241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0573 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_0573  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized proteins  100 
 
 		 354 aa  696    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15800  methylthioribose-1-phosphate isomerase  60.63 
 
 		 358 aa  392  1e-108  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23250  methylthioribose-1-phosphate isomerase  60.63 
 
 		 358 aa  391  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0078361 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2293  initiation factor 2B alpha/beta/delta  60.63 
 
 		 348 aa  385  1e-106  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1203  translation initiation factor, aIF-2BI family  60.17 
 
 		 358 aa  383  1e-105  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1960  methylthioribose-1-phosphate isomerase  59.77 
 
 		 358 aa  384  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1534  translation initiation factor, aIF-2BI family  60.47 
 
 		 348 aa  379  1e-104  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4079  methylthioribose-1-phosphate isomerase  59.2 
 
 		 358 aa  375  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.256868 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3648  methylthioribose-1-phosphate isomerase  59.48 
 
 		 365 aa  373  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.295966  normal  0.479816 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1744  initiation factor 2 subunit family  58.91 
 
 		 358 aa  369  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0913  translation initiation factor 2B subunit I  61.71 
 
 		 346 aa  367  1e-100  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.659043  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1974  initiation factor 2 subunit family protein  59.94 
 
 		 352 aa  353  2e-96  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.299766  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00735  methylthioribose-1-phosphate isomerase  56.14 
 
 		 354 aa  351  8.999999999999999e-96  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.214802  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2124  methylthioribose-1-phosphate isomerase  55.33 
 
 		 354 aa  342  8e-93  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.369854  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2043  methylthioribose-1-phosphate isomerase  55.03 
 
 		 354 aa  340  2.9999999999999998e-92  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1847  methylthioribose-1-phosphate isomerase  56.32 
 
 		 358 aa  339  5e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0721435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1519  aIF-2BI family translation initiation factor  50.58 
 
 		 350 aa  336  5e-91  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.889993  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1175  translation initiation factor 2B subunit I  50.42 
 
 		 354 aa  332  5e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2493  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized protein  54.97 
 
 		 351 aa  329  5.0000000000000004e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0254  aIF-2BI family translation initiation factor  49.41 
 
 		 346 aa  327  1.0000000000000001e-88  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2579  methylthioribose-1-phosphate isomerase  56.15 
 
 		 354 aa  324  1e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1360  translation initiation factor, aIF-2BI family  45.66 
 
 		 342 aa  324  2e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0559648  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1373  methylthioribose-1-phosphate isomerase  54.6 
 
 		 358 aa  323  2e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0072  translation initiation factor 2B subunit I  52.08 
 
 		 346 aa  317  2e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.25912 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1357  methylthioribose-1-phosphate isomerase  56.32 
 
 		 358 aa  316  3e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.759333 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0810  aIF-2BI family translation initiation factor  47.38 
 
 		 349 aa  315  9e-85  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2170  aIF-2BI family translation initiation factor  56.94 
 
 		 344 aa  314  9.999999999999999e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0016  aIF-2BI family translation initiation factor  48.83 
 
 		 343 aa  314  9.999999999999999e-85  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.570831  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0016  aIF-2BI family translation initiation factor  48.83 
 
 		 343 aa  314  9.999999999999999e-85  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.339634  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1766  methylthioribose-1-phosphate isomerase  54.18 
 
 		 358 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.3152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6765  translation initiation factor, aIF-2BI family  52.81 
 
 		 369 aa  314  1.9999999999999998e-84  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3379  aIF-2BI family translation initiation factor  50.9 
 
 		 346 aa  311  1e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1015  translation initiation factor, aIF-2BI family  53.89 
 
 		 350 aa  311  1e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.253315  unclonable  0.0000000000388932 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0893  translation initiation factor, putative, aIF-2BI family  53.89 
 
 		 350 aa  311  1e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.592347  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0076  translation initiation factor 2B subunit I  53.17 
 
 		 355 aa  310  2e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3948  methylthioribose-1-phosphate isomerase  55.46 
 
 		 358 aa  310  2e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0029579  normal  0.0349514 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4322  aIF-2BI family translation initiation factor  51.2 
 
 		 346 aa  309  4e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.394096  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3749  putative translation initiation factor, aIF-2BI/5-methylthioribose-1-phosphate isomerase  51.13 
 
 		 354 aa  307  1.0000000000000001e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0503  translation initiation factor, aIF-2BI family  50.89 
 
 		 350 aa  306  5.0000000000000004e-82  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0964  translation initiation factor, aIF-2BI family  53.78 
 
 		 351 aa  305  7e-82  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.518904  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0621  translation initiation factor 2B subunit I  46.2 
 
 		 342 aa  302  7.000000000000001e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0997628  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4334  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized protein  54.6 
 
 		 337 aa  301  8.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1944  translation initiation factor 2B subunit I  51.48 
 
 		 352 aa  300  2e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00466755  normal  0.570212 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1992  translation initiation factor 2B subunit I  48.28 
 
 		 348 aa  300  3e-80  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.337411 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3560  translation initiation factor, aIF-2BI family  52.24 
 
 		 357 aa  299  4e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3596  translation initiation factor, aIF-2BI family  49.4 
 
 		 346 aa  299  5e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.82629  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1881  aIF-2BI family translation initiation factor  46.65 
 
 		 345 aa  298  8e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2877  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized proteins  51.46 
 
 		 350 aa  298  8e-80  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2312  translation initiation factor, aIF-2BI family  53.52 
 
 		 378 aa  296  4e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2235  translation initiation factor, aIF-2BI family  50.59 
 
