.000000000000001e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.176006  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2710  phosphomethylpyrimidine kinase  39.84 
 
 
266 aa  195  7e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.227545  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0071  phosphomethylpyrimidine kinase  43.58 
 
 
267 aa  194  8.000000000000001e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02031  phosphomethylpyrimidine kinase  39.06 
 
 
266 aa  194  2e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1554  phosphomethylpyrimidine kinase  39.06 
 
 
266 aa  194  2e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01995  hypothetical protein  39.06 
 
 
266 aa  194  2e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2239  phosphomethylpyrimidine kinase  39.06 
 
 
266 aa  194  2e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1135  phosphomethylpyrimidine kinase  39.06 
 
 
266 aa  194  2e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.878652  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0961  phosphomethylpyrimidine kinase  39.06 
 
 
266 aa  194  2e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2391  phosphomethylpyrimidine kinase  39.06 
 
 
266 aa  194  2e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1544  phosphomethylpyrimidine kinase  39.06 
 
 
266 aa  194  2e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3082  phosphomethylpyrimidine kinase  39.06 
 
 
266 aa  193  3e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.190737 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1397  phosphomethylpyrimidine kinase  44.14 
 
 
265 aa  192  4e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000385147  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4984  phosphomethylpyrimidine kinase  38.7 
 
 
268 aa  191  1e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.702252  normal  0.243702 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0565  phosphomethylpyrimidine kinase  45.91 
 
 
264 aa  191  1e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00127347  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1688  phosphomethylpyrimidine kinase  43.72 
 
 
269 aa  190  2e-47  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.268945  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0366  phosphomethylpyrimidine kinase  40.15 
 
 
266 aa  189  4e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.437548 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2438  phosphomethylpyrimidine kinase  41.67 
 
 
264 aa  189  4e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.674981  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2435  phosphomethylpyrimidine kinase  42.58 
 
 
285 aa  189  4e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.884635  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1619  phosphomethylpyrimidine kinase  43.32 
 
 
269 aa  189  5e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.123369  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2061  phosphomethylpyrimidine kinase  39.45 
 
 
260 aa  188  5.999999999999999e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0150754  normal  0.0985623 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2250  phosphomethylpyrimidine kinase  39.77 
 
 
268 aa  188  7e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.660572  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2378  phosphomethylpyrimidine kinase  37.89 
 
 
266 aa  188  7e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.305846  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0452  phosphomethylpyrimidine kinase  39.53 
 
 
436 aa  187  1e-46  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.70912 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0486  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  40.78 
 
 
277 aa  187  1e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2289  phosphomethylpyrimidine kinase  37.89 
 
 
266 aa  186  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.426705  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0647  phosphomethylpyrimidine kinase  42.5 
 
 
264 aa  186  2e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2490  phosphomethylpyrimidine kinase  37.89 
 
 
266 aa  186  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4934  phosphomethylpyrimidine kinase  38.31 
 
 
268 aa  186  3e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.566917  normal  0.666851 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0240  phosphomethylpyrimidine kinase  39.6 
 
 
449 aa  186  4e-46  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.180045 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1014  phosphomethylpyrimidine kinase  40.94 
 
 
279 aa  186  4e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0918  phosphomethylpyrimidine kinase  41.8 
 
 
269 aa  186  4e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2333  phosphomethylpyrimidine kinase  37.5 
 
 
266 aa  186  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4470  phosphomethylpyrimidine kinase  38.31 
 
 
268 aa  185  6e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.668119  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2046  phosphomethylpyrimidine kinase  40.89 
 
 
266 aa  185  7e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4453  phosphomethylpyrimidine kinase  39 
 
 
270 aa  184  1.0000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.800707  normal  0.352817 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2382  phosphomethylpyrimidine kinase  37.5 
 
 
266 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.779831 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1203  phosphomethylpyrimidine kinase  37.11 
 
 
266 aa  184  1.0000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.564031  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1765  phosphomethylpyrimidine kinase  44.92 
 
 
260 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.962126  normal  0.24244 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0706  phosphomethylpyrimidine kinase  45.28 
 
