241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2579 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_2579  methylthioribose-1-phosphate isomerase  100 
 
 
354 aa  709    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00735  methylthioribose-1-phosphate isomerase  83.85 
 
 
354 aa  596  1e-169  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.214802  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2043  methylthioribose-1-phosphate isomerase  78.32 
 
 
354 aa  543  1e-153  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2124  methylthioribose-1-phosphate isomerase  78.26 
 
 
354 aa  543  1e-153  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.369854  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1534  translation initiation factor, aIF-2BI family  60.77 
 
 
348 aa  400  9.999999999999999e-111  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2293  initiation factor 2B alpha/beta/delta  58.67 
 
 
348 aa  353  2e-96  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3648  methylthioribose-1-phosphate isomerase  59.06 
 
 
365 aa  340  2e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.295966  normal  0.479816 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23250  methylthioribose-1-phosphate isomerase  56.1 
 
 
358 aa  339  4e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0078361 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15800  methylthioribose-1-phosphate isomerase  57.73 
 
 
358 aa  335  5e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4079  methylthioribose-1-phosphate isomerase  57.02 
 
 
358 aa  334  1e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.256868 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1960  methylthioribose-1-phosphate isomerase  55.52 
 
 
358 aa  332  4e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1974  initiation factor 2 subunit family protein  57.23 
 
 
352 aa  332  7.000000000000001e-90  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.299766  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0016  aIF-2BI family translation initiation factor  50.3 
 
 
343 aa  332  7.000000000000001e-90  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.570831  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0016  aIF-2BI family translation initiation factor  50.3 
 
 
343 aa  332  7.000000000000001e-90  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.339634  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0913  translation initiation factor 2B subunit I  58.43 
 
 
346 aa  331  1e-89  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.659043  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1744  initiation factor 2 subunit family  57.68 
 
 
358 aa  330  2e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0573  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized proteins  56.55 
 
 
354 aa  327  2.0000000000000001e-88  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0254  aIF-2BI family translation initiation factor  49.25 
 
 
346 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1203  translation initiation factor, aIF-2BI family  53.73 
 
 
358 aa  325  9e-88  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1519  aIF-2BI family translation initiation factor  49.11 
 
 
350 aa  323  2e-87  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.889993  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3544  methylthioribose-1-phosphate isomerase  50.91 
 
 
347 aa  320  1.9999999999999998e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3560  translation initiation factor, aIF-2BI family  51.33 
 
 
357 aa  318  7e-86  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1175  translation initiation factor 2B subunit I  48.97 
 
 
354 aa  317  3e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2064  aIF-2BI family translation initiation factor  51.94 
 
 
346 aa  317  3e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000777983  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0810  aIF-2BI family translation initiation factor  48.67 
 
 
349 aa  315  8e-85  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1360  translation initiation factor, aIF-2BI family  46.55 
 
 
342 aa  312  4.999999999999999e-84  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0559648  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2235  translation initiation factor, aIF-2BI family  51.05 
 
 
350 aa  309  5e-83  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4687  methylthioribose-1-phosphate isomerase  48.05 
 
 
350 aa  306  5.0000000000000004e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2877  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized proteins  50.15 
 
 
350 aa  305  9.000000000000001e-82  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2493  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized protein  52.23 
 
 
351 aa  304  2.0000000000000002e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0072  translation initiation factor 2B subunit I  49.12 
 
 
346 aa  303  3.0000000000000004e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.25912 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3816  methylthioribose-1-phosphate isomerase  48.5 
 
 
350 aa  301  1e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.732544 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2312  translation initiation factor, aIF-2BI family  50.87 
 
 
378 aa  301  1e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0964  translation initiation factor, aIF-2BI family  53.1 
 
 
351 aa  301  1e-80  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.518904  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1643  translation initiation factor  47.73 
 
 
344 aa  299  4e-80  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.226672  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4334  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized protein  51.78 
 
 
337 aa  298  1e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1881  aIF-2BI family translation initiation factor  47.2 
 
 
345 aa  296  2e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2078  methylthioribose-1-phosphate isomerase  45.1 
 
 
353 aa  297  2e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.424406 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3596  translation initiation factor, aIF-2BI family  48.63 
 
 
346 aa  296  3e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.82629  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1847  methylthioribose-1-phosphate isomerase  54.23 
 
 
358 aa  296  3e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0721435  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0648  aIF-2BI family translation initiation factor  50.15 
 
 
348 aa  296  5e-79  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674044  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0191  translation initiation factor, aIF-2BI family  50.15 
 
 
348 aa  294  1e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0510  aIF-2BI family translation initiation factor  47.73 
 
 
346 aa  294  1e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0621  translation initiation factor 2B subunit I  45.72 
 
 
342 aa  293  3e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0997628  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3379  aIF-2BI family translation initiation factor  47.75 
 
 
346 aa  291  8e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0076  translation initiation factor 2B subunit I  48.41 
 
 
355 aa  291  1e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0419  translation initiation factor 2B subunit I family (IF-2BI)  43.37 
 
 
347 aa  290  2e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.04546  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1015  translation initiation factor, aIF-2BI family  51.52 
 
 
350 aa  290  3e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.253315  unclonable  0.0000000000388932 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0893  translation initiation factor, putative, aIF-2BI family  51.52 
 
 
350 aa  290  3e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.592347  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4322  aIF-2BI family translation initiation factor  46.06 
 
 
346 aa  290  4e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.394096  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0929  translation initiation factor, aIF-2BI family  43.95 
 
