105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0434 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0434  thiamine monophosphate synthase  100 
 
 		 178 aa  334  5e-91  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.61207  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2855  thiamine monophosphate synthase  49.11 
 
 		 178 aa  101  7e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0770384  normal  0.045909 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3023  thiamine monophosphate synthase  42.78 
 
 		 208 aa  67  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3747  thiamine monophosphate synthase  58.33 
 
 		 194 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.907624  normal  0.127935 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4514  thiamine monophosphate synthase  60 
 
 		 194 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3850  thiamine monophosphate synthase  60 
 
 		 194 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3677  thiamine monophosphate synthase  60 
 
 		 194 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.62971  normal  0.140239 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5573  thiamine monophosphate synthase  58.33 
 
 		 194 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.173749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1467  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase ThiE  48.94 
 
 		 209 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1664  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase ThiE  48.94 
 
 		 209 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2440  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase ThiE  48.94 
 
 		 209 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.363141  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0319  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase ThiE  48.94 
 
 		 209 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0583  thiamine-phosphate pyrophosphorylase ThiE, putative  48.94 
 
 		 196 aa  64.7  0.0000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2576  thiamine monophosphate synthase  48.94 
 
 		 209 aa  64.7  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0287  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase ThiE  48.94 
 
 		 196 aa  64.7  0.0000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.519508  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0878  dGTP-pyrophosphohydrolase; thiamine phosphate synthase  48.94 
 
 		 196 aa  64.7  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2246  thiamine monophosphate synthase  58.33 
 
 		 194 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0548714 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0027  hypothetical protein  56.9 
 
 		 312 aa  62.4  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.132128 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4895  thiamine monophosphate synthase  56.67 
 
 		 194 aa  62  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166292 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2053  thiamine monophosphate synthase  54.41 
 
 		 169 aa  59.3  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0504215  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0405  hypothetical protein  43.66 
 
 		 320 aa  59.3  0.00000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0465  hypothetical protein  43.21 
 
 		 320 aa  56.6  0.0000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0403  mutator MutT protein  50 
 
 		 329 aa  56.2  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0220424 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0227  mutator mutT protein/thiamine-phosphate pyrophosphorylase family protein  50 
 
 		 329 aa  56.2  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.199837  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2189  thiamine monophosphate synthase  36.84 
 
 		 315 aa  55.5  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.988337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1996  NUDIX hydrolase  45.76 
 
 		 352 aa  55.1  0.0000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.42027  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0984  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase protein  50.85 
 
 		 198 aa  52.8  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.462651 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4971  hypothetical protein  41.03 
 
 		 315 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2096  Thiamine-phosphate diphosphorylase  45.31 
 
 		 208 aa  53.1  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.255661  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1173  Thiamine-phosphate diphosphorylase  37.66 
 
 		 185 aa  52.4  0.000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2953  thiamine monophosphate synthase  29.52 
 
 		 194 aa  52.4  0.000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3462  phosphomethylpyrimidine kinase  29.41 
 
 		 484 aa  52  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57190  hypothetical protein  39.74 
 
 		 315 aa  51.6  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1284  thiamine monophosphate synthase  36.25 
 
 		 202 aa  50.8  0.000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0306  hypothetical protein  31.15 
 
 		 321 aa  50.4  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0781  mutator MutT protein  37.4 
 
 		 317 aa  50.4  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0134531  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2025  mutator MutT protein  37.16 
 
 		 322 aa  50.1  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.153674  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1604  NUDIX hydrolase  55.26 
 
 		 369 aa  50.1  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000210752  hitchhiker  0.0000224711 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13370  hypothetical protein  44.44 
 
 		 313 aa  49.7  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0633  thiamine monophosphate synthase  46.03 
 
 		 206 aa  49.3  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4276  thiamine monophosphate synthase  35 
 
 		 232 aa  49.3  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.046902  hitchhiker  0.00353536 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0144  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.52 
 
 		 344 aa  48.5  0.00005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2230  hypothetical protein  42.25 
 
 		 310 aa  48.1  0.00007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.328266  normal  0.270342 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7515  thiamine monophosphate synthase  54.24 
 
 		 232 aa  47.8  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248224  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3318  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  24.29 
 
 		 220 aa  47.4  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.195577  normal  0.0232291 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0592  hypothetical protein  40.43 
 
 		 316 aa  47  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1368  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  23.77 
 
 		 365 aa  47.4  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.524473  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0695  transcriptional regulator TenI  32.1 
 
