More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1405 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_1405  thiamine monophosphate synthase  100 
 
 
213 aa  427  1e-119  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1531  thiamine monophosphate synthase  52.2 
 
 
212 aa  221  4.9999999999999996e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1499  thiamine monophosphate synthase  52.26 
 
 
215 aa  206  1e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1006  Thiamine-phosphate diphosphorylase  51.46 
 
 
216 aa  192  2e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1283  Thiamine-phosphate diphosphorylase  46.83 
 
 
212 aa  186  3e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.8635  normal  0.783471 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0815  thiamine-phosphate pyrophosphorylase, putative  47.2 
 
 
224 aa  183  2.0000000000000003e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.339712  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0959  thiamine-phosphate pyrophosphorylase, putative  45.45 
 
 
214 aa  155  4e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.277889  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2935  thiamine monophosphate synthase  43.71 
 
 
213 aa  127  9.000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.571154  hitchhiker  5.39936e-16 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3660  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.24 
 
 
220 aa  125  6e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0370  Thiamine-phosphate diphosphorylase  38.06 
 
 
183 aa  115  5e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000380325  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0037  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.56 
 
 
206 aa  115  6.9999999999999995e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2096  Thiamine-phosphate diphosphorylase  34.8 
 
 
208 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.255661  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0547  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  45.33 
 
 
178 aa  109  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000291317  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0607  thiamin biosynthesis protein  38.24 
 
 
208 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.380998  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2395  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.63 
 
 
252 aa  108  6e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.718702  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1282  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.65 
 
 
206 aa  108  8.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.536618  normal  0.780941 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1173  Thiamine-phosphate diphosphorylase  34.94 
 
 
185 aa  107  1e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1379  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.06 
 
 
215 aa  105  6e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000146383  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0587  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  43.07 
 
 
213 aa  105  7e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.819904  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3476  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.47 
 
 
223 aa  105  7e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0457508  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0665  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.42 
 
 
218 aa  104  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.3513e-26 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0652  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.09 
 
 
218 aa  103  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.614638  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0645  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.46 
 
 
216 aa  103  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0144  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.86 
 
 
344 aa  103  2e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0566  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.13 
 
 
211 aa  102  5e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000752501  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1348  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.58 
 
 
206 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4121  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.42 
 
 
228 aa  99.8  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00354479 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0816  thiamine monophosphate synthase  34.87 
 
 
217 aa  97.4  1e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.380112  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1691  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.44 
 
 
209 aa  97.8  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0247781  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1500  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.5 
 
 
207 aa  97.1  2e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3318  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.96 
 
 
220 aa  95.9  4e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.195577  normal  0.0232291 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2520  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.95 
 
 
207 aa  95.1  7e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1927  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.21 
 
 
236 aa  94.4  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0119683 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1657  hypothetical protein  37.66 
 
 
210 aa  94.7  1e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000901813 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1712  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.76 
 
 
220 aa  94.4  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0573115  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0604  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.54 
 
 
536 aa  94.4  1e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1934  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.87 
 
 
212 aa  93.2  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0958  thiamine monophosphate synthase  36.41 
 
 
212 aa  92.8  3e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.578889  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0601  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.48 
 
 
356 aa  93.2  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1532  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.58 
 
 
206 aa  92  5e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2516  thiamine-phosphate diphosphorylase  36.03 
 
 
203 aa  92  6e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.138551  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0061  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.77 
 
 
205 aa  91.7  8e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0221396  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0641  thiamine-phosphate diphosphorylase  32.37 
 
 
209 aa  91.7  8e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0370584  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1824  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.81 
 
 
222 aa  91.7  8e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.106561 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0929  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.14 
 
 
211 aa  91.3  9e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.013677  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1463  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.06 
 
 
211 aa  91.3  9e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1683  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.39 
 
 
218 aa  91.3  9e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000047745  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2162  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.44 
 
