More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_0392 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_0392  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  100 
 
 
375 aa  723    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2694  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  97.6 
 
 
375 aa  649    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.442874  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0413  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  97.6 
 
 
375 aa  649    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.232959  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0331  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  90.3 
 
 
374 aa  595  1e-169  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0340  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  89.28 
 
 
374 aa  588  1e-167  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.502306  normal  0.460006 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3511  thiamine-phosphate diphosphorylase  90.88 
 
 
374 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.155888  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0316  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  88.52 
 
 
371 aa  557  1e-157  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.416769  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3736  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  72.83 
 
 
367 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1776  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  73.1 
 
 
367 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3705  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  73.1 
 
 
367 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3678  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  72.83 
 
 
367 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.336628  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3005  thiamin-phosphate pyrophosphorylase  70.92 
 
 
364 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2777  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  73.1 
 
 
367 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3227  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  73.1 
 
 
367 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0386  putative thiamin-phosphate pyrophosphorylase, ThiE  63.09 
 
 
367 aa  425  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3572  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  62.53 
 
 
367 aa  395  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.480222  hitchhiker  0.0000254394 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2771  thiamine-phosphate diphosphorylase  60.11 
 
 
375 aa  390  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.207667  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2727  thiamin-phosphate pyrophosphorylase  82.23 
 
 
216 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0361  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  45.2 
 
 
500 aa  233  6e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3871  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  56.04 
 
 
211 aa  220  3.9999999999999997e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0219  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  52.91 
 
 
213 aa  215  9.999999999999999e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0206  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  55.12 
 
 
211 aa  215  9.999999999999999e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0267078 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0215  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  52.43 
 
 
213 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.817852  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0346  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  50.91 
 
 
224 aa  214  1.9999999999999998e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2591  phosphomethylpyrimidine kinase  43.68 
 
 
535 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0347459 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0283  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  54.59 
 
 
212 aa  213  3.9999999999999995e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00513591 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4373  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  56.57 
 
 
211 aa  213  5.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4406  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  57.07 
 
 
211 aa  212  7e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4495  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  56.78 
 
 
211 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.539006  hitchhiker  0.0000191197 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4493  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  56.78 
 
 
211 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0244501 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0454  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  50.45 
 
 
224 aa  211  1e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000016732 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3716  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  54.11 
 
 
211 aa  211  1e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0463908  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4227  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  55.12 
 
 
211 aa  210  3e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4484  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  54.63 
 
 
211 aa  210  4e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5461  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  54.15 
 
 
211 aa  209  5e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.262167 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0209  thiamine-phosphate diphosphorylase  44.6 
 
 
378 aa  209  5e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.418209  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3854  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  52.4 
 
 
215 aa  209  5e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4441  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  53.66 
 
 
211 aa  209  9e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000235463 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03870  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  54.15 
 
 
211 aa  207  2e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4535  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  54.15 
 
 
211 aa  207  2e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03823  hypothetical protein  54.15 
 
 
211 aa  207  2e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4032  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  54.15 
 
 
211 aa  207  2e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00913543 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4569  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  55.56 
 
 
211 aa  207  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00615742 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3322  thiamine monophosphate synthase  47.45 
 
 
384 aa  206  7e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4001  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  53.66 
 
 
211 aa  204  2e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3290  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  51.37 
 
 
307 aa  204  2e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.33776 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4311  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  49.8 
 
 
314 aa  204  3e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.411869  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2467  thiamine-phosphate diphosphorylase  49.41 
 
 
312 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.371081  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0166  thiamine monophosphate synthase  42.5 
 
 
376 aa  201  3e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3646  thiamine monophosphate synthase  42.37 
 
 
384 aa  199  5e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2391  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  43.4 
 
 
513 aa  199  7.999999999999999e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0637429  normal  0.579661 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1457  hypothetical protein  40.71 
 