 		 206 aa  47  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0639  transcriptional regulator TenI  32.1 
 
 		 206 aa  47  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0639  transcriptional regulator TenI  32.1 
 
 		 206 aa  47  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0729  transcriptional regulator TenI  32.1 
 
 		 206 aa  47  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1007  hypothetical protein  38.03 
 
 		 325 aa  46.2  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04356  hypothetical protein  39.44 
 
 		 302 aa  46.6  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0612  hypothetical protein  40.85 
 
 		 318 aa  47  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.362633  normal  0.329408 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0806  transcriptional regulator TenI  32.1 
 
 		 206 aa  47  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.563560000000001e-47 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3528  phosphomethylpyrimidine kinase  28.99 
 
 		 484 aa  46.2  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3706  hypothetical protein  40.85 
 
 		 314 aa  46.2  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.461385 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0616  transcriptional regulator TenI  32.43 
 
 		 206 aa  46.2  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0372  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  26.28 
 
 		 219 aa  46.2  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000497058  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0607  thiamin biosynthesis protein  33.57 
 
 		 208 aa  45.8  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.380998  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2179  hypothetical protein  41.67 
 
 		 314 aa  45.4  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.299804  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0645  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  29.32 
 
 		 216 aa  45.4  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1375  thiamine monophosphate synthase  24.84 
 
 		 218 aa  45.1  0.0005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1937  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.31 
 
 		 219 aa  45.4  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0505249  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0210  dGTP-pyrophosphohydrolase; thiamine phosphate synthase  40.91 
 
 		 212 aa  45.1  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0218369  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1502  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  27.37 
 
 		 346 aa  45.1  0.0006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.63479  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0773  thiamine monophosphate synthase  21.83 
 
 		 178 aa  45.1  0.0006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.158421  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1618  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.91 
 
 		 199 aa  44.7  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0786  transcriptional regulator TenI  31.08 
 
 		 206 aa  44.7  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.520662  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14351  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  20.35 
 
 		 353 aa  44.7  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4091  hypothetical protein  42.37 
 
 		 316 aa  44.3  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0604  thiamine-phosphate diphosphorylase  28.25 
 
 		 217 aa  44.3  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0199515  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4425  hypothetical protein  42.37 
 
 		 314 aa  43.5  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1238  thiamine monophosphate synthase  30 
 
 		 183 aa  43.9  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1686  NUDIX hydrolase  35.59 
 
 		 360 aa  43.9  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.873349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3885  thiamine monophosphate synthase  34.4 
 
 		 202 aa  44.3  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0091  thiamine monophosphate synthase  36.59 
 
 		 199 aa  43.9  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230715  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6768  thiamine monophosphate synthase  45.95 
 
 		 214 aa  43.9  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2015  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  46.55 
 
 		 204 aa  43.9  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.0030252  normal  0.0171267 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2763  phosphomethylpyrimidine kinase  26.06 
 
 		 492 aa  43.9  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00755044  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0883  transcriptional regulator TenI  31.08 
 
 		 206 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000389091  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0116  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.91 
 
 		 205 aa  43.9  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3166  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  27.66 
 
 		 221 aa  43.5  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.040851  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4397  mutT/nudix family protein  44.07 
 
 		 316 aa  43.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1507  NUDIX hydrolase  35.59 
 
 		 360 aa  42.7  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0858  hypothetical protein  39.68 
 
 		 317 aa  43.5  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3660  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  27.78 
 
 		 220 aa  42.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3659  hypothetical protein  42.31 
 
 		 316 aa  43.5  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.817347  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4545  transcriptional regulator TenI  31.25 
 
 		 206 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.467462  normal  0.671743 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1678  hypothetical protein  38.46 
 
 		 306 aa  42.7  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.552334  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0799  transcriptional regulator TenI  29.73 
 
 		 206 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1379  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.85 
 
 		 215 aa  42.4  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000146383  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0461  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  29.33 
 
 		 206 aa  42.7  0.003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.037147  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0665  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  27.86 
 
 		 218 aa  42.4  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.3513e-26 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2084  hypothetical protein  49.15 
 
 		 319 aa  42  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.498942 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0652  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  28.57 
 
 		 218 aa  42  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.614638  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2235  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  26.14 
 
 		 479 aa  42  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3851  phosphomethylpyrimidine kinase  27.03 
 
 		 497 aa  42  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0645  transcriptional regulator TenI  29.73 
 
 		 208 aa  42  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3633  thiamine monophosphate synthase  30.1 
 
 		 272 aa  41.6  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>