 
210 aa  90.9  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00137501  hitchhiker  0.0000728866 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1005  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.5 
 
 
202 aa  91.3  1e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1155  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.48 
 
 
197 aa  90.5  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00149529  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2103  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  29.32 
 
 
219 aa  90.5  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.191843 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0116  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.4 
 
 
205 aa  90.5  2e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1989  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.64 
 
 
210 aa  89.7  3e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1337  Thiamine-phosphate diphosphorylase  36.62 
 
 
203 aa  89.4  4e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.397681  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1918  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.4 
 
 
212 aa  89  5e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1811  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.59 
 
 
221 aa  88.6  6e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.645451  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2471  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.77 
 
 
219 aa  88.6  6e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.232112  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3286  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.48 
 
 
214 aa  88.6  6e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000497087  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0081  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.17 
 
 
215 aa  88.2  9e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000869  thiamin-phosphate pyrophosphorylase  28.75 
 
 
204 aa  87.4  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0093  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.17 
 
 
222 aa  87.8  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000282535  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1628  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.53 
 
 
205 aa  86.7  2e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.40521  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0372  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  28.42 
 
 
219 aa  87  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000497058  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0075  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.17 
 
 
222 aa  87.4  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3166  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.65 
 
 
221 aa  87  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.040851  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0786  transcriptional regulator TenI  34.59 
 
 
206 aa  86.3  4e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.520662  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13191  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.32 
 
 
343 aa  85.9  4e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.422887 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0246  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.78 
 
 
222 aa  85.9  4e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3007  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.18 
 
 
213 aa  85.5  6e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3030  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.65 
 
 
226 aa  85.5  6e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0235882  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2484  Thiamine-phosphate diphosphorylase  36.65 
 
 
230 aa  85.1  8e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.336638  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06844  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  29.49 
 
 
204 aa  84.7  9e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2041  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.14 
 
 
208 aa  84.3  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3406  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.72 
 
 
203 aa  84.3  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.405155  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4827  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.13 
 
 
224 aa  84.3  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2347  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.28 
 
 
221 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0730  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  27.07 
 
 
216 aa  84  0.000000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0124065  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1660  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  29.76 
 
 
223 aa  84  0.000000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1435  Thiamine-phosphate diphosphorylase  41.96 
 
 
203 aa  84  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00770563  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0610  transcriptional regulator TenI  36.18 
 
 
202 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4410  thiamine monophosphate synthase  32.34 
 
 
210 aa  83.6  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0695  transcriptional regulator TenI  33.51 
 
 
206 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0639  transcriptional regulator TenI  33.51 
 
 
206 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0639  transcriptional regulator TenI  33.51 
 
 
206 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0806  transcriptional regulator TenI  33.51 
 
 
206 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.563560000000001e-47 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0883  transcriptional regulator TenI  34.05 
 
 
206 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000389091  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0729  transcriptional regulator TenI  33.51 
 
 
206 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0076  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.41 
 
 
215 aa  82.8  0.000000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0077197  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4545  transcriptional regulator TenI  33.51 
 
 
206 aa  82.8  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.467462  normal  0.671743 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0799  transcriptional regulator TenI  33.51 
 
 
206 aa  82.4  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1223  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  28.57 
 
 
217 aa  82  0.000000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0896  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.39 
 
 
352 aa  82  0.000000000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.833365  normal  0.686436 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0261  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.5 
 
 
211 aa  81.6  0.000000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.243144  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0353  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.32 
 
 
219 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6680  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  27.78 
 
 
211 aa  81.3  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.842807  normal  0.587855 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4884  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.77 
 
 
218 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3286  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.64 
 
 
211 aa  80.9  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.450735  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3508  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.21 
 
 
223 aa  80.9  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0511603  normal  0.415354 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5047  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  29.51 
 
 
379 aa  80.9  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.554063  normal  0.412974 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0616  transcriptional regulator TenI  34.55 
 
 
206 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>