244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1491 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1491  translation initiation factor, aIF-2BI family  100 
 
 		 353 aa  701    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.626941  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0332  methylthioribose-1-phosphate isomerase  54.25 
 
 		 348 aa  361  8e-99  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0319  methylthioribose-1-phosphate isomerase  54.55 
 
 		 347 aa  362  8e-99  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0379  methylthioribose-1-phosphate isomerase  54.25 
 
 		 348 aa  361  8e-99  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0347  methylthioribose-1-phosphate isomerase  54.25 
 
 		 347 aa  361  8e-99  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0327  methylthioribose-1-phosphate isomerase  54.55 
 
 		 348 aa  360  2e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4924  methylthioribose-1-phosphate isomerase  54.25 
 
 		 348 aa  360  2e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.64519  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0316  methylthioribose-1-phosphate isomerase  53.96 
 
 		 348 aa  359  5e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0394  methylthioribose-1-phosphate isomerase  53.37 
 
 		 348 aa  357  9.999999999999999e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0441  methylthioribose-1-phosphate isomerase  53.67 
 
 		 348 aa  355  5e-97  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2349  aIF-2BI family translation initiation factor  55.02 
 
 		 358 aa  343  2.9999999999999997e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.944221  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0846  methylthioribose-1-phosphate isomerase  51.61 
 
 		 356 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0254  aIF-2BI family translation initiation factor  53.19 
 
 		 346 aa  337  9.999999999999999e-92  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0016  aIF-2BI family translation initiation factor  51.34 
 
 		 343 aa  336  3.9999999999999995e-91  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.570831  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0016  aIF-2BI family translation initiation factor  51.34 
 
 		 343 aa  336  3.9999999999999995e-91  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.339634  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0639  aIF-2BI family translation initiation factor  50.73 
 
 		 372 aa  336  3.9999999999999995e-91  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.249987  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3560  translation initiation factor, aIF-2BI family  53.64 
 
 		 357 aa  332  5e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_459  methylthioribose-1-phosphate isomerase  53.66 
 
 		 332 aa  330  2e-89  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.14852  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0518  aIF-2BI family translation initiation factor  53.35 
 
 		 334 aa  330  2e-89  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.294825  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1360  translation initiation factor, aIF-2BI family  48.24 
 
 		 342 aa  330  2e-89  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0559648  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2613  translation initiation factor, aIF-2BI family  46.94 
 
 		 349 aa  330  2e-89  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4322  aIF-2BI family translation initiation factor  51.18 
 
 		 346 aa  330  3e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.394096  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1289  methylthioribose-1-phosphate isomerase  53.21 
 
 		 364 aa  329  4e-89  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0889723  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0703  translation initiation factor 2B subunit I  55.07 
 
 		 351 aa  328  1.0000000000000001e-88  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000787843 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1175  translation initiation factor 2B subunit I  49.14 
 
 		 354 aa  326  5e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0621  translation initiation factor 2B subunit I  47.97 
 
 		 342 aa  325  5e-88  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0997628  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3749  putative translation initiation factor, aIF-2BI/5-methylthioribose-1-phosphate isomerase  50.72 
 
 		 354 aa  325  6e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0929  translation initiation factor, aIF-2BI family  48.1 
 
 		 344 aa  325  6e-88  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.119435  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1519  aIF-2BI family translation initiation factor  52.87 
 
 		 350 aa  324  2e-87  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.889993  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1381  translation initiation factor, aIF-2BI family  53.07 
 
 		 362 aa  320  3e-86  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.705402  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2064  aIF-2BI family translation initiation factor  53.12 
 
 		 346 aa  320  3e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000777983  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1099  methylthioribose-1-phosphate isomerase  48.74 
 
 		 353 aa  319  3.9999999999999996e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.767768 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4139  methylthioribose-1-phosphate isomerase  49.28 
 
 		 353 aa  319  6e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.196624  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3942  methylthioribose-1-phosphate isomerase  50.15 
 
 		 351 aa  318  9e-86  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4251  methylthioribose-1-phosphate isomerase  50.15 
 
 		 351 aa  318  9e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4098  methylthioribose-1-phosphate isomerase  49.56 
 
 		 351 aa  317  1e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.463174  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0494  translation initiation factor 2B subunit I  51.65 
 
 		 332 aa  318  1e-85  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.93452  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3789  methylthioribose-1-phosphate isomerase  49.85 
 
 		 351 aa  316  3e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.700016  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0648  aIF-2BI family translation initiation factor  53.24 
 
 		 348 aa  316  5e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674044  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4159  methylthioribose-1-phosphate isomerase  49.56 
 
 		 351 aa  315  6e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.109098  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4053  methylthioribose-1-phosphate isomerase  49.56 
 
 		 351 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3596  translation initiation factor, aIF-2BI family  50 
 
 		 346 aa  314  9.999999999999999e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.82629  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4687  methylthioribose-1-phosphate isomerase  50 
 
 		 350 aa  313  1.9999999999999998e-84  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3774  methylthioribose-1-phosphate isomerase  49.26 
 
 		 351 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1741  methylthioribose-1-phosphate isomerase  51.32 
 
 		 355 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3544  methylthioribose-1-phosphate isomerase  50.59 
 
 		 347 aa  312  4.999999999999999e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3379  aIF-2BI family translation initiation factor  49.12 
 
 		 346 aa  312  5.999999999999999e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0156  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized protein  53.08 
 
 		 354 aa  310  2.9999999999999997e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1844  initiation factor 2B alpha/beta/delta  50.45 
 
 		 335 aa  309  4e-83  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0810  aIF-2BI family translation initiation factor  48.8 
 
