251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3564 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_3564  initiation factor 2B related protein  100 
 
 
505 aa  980    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1576  initiation factor 2B related protein  64.21 
 
 
467 aa  502  1e-141  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.649962  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1398  initiation factor 2B related  44.83 
 
 
414 aa  316  7e-85  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02410  translation initiation factor eIF-2B subunit family protein (AFU_orthologue; AFUA_2G14290)  24.87 
 
 
548 aa  106  1e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.347502 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23250  methylthioribose-1-phosphate isomerase  39.62 
 
 
358 aa  97.4  6e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0078361 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1960  methylthioribose-1-phosphate isomerase  39.62 
 
 
358 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1101  NUDIX hydrolase  38.35 
 
 
136 aa  95.1  2e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1847  methylthioribose-1-phosphate isomerase  36.82 
 
 
358 aa  94.7  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0721435  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2762  translation initiation factor IF-2B subunit delta  35.07 
 
 
331 aa  94  5e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00225031  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1290  NUDIX domain-containing protein  39.53 
 
 
138 aa  94  6e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4079  methylthioribose-1-phosphate isomerase  36.9 
 
 
358 aa  92.8  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.256868 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2704  initiation factor 2B related  27.95 
 
 
312 aa  92.8  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15800  methylthioribose-1-phosphate isomerase  36.9 
 
 
358 aa  93.2  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1373  methylthioribose-1-phosphate isomerase  34.52 
 
 
358 aa  92.4  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1073  NUDIX hydrolase domain protein  37.98 
 
 
137 aa  92  2e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.467829  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2269  translation initiation factor IF-2B subunit delta  36.05 
 
 
323 aa  92  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0752053 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1357  methylthioribose-1-phosphate isomerase  35.38 
 
 
358 aa  92.4  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.759333 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3948  methylthioribose-1-phosphate isomerase  35.38 
 
 
358 aa  92  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0029579  normal  0.0349514 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3648  methylthioribose-1-phosphate isomerase  36.31 
 
 
365 aa  90.1  8e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.295966  normal  0.479816 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3027  initiation factor 2B related  32.06 
 
 
320 aa  89.7  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.390862  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1766  methylthioribose-1-phosphate isomerase  34.36 
 
 
358 aa  89  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.3152  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1744  initiation factor 2 subunit family  36.31 
 
 
358 aa  89.4  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2043  methylthioribose-1-phosphate isomerase  30.66 
 
 
354 aa  87  8e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2124  methylthioribose-1-phosphate isomerase  29.8 
 
 
354 aa  86.7  0.000000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.369854  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1938  translation initiation factor IF-2B subunit delta  32.06 
 
 
321 aa  84.7  0.000000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1643  translation initiation factor  36.71 
 
 
344 aa  83.6  0.000000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.226672  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0571  translation initiation factor, aIF-2BII family  32.59 
 
 
327 aa  83.6  0.000000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2147  initiation factor 2B related  30.48 
 
 
309 aa  83.6  0.000000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000266151  hitchhiker  0.00589649 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00735  methylthioribose-1-phosphate isomerase  36.78 
 
 
354 aa  82.8  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.214802  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0331  translation initiation factor, aIF-2BII family  30.68 
 
 
309 aa  82.8  0.00000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1571  initiation factor 2B related protein  35.69 
 
 
283 aa  82.4  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0503  translation initiation factor, aIF-2BI family  37.17 
 
 
350 aa  82  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2966  translation initiation factor, aIF-2BII family  30.46 
 
 
351 aa  81.6  0.00000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00871533  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1400  translation initiation factor, aIF-2BI family  32.66 
 
 
354 aa  80.9  0.00000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0211329  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2579  methylthioribose-1-phosphate isomerase  36.47 
 
 
354 aa  80.9  0.00000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4687  methylthioribose-1-phosphate isomerase  29.78 
 
 
350 aa  80.1  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1186  translation initiation factor, aIF-2BI family  28.27 
 
 
345 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000144196  normal  0.031954 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2067  translation initiation factor IF-2B subunit delta  34.17 
 
 
309 aa  79.3  0.0000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3347  initiation factor 2B related protein  33.33 
 
 
283 aa  79.3  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.151547  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2432  translation initiation factor IF-2B subunit delta  33.33 
 
 
320 aa  78.6  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2717  methylthioribose-1-phosphate isomerase  31.61 
 
 
349 aa  78.6  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.143544  normal  0.136837 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3396  methylthioribose-1-phosphate isomerase  31.61 
 
 
349 aa  78.6  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0074  initiation factor 2B related  29.68 
 
 
292 aa  78.6  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1491  translation initiation factor, aIF-2BI family  36.67 
 
 
353 aa  78.2  0.0000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.626941  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1694  aIF-2BI family translation initiation factor  33.7 
 
 
353 aa  77.8  0.0000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1974  initiation factor 2 subunit family protein  34.57 
 
 
352 aa  76.6  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.299766  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3517  translation initiation factor, aIF-2BI family  33.07 
 
 
338 aa  76.3  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.574995  normal  0.0784956 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2078  methylthioribose-1-phosphate isomerase  31.61 
 
 
353 aa  76.3  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.424406 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2349  aIF-2BI family translation initiation factor  32.73 
 
 
358 aa  76.3  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.944221  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0793  translation initiation factor IF-2B subunit delta  30.19 
 