 
488 aa  199  9e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1526  hypothetical protein  40.79 
 
 
488 aa  198  1.0000000000000001e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2451  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.52 
 
 
440 aa  198  1.0000000000000001e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2382  phosphomethylpyrimidine kinase  40.78 
 
 
530 aa  197  3e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1882  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  42.28 
 
 
565 aa  195  1e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2096  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  42.65 
 
 
565 aa  195  1e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2444  phosphomethylpyrimidine kinase/thiamin-phosphate pyrophosphorylase, putative  44.11 
 
 
526 aa  194  2e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1937  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  42.55 
 
 
560 aa  193  3e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0023  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  55.33 
 
 
213 aa  193  3e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.564168  normal  0.364212 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0892  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  43.49 
 
 
308 aa  192  5e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000295383  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1771  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.39 
 
 
613 aa  192  8e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0254  phosphomethylpyrimidine kinase/thiamin-phosphate pyrophosphorylase  40.89 
 
 
529 aa  190  4e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2200  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.01 
 
 
559 aa  190  4e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0041  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  56.12 
 
 
215 aa  189  5.999999999999999e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1745  hydroxymethylpyrimidine kinase  40.55 
 
 
479 aa  189  8e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0108  thiamine-phosphate pyrophosphorylase protein  52.75 
 
 
383 aa  188  1e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.244017  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0441  thiamine-phosphate pyrophosphorylase/thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.55 
 
 
479 aa  188  1e-46  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00801461  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3071  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  49.61 
 
 
302 aa  189  1e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.047455  normal  0.645558 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2014  phosphomethylpyrimidine kinase, thiamine-phosphate diphosphorylase  42.08 
 
 
557 aa  188  2e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.50038 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002073  thiamin-phosphate pyrophosphorylase  46.83 
 
 
471 aa  183  3e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1939  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  47.97 
 
 
309 aa  182  1e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.850438  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2395  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  45.96 
 
 
309 aa  182  1e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1783  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  47.97 
 
 
309 aa  182  1e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00365  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  45.85 
 
 
471 aa  181  2e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0042  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  46.23 
 
 
214 aa  181  2e-44  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00145  Thiamine monophosphate synthase  47.45 
 
 
526 aa  178  1e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2984  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  47.37 
 
 
226 aa  177  2e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1923  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  43.11 
 
 
637 aa  176  5e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2025  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.37 
 
 
650 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00308953 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2023  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  42.55 
 
 
650 aa  173  5e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2438  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.63 
 
 
632 aa  173  5e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2322  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.63 
 
 
632 aa  173  5e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.756854  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1859  phosphomethylpyrimidine kinase/thiamine-phosphate diphosphorylase  49.76 
 
 
525 aa  169  1e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1935  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  45.26 
 
 
612 aa  162  9e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0208  thiamine monophosphate synthase  40.11 
 
 
349 aa  160  3e-38  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.287057  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0893  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.96 
 
 
244 aa  156  7e-37  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.401641  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2565  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  47.49 
 
 
206 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.795825  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1417  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  47.8 
 
 
208 aa  152  7e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2095  phosphomethylpyrimidine kinase  47.25 
 
 
581 aa  151  2e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2163  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  48.31 
 
 
201 aa  149  6e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.460146  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0214  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  45.65 
 
 
203 aa  147  2.0000000000000003e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0281  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  42.86 
 
 
209 aa  147  3e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0205  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  45.11 
 
 
203 aa  145  2e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4170  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  46.15 
 
 
201 aa  144  3e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.623908  normal  0.52609 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0911  thiamine-phosphate diphosphorylase  43.41 
 
 
199 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.307572  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3653  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  42.31 
 
 
198 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0442  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.55 
 
 
201 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0012  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  45.6 
 
 
202 aa  140  3e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.170597  normal  0.127003 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0144  thiamine-phosphate diphosphorylase  40.53 
 
 
218 aa  140  3e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>