 		 349 aa  308  8e-83  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1643  translation initiation factor  49.26 
 
 		 344 aa  308  1.0000000000000001e-82  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.226672  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0999  aIF-2BI family translation initiation factor  51.78 
 
 		 327 aa  307  2.0000000000000002e-82  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.260098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3861  methylthioribose-1-phosphate isomerase  48.67 
 
 		 349 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.583783  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2033  aIF-2BI family translation initiation factor  47.72 
 
 		 354 aa  307  2.0000000000000002e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0964  translation initiation factor, aIF-2BI family  53.53 
 
 		 351 aa  306  3e-82  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.518904  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0072  translation initiation factor 2B subunit I  49.41 
 
 		 346 aa  306  4.0000000000000004e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.25912 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0510  aIF-2BI family translation initiation factor  49.55 
 
 		 346 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2170  aIF-2BI family translation initiation factor  52.19 
 
 		 344 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4334  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized protein  51.92 
 
 		 337 aa  303  2.0000000000000002e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4339  translation initiation factor, aIF-2BI family  53.57 
 
 		 339 aa  303  2.0000000000000002e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1015  translation initiation factor, aIF-2BI family  51.64 
 
 		 350 aa  304  2.0000000000000002e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.253315  unclonable  0.0000000000388932 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0893  translation initiation factor, putative, aIF-2BI family  51.64 
 
 		 350 aa  304  2.0000000000000002e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.592347  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4317  translation initiation factor, aIF-2BI family  53.57 
 
 		 339 aa  303  2.0000000000000002e-81  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3816  methylthioribose-1-phosphate isomerase  50.59 
 
 		 350 aa  300  2e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.732544 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1881  aIF-2BI family translation initiation factor  49.39 
 
 		 345 aa  300  2e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0779  S-methyl-5-thioribose-1-phosphate isomerase  48.68 
 
 		 346 aa  300  3e-80  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.404257  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0485  aIF-2BI family translation initiation factor  49.85 
 
 		 353 aa  299  5e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.646058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1944  translation initiation factor 2B subunit I  48.12 
 
 		 352 aa  297  2e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00466755  normal  0.570212 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1647  translation initiation factor, aIF-2BI family  51.2 
 
 		 329 aa  296  3e-79  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1992  translation initiation factor 2B subunit I  48.38 
 
 		 348 aa  296  3e-79  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.337411 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6765  translation initiation factor, aIF-2BI family  50 
 
 		 369 aa  296  4e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23250  methylthioribose-1-phosphate isomerase  50 
 
 		 358 aa  296  5e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0078361 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1186  translation initiation factor, aIF-2BI family  53.42 
 
 		 345 aa  295  9e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000144196  normal  0.031954 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0503  translation initiation factor, aIF-2BI family  46.9 
 
 		 350 aa  295  1e-78  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4186  translation initiation factor 2B subunit I  53.68 
 
 		 339 aa  294  1e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3765  translation initiation factor, aIF-2BI family  51.03 
 
 		 345 aa  293  3e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0692423  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2078  methylthioribose-1-phosphate isomerase  46.15 
 
 		 353 aa  293  3e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.424406 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0491  translation initiation factor 2B subunit I  52.23 
 
 		 337 aa  292  5e-78  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.23967 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0676  translation initiation factor, aIF-2BI family  46.27 
 
 		 339 aa  292  5e-78  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0103604  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1960  methylthioribose-1-phosphate isomerase  49.28 
 
 		 358 aa  291  1e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2877  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized proteins  48.93 
 
 		 350 aa  291  1e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2235  translation initiation factor, aIF-2BI family  47.85 
 
 		 350 aa  291  1e-77  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3753  translation initiation factor, aIF-2BI family  48.97 
 
 		 346 aa  289  6e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2731  methylthioribose-1-phosphate isomerase  49.24 
 
 		 349 aa  288  8e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0228866  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3646  translation initiation factor, aIF-2BI family  48.97 
 
 		 346 aa  288  8e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0419  translation initiation factor 2B subunit I family (IF-2BI)  43.86 
 
 		 347 aa  287  2e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.04546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18480  putative translation initiation factor, aIF-2BI family  48.34 
 
 		 355 aa  287  2e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0224403  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0076  translation initiation factor 2B subunit I  48.77 
 
 		 355 aa  286  2.9999999999999996e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1140  translation initiation factor 2B subunit I  51.41 
 
 		 342 aa  286  4e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2493  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized protein  49.56 
 
 		 351 aa  285  8e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2124  methylthioribose-1-phosphate isomerase  48.36 
 
 		 354 aa  284  1.0000000000000001e-75  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.369854  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1534  translation initiation factor, aIF-2BI family  51.03 
 
 		 348 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1203  translation initiation factor, aIF-2BI family  50.46 
 
 		 358 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00735  methylthioribose-1-phosphate isomerase  49.25 
 
 		 354 aa  283  3.0000000000000004e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.214802  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0888  translation initiation factor, aIF-2BI family  50.16 
 
 		 343 aa  283  4.0000000000000003e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.332412  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1791  translation initiation factor 2B subunit I  45.26 
 
 		 321 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0978  translation initiation factor 2B subunit I  48.94 
 
 		 338 aa  282  8.000000000000001e-75  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0893546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0595  translation initiation factor, aIF-2BI family  45.72 
 
 		 328 aa  281  1e-74  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0921  translation initiation factor, aIF-2BI family  50.47 
 
 		 342 aa  281  1e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2043  methylthioribose-1-phosphate isomerase  48.36 
 
 		 354 aa  281  1e-74  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>