242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1992 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1992  translation initiation factor 2B subunit I  100 
 
 
348 aa  704    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.337411 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2064  aIF-2BI family translation initiation factor  50.29 
 
 
346 aa  342  5.999999999999999e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000777983  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1360  translation initiation factor, aIF-2BI family  47.67 
 
 
342 aa  341  1e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0559648  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3560  translation initiation factor, aIF-2BI family  51.59 
 
 
357 aa  340  2.9999999999999998e-92  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0648  aIF-2BI family translation initiation factor  50.88 
 
 
348 aa  331  9e-90  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674044  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1844  initiation factor 2B alpha/beta/delta  51.91 
 
 
335 aa  329  5.0000000000000004e-89  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2349  aIF-2BI family translation initiation factor  50.86 
 
 
358 aa  328  9e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.944221  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0621  translation initiation factor 2B subunit I  48.1 
 
 
342 aa  326  3e-88  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0997628  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0254  aIF-2BI family translation initiation factor  49.56 
 
 
346 aa  325  7e-88  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0016  aIF-2BI family translation initiation factor  48.24 
 
 
343 aa  323  4e-87  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.570831  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0016  aIF-2BI family translation initiation factor  48.24 
 
 
343 aa  323  4e-87  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.339634  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0491  translation initiation factor 2B subunit I  53.96 
 
 
337 aa  320  1.9999999999999998e-86  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.23967 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1519  aIF-2BI family translation initiation factor  48.09 
 
 
350 aa  320  3e-86  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.889993  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0510  aIF-2BI family translation initiation factor  48.26 
 
 
346 aa  320  3e-86  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1175  translation initiation factor 2B subunit I  46.94 
 
 
354 aa  319  3.9999999999999996e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4322  aIF-2BI family translation initiation factor  45.91 
 
 
346 aa  319  5e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.394096  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3596  translation initiation factor, aIF-2BI family  48.39 
 
 
346 aa  318  6e-86  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.82629  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0503  translation initiation factor, aIF-2BI family  51.06 
 
 
350 aa  317  2e-85  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0810  aIF-2BI family translation initiation factor  48.2 
 
 
349 aa  315  5e-85  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0072  translation initiation factor 2B subunit I  46.38 
 
 
346 aa  312  4.999999999999999e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.25912 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0327  methylthioribose-1-phosphate isomerase  48.37 
 
 
348 aa  311  1e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4924  methylthioribose-1-phosphate isomerase  47.77 
 
 
348 aa  310  2e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.64519  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3379  aIF-2BI family translation initiation factor  46.15 
 
 
346 aa  308  6.999999999999999e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0485  aIF-2BI family translation initiation factor  49.86 
 
 
353 aa  308  6.999999999999999e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.646058  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0441  methylthioribose-1-phosphate isomerase  47.77 
 
 
348 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0319  methylthioribose-1-phosphate isomerase  47.48 
 
 
347 aa  306  3e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6765  translation initiation factor, aIF-2BI family  48.6 
 
 
369 aa  306  3e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0332  methylthioribose-1-phosphate isomerase  47.48 
 
 
348 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0379  methylthioribose-1-phosphate isomerase  47.48 
 
 
348 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0347  methylthioribose-1-phosphate isomerase  47.48 
 
 
347 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0156  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized protein  50 
 
 
354 aa  305  1.0000000000000001e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232234  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1015  translation initiation factor, aIF-2BI family  49.11 
 
 
350 aa  305  1.0000000000000001e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.253315  unclonable  0.0000000000388932 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0893  translation initiation factor, putative, aIF-2BI family  49.11 
 
 
350 aa  305  1.0000000000000001e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.592347  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0394  methylthioribose-1-phosphate isomerase  46.88 
 
 
348 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4687  methylthioribose-1-phosphate isomerase  46.63 
 
 
350 aa  304  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0316  methylthioribose-1-phosphate isomerase  47.18 
 
 
348 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3749  putative translation initiation factor, aIF-2BI/5-methylthioribose-1-phosphate isomerase  49.7 
 
 
354 aa  301  1e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4334  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized protein  51.22 
 
 
337 aa  301  2e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1186  translation initiation factor, aIF-2BI family  51.03 
 
 
345 aa  300  2e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000144196  normal  0.031954 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1881  aIF-2BI family translation initiation factor  47.51 
 
 
345 aa  299  5e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3646  translation initiation factor, aIF-2BI family  48.4 
 
 
346 aa  299  5e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3765  translation initiation factor, aIF-2BI family  48.84 
 
 
345 aa  299  6e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0692423  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3753  translation initiation factor, aIF-2BI family  48.1 
 
 
346 aa  297  2e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18480  putative translation initiation factor, aIF-2BI family  48.52 
 
 
355 aa  296  5e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0224403  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1534  translation initiation factor, aIF-2BI family  48.19 
 
 
348 aa  294  2e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3544  methylthioribose-1-phosphate isomerase  46.22 
 
 
347 aa  293  3e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4317  translation initiation factor, aIF-2BI family  50 
 
 
339 aa  293  3e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23250  methylthioribose-1-phosphate isomerase  47.65 
 
 
358 aa  293  4e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0078361 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1643  translation initiation factor  45.92 
 
 
344 aa  292  7e-78  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.226672  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15800  methylthioribose-1-phosphate isomerase  47.11 
 
