290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3885 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_3885  thiamine monophosphate synthase  100 
 
 
202 aa  382  1e-105  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4276  thiamine monophosphate synthase  84.54 
 
 
232 aa  303  9.000000000000001e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.046902  hitchhiker  0.00353536 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5258  thiamine monophosphate synthase  49.73 
 
 
192 aa  140  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0091  thiamine monophosphate synthase  56.59 
 
 
199 aa  135  5e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230715  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2226  thiamine monophosphate synthase  41.67 
 
 
213 aa  121  7e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.324904  normal  0.125752 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0577  Thiamine-phosphate diphosphorylase  45.83 
 
 
205 aa  116  3e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.818359  hitchhiker  0.00758657 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6768  thiamine monophosphate synthase  43.78 
 
 
214 aa  99.4  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0580  thiamine monophosphate synthase  37.61 
 
 
218 aa  96.7  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0613  thiamine monophosphate synthase  48.19 
 
 
205 aa  93.2  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.23108 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0602  thiamine monophosphate synthase  45.92 
 
 
205 aa  90.9  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.323651  normal  0.0553543 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3660  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.83 
 
 
220 aa  89.7  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0665  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.17 
 
 
218 aa  87.4  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.3513e-26 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3476  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.09 
 
 
223 aa  86.3  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0457508  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3402  thiamine monophosphate synthase  39.79 
 
 
197 aa  86.3  3e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0652  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.5 
 
 
218 aa  81.6  0.000000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.614638  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2935  thiamine monophosphate synthase  35.44 
 
 
213 aa  79.7  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.571154  hitchhiker  5.39936e-16 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7515  thiamine monophosphate synthase  46.04 
 
 
232 aa  77.8  0.00000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248224  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2395  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.71 
 
 
252 aa  77  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.718702  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0587  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.27 
 
 
213 aa  74.3  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.819904  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0370  Thiamine-phosphate diphosphorylase  28.81 
 
 
183 aa  73.9  0.000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000380325  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0929  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33 
 
 
211 aa  73.6  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.013677  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0227  mutator mutT protein/thiamine-phosphate pyrophosphorylase family protein  37.87 
 
 
329 aa  73.2  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.199837  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0403  mutator MutT protein  37.87 
 
 
329 aa  73.2  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0220424 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0607  thiamin biosynthesis protein  33.66 
 
 
208 aa  72.4  0.000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.380998  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2471  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.61 
 
 
219 aa  72.4  0.000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.232112  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3508  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.03 
 
 
223 aa  70.9  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0511603  normal  0.415354 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0984  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase protein  32.16 
 
 
198 aa  68.9  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.462651 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1811  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33 
 
 
221 aa  69.3  0.00000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.645451  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1348  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  45.24 
 
 
206 aa  68.9  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2103  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.65 
 
 
219 aa  68.6  0.00000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.191843 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2096  Thiamine-phosphate diphosphorylase  38.73 
 
 
208 aa  68.2  0.00000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.255661  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3007  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.8 
 
 
213 aa  67  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0037  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.16 
 
 
206 aa  67  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0027  hypothetical protein  40 
 
 
312 aa  66.2  0.0000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.132128 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4410  thiamine monophosphate synthase  30.43 
 
 
210 aa  65.9  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0829  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.5 
 
 
213 aa  65.9  0.0000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.982504  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1240  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.99 
 
 
216 aa  65.1  0.0000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2230  hypothetical protein  32.52 
 
 
310 aa  64.7  0.0000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.328266  normal  0.270342 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1463  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.02 
 
 
211 aa  64.3  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1927  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.03 
 
 
236 aa  64.3  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0119683 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2166  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  26.4 
 
 
213 aa  63.9  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00215489  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0641  thiamine-phosphate diphosphorylase  30.92 
 
 
209 aa  63.9  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0370584  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2128  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  26.4 
 
 
213 aa  63.9  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000263441  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3495  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.48 
 
 
206 aa  63.9  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1064  thiamine-phosphate pyrophosphorylase, putative  24.87 
 
 
201 aa  63.5  0.000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0633  thiamine monophosphate synthase  32.5 
 
 
206 aa  63.9  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1379  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.17 
 
 
215 aa  63.2  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000146383  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4827  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.99 
 
