239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0676 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0676  translation initiation factor, aIF-2BI family  100 
 
 
339 aa  696    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0103604  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1360  translation initiation factor, aIF-2BI family  57.52 
 
 
342 aa  377  1e-103  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0559648  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0595  translation initiation factor, aIF-2BI family  56.71 
 
 
328 aa  368  1e-101  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0016  aIF-2BI family translation initiation factor  52.92 
 
 
343 aa  343  2e-93  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.570831  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0016  aIF-2BI family translation initiation factor  52.92 
 
 
343 aa  343  2e-93  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.339634  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1175  translation initiation factor 2B subunit I  47.51 
 
 
354 aa  328  9e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3379  aIF-2BI family translation initiation factor  50.76 
 
 
346 aa  327  1.0000000000000001e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4322  aIF-2BI family translation initiation factor  49.56 
 
 
346 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.394096  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0072  translation initiation factor 2B subunit I  51.37 
 
 
346 aa  326  3e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.25912 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0810  aIF-2BI family translation initiation factor  49.71 
 
 
349 aa  325  1e-87  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0964  translation initiation factor, aIF-2BI family  48.39 
 
 
351 aa  323  2e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.518904  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4334  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized protein  49.23 
 
 
337 aa  323  3e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0254  aIF-2BI family translation initiation factor  48.55 
 
 
346 aa  321  9.000000000000001e-87  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3749  putative translation initiation factor, aIF-2BI/5-methylthioribose-1-phosphate isomerase  45.11 
 
 
354 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0510  aIF-2BI family translation initiation factor  48.4 
 
 
346 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0621  translation initiation factor 2B subunit I  50 
 
 
342 aa  320  3e-86  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0997628  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0419  translation initiation factor 2B subunit I family (IF-2BI)  50.3 
 
 
347 aa  318  7e-86  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.04546  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1519  aIF-2BI family translation initiation factor  49.28 
 
 
350 aa  317  2e-85  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.889993  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1881  aIF-2BI family translation initiation factor  51.88 
 
 
345 aa  317  2e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3596  translation initiation factor, aIF-2BI family  49.7 
 
 
346 aa  316  4e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.82629  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23250  methylthioribose-1-phosphate isomerase  50 
 
 
358 aa  315  8e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0078361 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4687  methylthioribose-1-phosphate isomerase  48.52 
 
 
350 aa  312  4.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0929  translation initiation factor, aIF-2BI family  48.83 
 
 
344 aa  310  2e-83  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.119435  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0648  aIF-2BI family translation initiation factor  48.68 
 
 
348 aa  310  2.9999999999999997e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674044  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1960  methylthioribose-1-phosphate isomerase  48.84 
 
 
358 aa  308  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1534  translation initiation factor, aIF-2BI family  47.09 
 
 
348 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3544  methylthioribose-1-phosphate isomerase  48.18 
 
 
347 aa  307  2.0000000000000002e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3560  translation initiation factor, aIF-2BI family  47.02 
 
 
357 aa  305  8.000000000000001e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4924  methylthioribose-1-phosphate isomerase  48.39 
 
 
348 aa  305  8.000000000000001e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.64519  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6765  translation initiation factor, aIF-2BI family  46.61 
 
 
369 aa  305  1.0000000000000001e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0332  methylthioribose-1-phosphate isomerase  47.8 
 
 
348 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0379  methylthioribose-1-phosphate isomerase  47.8 
 
 
348 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0319  methylthioribose-1-phosphate isomerase  47.35 
 
 
347 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0347  methylthioribose-1-phosphate isomerase  47.8 
 
 
347 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0394  methylthioribose-1-phosphate isomerase  47.94 
 
 
348 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1543  translation initiation factor, aIF-2BI family  50.76 
 
 
333 aa  303  4.0000000000000003e-81  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0321135  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0327  methylthioribose-1-phosphate isomerase  48.39 
 
 
348 aa  302  5.000000000000001e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18480  putative translation initiation factor, aIF-2BI family  51.34 
 
 
355 aa  301  1e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0224403  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2064  aIF-2BI family translation initiation factor  49.56 
 
 
346 aa  301  1e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000777983  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15800  methylthioribose-1-phosphate isomerase  47.69 
 
 
358 aa  300  2e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4339  translation initiation factor, aIF-2BI family  46.75 
 
 
339 aa  300  3e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4317  translation initiation factor, aIF-2BI family  46.45 
 