 		 350 aa  296  4e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0595  translation initiation factor, aIF-2BI family  45.82 
 
 		 328 aa  295  1e-78  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0929  translation initiation factor, aIF-2BI family  45.51 
 
 		 344 aa  293  3e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.119435  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3753  translation initiation factor, aIF-2BI family  51.8 
 
 		 346 aa  293  3e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2064  aIF-2BI family translation initiation factor  49.28 
 
 		 346 aa  292  7e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000777983  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0419  translation initiation factor 2B subunit I family (IF-2BI)  43.88 
 
 		 347 aa  291  1e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.04546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0648  aIF-2BI family translation initiation factor  51.91 
 
 		 348 aa  291  2e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674044  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0510  aIF-2BI family translation initiation factor  48.99 
 
 		 346 aa  290  2e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2078  methylthioribose-1-phosphate isomerase  44.51 
 
 		 353 aa  288  1e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.424406 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3646  translation initiation factor, aIF-2BI family  50.6 
 
 		 346 aa  287  2e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4687  methylthioribose-1-phosphate isomerase  46.67 
 
 		 350 aa  286  2.9999999999999996e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0676  translation initiation factor, aIF-2BI family  41.95 
 
 		 339 aa  285  7e-76  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0103604  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4317  translation initiation factor, aIF-2BI family  56.23 
 
 		 339 aa  285  9e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4339  translation initiation factor, aIF-2BI family  56.23 
 
 		 339 aa  285  1.0000000000000001e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4924  methylthioribose-1-phosphate isomerase  45.8 
 
 		 348 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.64519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0394  methylthioribose-1-phosphate isomerase  46.36 
 
 		 348 aa  283  5.000000000000001e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_459  methylthioribose-1-phosphate isomerase  47.27 
 
 		 332 aa  282  6.000000000000001e-75  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.14852  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0327  methylthioribose-1-phosphate isomerase  45.51 
 
 		 348 aa  282  7.000000000000001e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0332  methylthioribose-1-phosphate isomerase  46.02 
 
 		 348 aa  281  9e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0379  methylthioribose-1-phosphate isomerase  46.02 
 
 		 348 aa  281  9e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0518  aIF-2BI family translation initiation factor  47.27 
 
 		 334 aa  281  1e-74  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.294825  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2349  aIF-2BI family translation initiation factor  48.1 
 
 		 358 aa  281  1e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.944221  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0347  methylthioribose-1-phosphate isomerase  46.02 
 
 		 347 aa  281  1e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0319  methylthioribose-1-phosphate isomerase  46.44 
 
 		 347 aa  280  2e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0485  aIF-2BI family translation initiation factor  50.29 
 
 		 353 aa  281  2e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.646058  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0316  methylthioribose-1-phosphate isomerase  46.02 
 
 		 348 aa  279  4e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0191  translation initiation factor, aIF-2BI family  48.19 
 
 		 348 aa  279  6e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0494  translation initiation factor 2B subunit I  45.48 
 
 		 332 aa  277  2e-73  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.93452  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0441  methylthioribose-1-phosphate isomerase  45.22 
 
 		 348 aa  276  3e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0156  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized protein  49.71 
 
 		 354 aa  276  5e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3544  methylthioribose-1-phosphate isomerase  45.51 
 
 		 347 aa  276  6e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1186  translation initiation factor, aIF-2BI family  51.76 
 
 		 345 aa  275  8e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000144196  normal  0.031954 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0169  aIF-2BI family translation initiation factor  42.57 
 
 		 345 aa  275  9e-73  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00178496 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4186  translation initiation factor 2B subunit I  55.17 
 
 		 339 aa  274  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0846  methylthioribose-1-phosphate isomerase  45.9 
 
 		 356 aa  272  5.000000000000001e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18480  putative translation initiation factor, aIF-2BI family  46.84 
 
 		 355 aa  272  8.000000000000001e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0224403  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3765  translation initiation factor, aIF-2BI family  47.46 
 
 		 345 aa  271  1e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0692423  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0027  aIF-2BI family translation initiation factor  43.86 
 
 		 337 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1971  translation initiation factor, aIF-2BI family  51.04 
 
 		 345 aa  269  5e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00568517  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1643  translation initiation factor  45.43 
 
 		 344 aa  268  8e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.226672  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1381  translation initiation factor, aIF-2BI family  45.38 
 
 		 362 aa  268  1e-70  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.705402  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0927  aIF-2BI family translation initiation factor  44.14 
 
 		 323 aa  268  1e-70  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1791  translation initiation factor 2B subunit I  43.54 
 
 		 321 aa  268  1e-70  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3816  methylthioribose-1-phosphate isomerase  47.46 
 
 		 350 aa  267  2e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.732544 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1036  translation initiation factor, aIF-2BI family  51.2 
 
 		 347 aa  267  2e-70  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.313313  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2717  methylthioribose-1-phosphate isomerase  46.2 
 
 		 349 aa  266  2.9999999999999995e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.143544  normal  0.136837 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3396  methylthioribose-1-phosphate isomerase  46.2 
 
 		 349 aa  266  2.9999999999999995e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1491  translation initiation factor, aIF-2BI family  50 
 
 		 353 aa  266  4e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.626941  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0703  translation initiation factor 2B subunit I  48.14 
 
 		 351 aa  265  8e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000787843 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0639  aIF-2BI family translation initiation factor  43.2 
 
 		 372 aa  265  1e-69  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.249987  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1805  translation initiation factor, aIF-2BI family  43.3 
 
 		 354 aa  263  3e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>