 
344 aa  288  9e-77  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.119435  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3749  putative translation initiation factor, aIF-2BI/5-methylthioribose-1-phosphate isomerase  46.57 
 
 
354 aa  288  1e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3396  methylthioribose-1-phosphate isomerase  47.48 
 
 
349 aa  286  2.9999999999999996e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2717  methylthioribose-1-phosphate isomerase  47.48 
 
 
349 aa  286  2.9999999999999996e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.143544  normal  0.136837 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6765  translation initiation factor, aIF-2BI family  47.8 
 
 
369 aa  286  2.9999999999999996e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1373  methylthioribose-1-phosphate isomerase  53.41 
 
 
358 aa  285  7e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2349  aIF-2BI family translation initiation factor  47.34 
 
 
358 aa  285  8e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.944221  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1766  methylthioribose-1-phosphate isomerase  52.48 
 
 
358 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.3152  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1186  translation initiation factor, aIF-2BI family  51.56 
 
 
345 aa  283  2.0000000000000002e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000144196  normal  0.031954 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1992  translation initiation factor 2B subunit I  45.48 
 
 
348 aa  283  3.0000000000000004e-75  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.337411 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2613  translation initiation factor, aIF-2BI family  41.64 
 
 
349 aa  283  3.0000000000000004e-75  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1844  initiation factor 2B alpha/beta/delta  49.55 
 
 
335 aa  280  2e-74  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1944  translation initiation factor 2B subunit I  49.1 
 
 
352 aa  280  2e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00466755  normal  0.570212 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1036  translation initiation factor, aIF-2BI family  51.85 
 
 
347 aa  280  4e-74  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.313313  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0503  translation initiation factor, aIF-2BI family  46.71 
 
 
350 aa  279  4e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2170  aIF-2BI family translation initiation factor  52.73 
 
 
344 aa  276  5e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4098  methylthioribose-1-phosphate isomerase  45.26 
 
 
351 aa  275  8e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.463174  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0156  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized protein  49.57 
 
 
354 aa  275  1.0000000000000001e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232234  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18480  putative translation initiation factor, aIF-2BI family  45.83 
 
 
355 aa  275  1.0000000000000001e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0224403  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0518  aIF-2BI family translation initiation factor  47.42 
 
 
334 aa  274  2.0000000000000002e-72  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.294825  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3753  translation initiation factor, aIF-2BI family  46.94 
 
 
346 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4317  translation initiation factor, aIF-2BI family  50.3 
 
 
339 aa  273  3e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3948  methylthioribose-1-phosphate isomerase  51.46 
 
 
358 aa  273  3e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0029579  normal  0.0349514 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3646  translation initiation factor, aIF-2BI family  46.94 
 
 
346 aa  273  4.0000000000000004e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1357  methylthioribose-1-phosphate isomerase  52.05 
 
 
358 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.759333 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4339  translation initiation factor, aIF-2BI family  50.29 
 
 
339 aa  273  4.0000000000000004e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3765  translation initiation factor, aIF-2BI family  46.9 
 
 
345 aa  273  4.0000000000000004e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0692423  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0846  methylthioribose-1-phosphate isomerase  43.82 
 
 
356 aa  272  6e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0169  aIF-2BI family translation initiation factor  41.23 
 
 
345 aa  272  6e-72  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00178496 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_459  methylthioribose-1-phosphate isomerase  46.81 
 
 
332 aa  272  6e-72  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.14852  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0703  translation initiation factor 2B subunit I  49.57 
 
 
351 aa  271  1e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000787843 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0494  translation initiation factor 2B subunit I  46.5 
 
 
332 aa  271  1e-71  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.93452  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3942  methylthioribose-1-phosphate isomerase  44.65 
 
 
351 aa  271  2e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0676  translation initiation factor, aIF-2BI family  42.48 
 
 
339 aa  271  2e-71  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0103604  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4251  methylthioribose-1-phosphate isomerase  44.65 
 
 
351 aa  271  2e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4159  methylthioribose-1-phosphate isomerase  44.65 
 
 
351 aa  271  2e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.109098  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3789  methylthioribose-1-phosphate isomerase  44.65 
 
 
351 aa  270  4e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.700016  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2173  translation initiation factor IF-2B subunit alpha  44.67 
 
 
366 aa  270  4e-71  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3774  methylthioribose-1-phosphate isomerase  44.34 
 
 
351 aa  269  5e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4053  methylthioribose-1-phosphate isomerase  44.34 
 
 
351 aa  269  5e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0027  aIF-2BI family translation initiation factor  42.99 
 
 
337 aa  269  5.9999999999999995e-71  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1381  translation initiation factor, aIF-2BI family  45.99 
 
 
362 aa  269  5.9999999999999995e-71  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.705402  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3861  methylthioribose-1-phosphate isomerase  44.34 
 
 
349 aa  268  7e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.583783  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1491  translation initiation factor, aIF-2BI family  49.85 
 
 
353 aa  268  1e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.626941  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2033  aIF-2BI family translation initiation factor  42.69 
 
 
354 aa  267  2e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0595  translation initiation factor, aIF-2BI family  42.56 
 
 
328 aa  266  5e-70  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2269  translation initiation factor 2B subunit I  43.06 
 
 
349 aa  266  5.999999999999999e-70  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1971  translation initiation factor, aIF-2BI family  48.84 
 
 
345 aa  265  7e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00568517  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1099  methylthioribose-1-phosphate isomerase  44.07 
 
 
353 aa  265  8e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.767768 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0779  S-methyl-5-thioribose-1-phosphate isomerase  44.15 
 
 
346 aa  265  8e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.404257  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>