 
307 aa  75.9  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.618819 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0394  methylthioribose-1-phosphate isomerase  32.12 
 
 
348 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0076  translation initiation factor 2B subunit I  29.41 
 
 
355 aa  75.1  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3749  putative translation initiation factor, aIF-2BI/5-methylthioribose-1-phosphate isomerase  32 
 
 
354 aa  75.1  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0257  translation initiation factor IF-2B subunit delta  33.07 
 
 
318 aa  75.1  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.374492  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0573  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized proteins  37.82 
 
 
354 aa  74.3  0.000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0557  translation initiation factor IF-2B subunit delta  30.8 
 
 
319 aa  74.7  0.000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0282254 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0621  translation initiation factor 2B subunit I  26.32 
 
 
342 aa  74.7  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0997628  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2064  aIF-2BI family translation initiation factor  32.67 
 
 
346 aa  74.7  0.000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000777983  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2731  methylthioribose-1-phosphate isomerase  27.44 
 
 
349 aa  74.7  0.000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0228866  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2477  initiation factor 2B related  32.57 
 
 
288 aa  74.3  0.000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.385124  normal  0.789729 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3765  translation initiation factor, aIF-2BI family  28.49 
 
 
345 aa  74.3  0.000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0692423  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0319  methylthioribose-1-phosphate isomerase  27.65 
 
 
347 aa  73.9  0.000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0347  methylthioribose-1-phosphate isomerase  27.3 
 
 
347 aa  73.9  0.000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0419  translation initiation factor 2B subunit I family (IF-2BI)  30.05 
 
 
347 aa  73.9  0.000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.04546  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0929  translation initiation factor, aIF-2BI family  26.69 
 
 
344 aa  73.9  0.000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.119435  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0332  methylthioribose-1-phosphate isomerase  27.3 
 
 
348 aa  73.9  0.000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2012  initiation factor 2B related  28.85 
 
 
310 aa  73.6  0.000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1360  translation initiation factor, aIF-2BI family  28.72 
 
 
342 aa  73.6  0.000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0559648  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0379  methylthioribose-1-phosphate isomerase  27.3 
 
 
348 aa  73.9  0.000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0703  translation initiation factor 2B subunit I  30.93 
 
 
351 aa  73.6  0.000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000787843 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2276  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized protein  37.66 
 
 
348 aa  73.6  0.000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3335  methylthioribose-1-phosphate isomerase  34.38 
 
 
362 aa  73.6  0.000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000368125 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2293  initiation factor 2B alpha/beta/delta  31.53 
 
 
348 aa  73.6  0.000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0441  methylthioribose-1-phosphate isomerase  29.95 
 
 
348 aa  73.2  0.000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1667  methylthioribose-1-phosphate isomerase  28.4 
 
 
352 aa  73.2  0.00000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000944772  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1741  methylthioribose-1-phosphate isomerase  27.06 
 
 
355 aa  73.2  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3544  methylthioribose-1-phosphate isomerase  32.26 
 
 
347 aa  73.2  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0327  methylthioribose-1-phosphate isomerase  29.95 
 
 
348 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3861  methylthioribose-1-phosphate isomerase  27.32 
 
 
349 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.583783  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4924  methylthioribose-1-phosphate isomerase  29.95 
 
 
348 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.64519  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0846  methylthioribose-1-phosphate isomerase  30.69 
 
 
356 aa  73.2  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0316  methylthioribose-1-phosphate isomerase  27.6 
 
 
348 aa  72  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1992  translation initiation factor 2B subunit I  30.04 
 
 
348 aa  72.8  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.337411 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0779  S-methyl-5-thioribose-1-phosphate isomerase  29.89 
 
 
346 aa  72.4  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.404257  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4139  methylthioribose-1-phosphate isomerase  26.37 
 
 
353 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.196624  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0169  aIF-2BI family translation initiation factor  29.38 
 
 
345 aa  72.4  0.00000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00178496 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0893  translation initiation factor, putative, aIF-2BI family  30.59 
 
 
350 aa  71.6  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.592347  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3560  translation initiation factor, aIF-2BI family  32.54 
 
 
357 aa  71.6  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0676  translation initiation factor, aIF-2BI family  29.76 
 
 
339 aa  71.6  0.00000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0103604  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1840  aIF-2BI family translation initiation factor  30.55 
 
 
348 aa  71.6  0.00000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.635739  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0385  initiation factor 2B related  28.11 
 
 
319 aa  71.6  0.00000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.14036  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35743  predicted protein  33.72 
 
 
365 aa  72  0.00000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.260094 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2269  translation initiation factor 2B subunit I  34.46 
 
 
349 aa  71.6  0.00000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1015  translation initiation factor, aIF-2BI family  30.59 
 
 
350 aa  71.6  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.253315  unclonable  0.0000000000388932 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08600  methylthioribose-1-phosphate isomerase  33.92 
 
 
333 aa  70.9  0.00000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.688964  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2541  translation initiation factor, aIF-2BI family  28.78 
 
 
350 aa  70.9  0.00000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4098  methylthioribose-1-phosphate isomerase  26.37 
 
 
351 aa  70.9  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.463174  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3385  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized protein  39.6 
 
 
357 aa  70.9  0.00000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1203  translation initiation factor, aIF-2BI family  36.48 
 
 
358 aa  70.9  0.00000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0913  translation initiation factor 2B subunit I  34.71 
 
 
346 aa  70.5  0.00000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.659043  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>