 
224 aa  62.4  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1187  thiamine-phosphate pyrophosphorylase, putative  24.34 
 
 
201 aa  62  0.000000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.242979  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2909  phosphomethylpyrimidine kinase  32.11 
 
 
497 aa  62  0.000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.112824 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4121  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.32 
 
 
228 aa  62  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00354479 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0306  hypothetical protein  30.06 
 
 
321 aa  61.2  0.000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2763  phosphomethylpyrimidine kinase  30.33 
 
 
492 aa  60.8  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00755044  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5993  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.85 
 
 
218 aa  60.1  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.554232 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02990  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.87 
 
 
215 aa  59.7  0.00000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0738  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase  24.6 
 
 
203 aa  59.7  0.00000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1824  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.2 
 
 
222 aa  58.9  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.106561 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1414  transcriptional regulator TenI  41.58 
 
 
201 aa  58.9  0.00000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2484  Thiamine-phosphate diphosphorylase  35.79 
 
 
230 aa  58.9  0.00000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.336638  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5047  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.85 
 
 
379 aa  58.5  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.554063  normal  0.412974 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0534  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.54 
 
 
226 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3659  hypothetical protein  39.53 
 
 
316 aa  57.8  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.817347  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3706  hypothetical protein  29.67 
 
 
314 aa  57  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.461385 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06844  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.85 
 
 
204 aa  56.6  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2162  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  29.78 
 
 
210 aa  56.6  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00137501  hitchhiker  0.0000728866 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0198  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.05 
 
 
237 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0144  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.11 
 
 
344 aa  56.6  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6680  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.26 
 
 
211 aa  56.6  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.842807  normal  0.587855 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2583  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  29.35 
 
 
360 aa  57  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2628  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  28.29 
 
 
234 aa  56.2  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0958  thiamine monophosphate synthase  34.95 
 
 
212 aa  55.8  0.0000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.578889  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16941  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  26.32 
 
 
350 aa  55.8  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2908  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  28.42 
 
 
368 aa  55.1  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0900  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.24 
 
 
219 aa  55.1  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1006  Thiamine-phosphate diphosphorylase  27.94 
 
 
216 aa  55.1  0.0000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0246  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.22 
 
 
222 aa  55.1  0.0000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2025  mutator MutT protein  35.37 
 
 
322 aa  54.7  0.0000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.153674  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0604  thiamine-phosphate diphosphorylase  29.9 
 
 
217 aa  54.7  0.0000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0199515  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1712  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  45.95 
 
 
220 aa  54.7  0.0000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0573115  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1532  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  26.37 
 
 
206 aa  54.7  0.0000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0492  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  27.59 
 
 
206 aa  53.9  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10858  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  26.92 
 
 
208 aa  54.3  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.84468  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5776  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.2 
 
 
211 aa  54.3  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0281488  normal  0.147904 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3318  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  28.07 
 
 
220 aa  53.9  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.195577  normal  0.0232291 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0547  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.59 
 
 
178 aa  54.3  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000291317  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1499  thiamine monophosphate synthase  33.33 
 
 
215 aa  54.3  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0116  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  26.7 
 
 
205 aa  54.7  0.000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2788  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.13 
 
 
208 aa  54.3  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.305449  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1852  thiamine monophosphate synthase family protein  23.53 
 
 
193 aa  54.3  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.181009  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2015  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.5 
 
 
204 aa  54.3  0.000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.0030252  normal  0.0171267 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0730  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.58 
 
 
216 aa  54.7  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0124065  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0605  thiamine-phosphate pyrophosphorylase/phosphomethylpyrimidine kinase  31.4 
 
 
490 aa  53.5  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2467  thiamine monophosphate synthase  33.53 
 
 
214 aa  53.5  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.571514  normal  0.992674 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19391  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.15 
 
 
353 aa  53.5  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.706748 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3314  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.38 
 
 
347 aa  53.9  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1368  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  22.77 
 
 
365 aa  53.1  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.524473  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1660  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  24.74 
 
 
223 aa  53.9  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3432  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.35 
 
 
343 aa  52.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2521  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.53 
 
 
346 aa  52.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1005  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  29.51 
 
 
202 aa  52.8  0.000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>