239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_1015 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011206  Lferr_1015  translation initiation factor, aIF-2BI family  100 
 
 
350 aa  701    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.253315  unclonable  0.0000000000388932 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0893  translation initiation factor, putative, aIF-2BI family  100 
 
 
350 aa  701    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.592347  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3596  translation initiation factor, aIF-2BI family  53.78 
 
 
346 aa  353  2e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.82629  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1175  translation initiation factor 2B subunit I  52.92 
 
 
354 aa  352  4e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3560  translation initiation factor, aIF-2BI family  54.36 
 
 
357 aa  352  7e-96  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1203  translation initiation factor, aIF-2BI family  57.32 
 
 
358 aa  351  8e-96  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0621  translation initiation factor 2B subunit I  52.69 
 
 
342 aa  348  5e-95  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0997628  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2170  aIF-2BI family translation initiation factor  58.43 
 
 
344 aa  348  1e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4334  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized protein  55.72 
 
 
337 aa  347  3e-94  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1534  translation initiation factor, aIF-2BI family  56.76 
 
 
348 aa  344  1e-93  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0964  translation initiation factor, aIF-2BI family  58.31 
 
 
351 aa  344  1e-93  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.518904  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0072  translation initiation factor 2B subunit I  52.63 
 
 
346 aa  343  2e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.25912 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0510  aIF-2BI family translation initiation factor  51.87 
 
 
346 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4322  aIF-2BI family translation initiation factor  52.2 
 
 
346 aa  343  2.9999999999999997e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.394096  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3379  aIF-2BI family translation initiation factor  51.31 
 
 
346 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0016  aIF-2BI family translation initiation factor  51.18 
 
 
343 aa  339  5e-92  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.570831  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0016  aIF-2BI family translation initiation factor  51.18 
 
 
343 aa  339  5e-92  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.339634  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1360  translation initiation factor, aIF-2BI family  48.67 
 
 
342 aa  336  2.9999999999999997e-91  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0559648  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4687  methylthioribose-1-phosphate isomerase  50.75 
 
 
350 aa  336  3.9999999999999995e-91  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2312  translation initiation factor, aIF-2BI family  54.68 
 
 
378 aa  333  4e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2078  methylthioribose-1-phosphate isomerase  50 
 
 
353 aa  331  1e-89  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.424406 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1519  aIF-2BI family translation initiation factor  51.48 
 
 
350 aa  331  1e-89  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.889993  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0254  aIF-2BI family translation initiation factor  49.85 
 
 
346 aa  331  1e-89  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3749  putative translation initiation factor, aIF-2BI/5-methylthioribose-1-phosphate isomerase  53.17 
 
 
354 aa  330  2e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2064  aIF-2BI family translation initiation factor  52.23 
 
 
346 aa  330  3e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000777983  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0648  aIF-2BI family translation initiation factor  53.47 
 
 
348 aa  329  5.0000000000000004e-89  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674044  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0485  aIF-2BI family translation initiation factor  54.31 
 
 
353 aa  328  6e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.646058  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1186  translation initiation factor, aIF-2BI family  55.85 
 
 
345 aa  326  4.0000000000000003e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000144196  normal  0.031954 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0156  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized protein  52.82 
 
 
354 aa  325  9e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232234  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0503  translation initiation factor, aIF-2BI family  51.49 
 
 
350 aa  325  1e-87  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0810  aIF-2BI family translation initiation factor  48.97 
 
 
349 aa  324  1e-87  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3753  translation initiation factor, aIF-2BI family  53.37 
 
 
346 aa  322  5e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3646  translation initiation factor, aIF-2BI family  53.08 
 
 
346 aa  321  9.999999999999999e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2349  aIF-2BI family translation initiation factor  51.45 
 
 
358 aa  319  3.9999999999999996e-86  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.944221  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0518  aIF-2BI family translation initiation factor  51.37 
 
 
334 aa  318  7e-86  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.294825  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_459  methylthioribose-1-phosphate isomerase  50.76 
 
 
332 aa  318  7.999999999999999e-86  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.14852  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0076  translation initiation factor 2B subunit I  51.64 
 
 
355 aa  318  9e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0419  translation initiation factor 2B subunit I family (IF-2BI)  47.46 
 
 
347 aa  317  2e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.04546  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2293  initiation factor 2B alpha/beta/delta  54.68 
 
 
348 aa  317  3e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4317  translation initiation factor, aIF-2BI family  54.18 
 
 
339 aa  315  6e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23250  methylthioribose-1-phosphate isomerase  52.96 
 
 
358 aa  315  7e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0078361 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4339  translation initiation factor, aIF-2BI family  54.18 
 
 
339 aa  315  9e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18480  putative translation initiation factor, aIF-2BI family  49.42 
 
 
355 aa  314  9.999999999999999e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0224403  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15800  methylthioribose-1-phosphate isomerase  53.25 
 
 
358 aa  313  2.9999999999999996e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3544  methylthioribose-1-phosphate isomerase  49.7 
 
 
347 aa  313  3.9999999999999997e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1992  translation initiation factor 2B subunit I  48.82 
 
 
348 aa  311  6.999999999999999e-84  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.337411 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2235  translation initiation factor, aIF-2BI family  51.34 
 
 
350 aa  312  6.999999999999999e-84  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2717  methylthioribose-1-phosphate isomerase  49.13 
 
 
349 aa  311  7.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.143544  normal  0.136837 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3396  methylthioribose-1-phosphate isomerase  49.13 
 