 
358 aa  292  7e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1036  translation initiation factor, aIF-2BI family  48.8 
 
 
347 aa  292  7e-78  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.313313  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0964  translation initiation factor, aIF-2BI family  50.89 
 
 
351 aa  292  8e-78  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.518904  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4339  translation initiation factor, aIF-2BI family  49.71 
 
 
339 aa  291  9e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1960  methylthioribose-1-phosphate isomerase  47.95 
 
 
358 aa  290  2e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4186  translation initiation factor 2B subunit I  51.2 
 
 
339 aa  291  2e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0027  aIF-2BI family translation initiation factor  44.9 
 
 
337 aa  290  2e-77  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0676  translation initiation factor, aIF-2BI family  46.2 
 
 
339 aa  290  4e-77  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0103604  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1203  translation initiation factor, aIF-2BI family  48.92 
 
 
358 aa  289  4e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2613  translation initiation factor, aIF-2BI family  42.14 
 
 
349 aa  288  8e-77  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0999  aIF-2BI family translation initiation factor  47.69 
 
 
327 aa  288  1e-76  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.260098  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2078  methylthioribose-1-phosphate isomerase  42.9 
 
 
353 aa  286  5e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.424406 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00735  methylthioribose-1-phosphate isomerase  46.39 
 
 
354 aa  285  8e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.214802  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0419  translation initiation factor 2B subunit I family (IF-2BI)  43.32 
 
 
347 aa  284  1.0000000000000001e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.04546  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0662  aIF-2BI family translation initiation factor  46.99 
 
 
365 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.437714 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0674  translation initiation factor, aIF-2BI family  46.99 
 
 
365 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.887106  normal  0.0224655 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2386  methylthioribose-1-phosphate isomerase  47.26 
 
 
364 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0076  translation initiation factor 2B subunit I  47.26 
 
 
355 aa  284  2.0000000000000002e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6703  translation initiation factor, aIF-2BI family  50.3 
 
 
364 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1050  methylthioribose-1-phosphate isomerase  47.26 
 
 
364 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.246086  normal  0.396346 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2877  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized proteins  46.31 
 
 
350 aa  283  4.0000000000000003e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1647  translation initiation factor, aIF-2BI family  47.11 
 
 
329 aa  282  6.000000000000001e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0929  translation initiation factor, aIF-2BI family  40.99 
 
 
344 aa  282  7.000000000000001e-75  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.119435  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3816  methylthioribose-1-phosphate isomerase  46.57 
 
 
350 aa  282  7.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.732544 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0169  aIF-2BI family translation initiation factor  41.64 
 
 
345 aa  281  9e-75  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00178496 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2235  translation initiation factor, aIF-2BI family  46.76 
 
 
350 aa  280  2e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4098  methylthioribose-1-phosphate isomerase  43.75 
 
 
351 aa  280  3e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.463174  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1944  translation initiation factor 2B subunit I  44.79 
 
 
352 aa  280  3e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00466755  normal  0.570212 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1886  methylthioribose-1-phosphate isomerase  46.69 
 
 
362 aa  279  4e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.876537  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0927  aIF-2BI family translation initiation factor  44.51 
 
 
323 aa  279  4e-74  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3942  methylthioribose-1-phosphate isomerase  43.24 
 
 
351 aa  279  6e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4251  methylthioribose-1-phosphate isomerase  43.24 
 
 
351 aa  279  6e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1099  methylthioribose-1-phosphate isomerase  43.24 
 
 
353 aa  278  7e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.767768 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0846  methylthioribose-1-phosphate isomerase  44.57 
 
 
356 aa  278  7e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3774  methylthioribose-1-phosphate isomerase  43.45 
 
 
351 aa  278  1e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3789  methylthioribose-1-phosphate isomerase  43.75 
 
 
351 aa  278  1e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.700016  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2170  aIF-2BI family translation initiation factor  50.9 
 
 
344 aa  278  1e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2312  translation initiation factor, aIF-2BI family  48.06 
 
 
378 aa  278  1e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4121  aIF-2BI family translation initiation factor  47.95 
 
 
367 aa  278  1e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4159  methylthioribose-1-phosphate isomerase  43.45 
 
 
351 aa  278  1e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.109098  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4053  methylthioribose-1-phosphate isomerase  42.94 
 
 
351 aa  277  2e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1744  initiation factor 2 subunit family  47.26 
 
 
358 aa  276  3e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3648  methylthioribose-1-phosphate isomerase  46.8 
 
 
365 aa  276  3e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.295966  normal  0.479816 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2043  methylthioribose-1-phosphate isomerase  43.88 
 
 
354 aa  276  3e-73  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1646  translation initiation factor, aIF-2BI family  47.98 
 
 
340 aa  276  4e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4139  methylthioribose-1-phosphate isomerase  42.94 
 
 
353 aa  276  4e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.196624  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1491  translation initiation factor, aIF-2BI family  48.38 
 
 
353 aa  276  5e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.626941  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2493  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized protein  47.45 
 
 
351 aa  276  5e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2124  methylthioribose-1-phosphate isomerase  43.88 
 
 
354 aa  276  5e-73  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.369854  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0518  aIF-2BI family translation initiation factor  44.38 
 
 
334 aa  275  1.0000000000000001e-72  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.294825  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0913  translation initiation factor 2B subunit I  50.15 
 
 
346 aa  275  1.0000000000000001e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.659043  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>