 
268 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3091  phosphomethylpyrimidine kinase  36.72 
 
 
266 aa  183  2.0000000000000003e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0488797  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0644  phosphomethylpyrimidine kinase  41.32 
 
 
270 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0888  phosphomethylpyrimidine kinase  41.74 
 
 
270 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000310773  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5600  hydroxy-methylpyrimidine kinase /hydroxy-phosphomethylpyrimidine kinase  39.31 
 
 
266 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429432  normal  0.105983 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0700  phosphomethylpyrimidine kinase  41.32 
 
 
270 aa  182  3e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0644  phosphomethylpyrimidine kinase  41.32 
 
 
270 aa  182  3e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0811  phosphomethylpyrimidine kinase  41.32 
 
 
270 aa  182  3e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46467e-47 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0734  phosphomethylpyrimidine kinase  41.32 
 
 
270 aa  182  3e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.24669  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1670  phosphomethylpyrimidine kinase  42.91 
 
 
260 aa  183  3e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.42362 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0804  phosphomethylpyrimidine kinase  41.32 
 
 
270 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.088589  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4540  phosphomethylpyrimidine kinase  41.8 
 
 
270 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.48056 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2787  phosphomethylpyrimidine kinase  39.92 
 
 
268 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0741888  normal  0.0618431 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0791  phosphomethylpyrimidine kinase  41.8 
 
 
270 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1321  phosphomethylpyrimidine kinase  36.72 
 
 
266 aa  182  5.0000000000000004e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2979  phosphomethylpyrimidine kinase  35.94 
 
 
267 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3328  phosphomethylpyrimidine kinase  38.96 
 
 
303 aa  181  7e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1628  phosphomethylpyrimidine kinase  37.79 
 
 
266 aa  181  7e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.522982  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1700  phosphomethylpyrimidine kinase  38.13 
 
 
273 aa  181  8.000000000000001e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.847021  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1082  phosphomethylpyrimidine kinase  39.31 
 
 
271 aa  181  8.000000000000001e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.457786 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3651  phosphomethylpyrimidine kinase  38.96 
 
 
303 aa  181  1e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1102  phosphomethylpyrimidine kinase  39.85 
 
 
271 aa  181  1e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0215379  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3851  phosphomethylpyrimidine kinase  41.49 
 
 
497 aa  180  2e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1938  phosphomethylpyrimidine kinase  38.71 
 
 
267 aa  180  2e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0695148  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0372  phosphomethylpyrimidine kinase  41.06 
 
 
285 aa  179  4.999999999999999e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.591258  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0650  phosphomethylpyrimidine kinase  41.15 
 
 
273 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.797575  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3577  phosphomethylpyrimidine kinase  36.72 
 
 
266 aa  178  8e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.385467 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1443  phosphomethylpyrimidine kinase  40.08 
 
 
269 aa  178  8e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.600581  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1301  phosphomethylpyrimidine kinase  35.16 
 
 
267 aa  178  9e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.185406  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1191  phosphomethylpyrimidine kinase  36.82 
 
 
267 aa  177  1e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.16328  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1498  phosphomethylpyrimidine kinase  41.34 
 
 
257 aa  178  1e-43  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.315358  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2711  phosphomethylpyrimidine kinase  35.94 
 
 
267 aa  177  1e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.725967  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2909  phosphomethylpyrimidine kinase  40.42 
 
 
497 aa  177  2e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.112824 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0542  phosphomethylpyrimidine kinase  42.11 
 
 
432 aa  177  2e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3167  phosphomethylpyrimidine kinase  38.17 
 
 
263 aa  176  2e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17923  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3496  phosphomethylpyrimidine kinase  38.84 
 
 
268 aa  177  2e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.828772  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1583  phosphomethylpyrimidine kinase  38.34 
 
 
264 aa  177  2e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.152097  normal  0.0340338 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2095  phosphomethylpyrimidine kinase  40.7 
 
 
285 aa  177  2e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.376648  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1419  phosphomethylpyrimidine kinase  36.58 
 
 
450 aa  177  2e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.528826 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0840  phosphomethylpyrimidine kinase  37.98 
 
 
265 aa  176  3e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>