 
349 aa  311  7.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1643  translation initiation factor  49.7 
 
 
344 aa  311  1e-83  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.226672  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4186  translation initiation factor 2B subunit I  54.03 
 
 
339 aa  310  2e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2877  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized proteins  51.51 
 
 
350 aa  310  2e-83  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0494  translation initiation factor 2B subunit I  49.85 
 
 
332 aa  309  4e-83  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.93452  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2493  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized protein  52.52 
 
 
351 aa  309  5e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1960  methylthioribose-1-phosphate isomerase  51.78 
 
 
358 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0676  translation initiation factor, aIF-2BI family  45.92 
 
 
339 aa  306  4.0000000000000004e-82  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0103604  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3816  methylthioribose-1-phosphate isomerase  51.2 
 
 
350 aa  305  6e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.732544 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1881  aIF-2BI family translation initiation factor  48.36 
 
 
345 aa  304  1.0000000000000001e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1944  translation initiation factor 2B subunit I  50.9 
 
 
352 aa  303  2.0000000000000002e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00466755  normal  0.570212 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3648  methylthioribose-1-phosphate isomerase  50.42 
 
 
365 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.295966  normal  0.479816 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1646  translation initiation factor, aIF-2BI family  53.98 
 
 
340 aa  300  4e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4079  methylthioribose-1-phosphate isomerase  51.18 
 
 
358 aa  299  6e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.256868 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6765  translation initiation factor, aIF-2BI family  48.6 
 
 
369 aa  298  7e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1744  initiation factor 2 subunit family  49.58 
 
 
358 aa  297  1e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2124  methylthioribose-1-phosphate isomerase  51.21 
 
 
354 aa  298  1e-79  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.369854  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0913  translation initiation factor 2B subunit I  53.45 
 
 
346 aa  295  8e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.659043  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0779  S-methyl-5-thioribose-1-phosphate isomerase  48.52 
 
 
346 aa  294  1e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.404257  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0929  translation initiation factor, aIF-2BI family  45.16 
 
 
344 aa  295  1e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.119435  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0169  aIF-2BI family translation initiation factor  43.07 
 
 
345 aa  294  2e-78  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00178496 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0999  aIF-2BI family translation initiation factor  49.85 
 
 
327 aa  294  2e-78  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.260098  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0191  translation initiation factor, aIF-2BI family  50.31 
 
 
348 aa  293  3e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2043  methylthioribose-1-phosphate isomerase  50.3 
 
 
354 aa  293  4e-78  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1491  translation initiation factor, aIF-2BI family  52.24 
 
 
353 aa  292  5e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.626941  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0846  methylthioribose-1-phosphate isomerase  47.81 
 
 
356 aa  291  8e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2613  translation initiation factor, aIF-2BI family  43.02 
 
 
349 aa  291  1e-77  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1381  translation initiation factor, aIF-2BI family  48.67 
 
 
362 aa  291  2e-77  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.705402  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00735  methylthioribose-1-phosphate isomerase  51.06 
 
 
354 aa  290  2e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.214802  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0573  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized proteins  53.89 
 
 
354 aa  289  6e-77  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0595  translation initiation factor, aIF-2BI family  44.95 
 
 
328 aa  288  7e-77  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1647  translation initiation factor, aIF-2BI family  49.12 
 
 
329 aa  288  1e-76  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1036  translation initiation factor, aIF-2BI family  52.44 
 
 
347 aa  288  1e-76  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.313313  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0027  aIF-2BI family translation initiation factor  45.77 
 
 
337 aa  286  5e-76  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3765  translation initiation factor, aIF-2BI family  51.78 
 
 
345 aa  285  7e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0692423  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1706  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized proteins  47.51 
 
 
349 aa  284  1.0000000000000001e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.307709  normal  0.360385 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4924  methylthioribose-1-phosphate isomerase  45.48 
 
 
348 aa  282  5.000000000000001e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.64519  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0327  methylthioribose-1-phosphate isomerase  45.35 
 
 
348 aa  282  8.000000000000001e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04290  translation initiation factor, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G05830)  46.56 
 
 
379 aa  281  1e-74  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  9.35401e-16 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1847  methylthioribose-1-phosphate isomerase  49.7 
 
 
358 aa  281  1e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0721435  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0927  aIF-2BI family translation initiation factor  45.37 
 
 
323 aa  281  1e-74  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3942  methylthioribose-1-phosphate isomerase  45.66 
 
 
351 aa  280  2e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4251  methylthioribose-1-phosphate isomerase  45.66 
 
 
351 aa  280  2e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0332  methylthioribose-1-phosphate isomerase  45.19 
 
 
348 aa  279  4e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3789  methylthioribose-1-phosphate isomerase  45.86 
 
 
351 aa  279  4e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.700016  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0347  methylthioribose-1-phosphate isomerase  45.19 
 
 
347 aa  279  4e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0379  methylthioribose-1-phosphate isomerase  45.19 
 
 
348 aa  279  4e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1791  translation initiation factor 2B subunit I  44.91 
 
 
321 aa  279  4e-74  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0319  methylthioribose-1-phosphate isomerase  44.9 
 
 
347 aa  279  5e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4159  methylthioribose-1-phosphate isomerase  45.38 
 
 
351 aa  279  5e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.109098  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3774  methylthioribose-1-phosphate isomerase  46.71 
 
 
351 aa  278  7e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4053  methylthioribose-1-phosphate isomerase  46.71 
 
 
351 aa  278  7e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>