 
339 aa  300  3e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0316  methylthioribose-1-phosphate isomerase  47.21 
 
 
348 aa  299  4e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1944  translation initiation factor 2B subunit I  45.38 
 
 
352 aa  299  4e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00466755  normal  0.570212 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3753  translation initiation factor, aIF-2BI family  48.4 
 
 
346 aa  298  1e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3646  translation initiation factor, aIF-2BI family  49.42 
 
 
346 aa  298  1e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0441  methylthioribose-1-phosphate isomerase  47.21 
 
 
348 aa  298  1e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2078  methylthioribose-1-phosphate isomerase  46.13 
 
 
353 aa  298  1e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.424406 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0779  S-methyl-5-thioribose-1-phosphate isomerase  46.96 
 
 
346 aa  298  1e-79  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.404257  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1643  translation initiation factor  48.17 
 
 
344 aa  298  1e-79  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.226672  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3816  methylthioribose-1-phosphate isomerase  47.15 
 
 
350 aa  297  2e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.732544 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1744  initiation factor 2 subunit family  47.98 
 
 
358 aa  297  2e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1186  translation initiation factor, aIF-2BI family  56.32 
 
 
345 aa  297  2e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000144196  normal  0.031954 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1647  translation initiation factor, aIF-2BI family  46.32 
 
 
329 aa  297  2e-79  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1015  translation initiation factor, aIF-2BI family  45.92 
 
 
350 aa  297  2e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.253315  unclonable  0.0000000000388932 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0893  translation initiation factor, putative, aIF-2BI family  45.92 
 
 
350 aa  297  2e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.592347  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0503  translation initiation factor, aIF-2BI family  43.75 
 
 
350 aa  296  3e-79  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3648  methylthioribose-1-phosphate isomerase  47.98 
 
 
365 aa  296  5e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.295966  normal  0.479816 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2170  aIF-2BI family translation initiation factor  48.66 
 
 
344 aa  295  6e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4186  translation initiation factor 2B subunit I  47.56 
 
 
339 aa  295  7e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0156  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized protein  47.48 
 
 
354 aa  295  8e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232234  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1791  translation initiation factor 2B subunit I  51.69 
 
 
321 aa  295  1e-78  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0485  aIF-2BI family translation initiation factor  49.08 
 
 
353 aa  294  2e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.646058  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3765  translation initiation factor, aIF-2BI family  46.82 
 
 
345 aa  291  1e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0692423  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1203  translation initiation factor, aIF-2BI family  44.01 
 
 
358 aa  291  1e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00735  methylthioribose-1-phosphate isomerase  43.95 
 
 
354 aa  291  1e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.214802  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0999  aIF-2BI family translation initiation factor  44.95 
 
 
327 aa  290  2e-77  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.260098  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1992  translation initiation factor 2B subunit I  46.2 
 
 
348 aa  290  4e-77  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.337411 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4079  methylthioribose-1-phosphate isomerase  47.69 
 
 
358 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.256868 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0865  aIF-2BI family translation initiation factor  51.38 
 
 
321 aa  288  1e-76  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0114166 
 
 
-
 
NC_002936  DET0518  aIF-2BI family translation initiation factor  47.93 
 
 
334 aa  287  2e-76  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.294825  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0076  translation initiation factor 2B subunit I  46.5 
 
 
355 aa  287  2e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_459  methylthioribose-1-phosphate isomerase  48.06 
 
 
332 aa  287  2e-76  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.14852  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1052  aIF-2BI family translation initiation factor  51.23 
 
 
321 aa  287  2e-76  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3396  methylthioribose-1-phosphate isomerase  47.95 
 
 
349 aa  286  2.9999999999999996e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2717  methylthioribose-1-phosphate isomerase  47.95 
 
 
349 aa  286  2.9999999999999996e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.143544  normal  0.136837 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1036  translation initiation factor, aIF-2BI family  46.36 
 
 
347 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.313313  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0027  aIF-2BI family translation initiation factor  49.85 
 
 
337 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2877  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized proteins  47.1 
 
 
350 aa  286  4e-76  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1844  initiation factor 2B alpha/beta/delta  44.34 
 
 
335 aa  285  5e-76  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2235  translation initiation factor, aIF-2BI family  44.41 
 
 
350 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1847  methylthioribose-1-phosphate isomerase  47.11 
 
 
358 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0721435  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2312  translation initiation factor, aIF-2BI family  44.41 
 
 
378 aa  283  3.0000000000000004e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1706  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized proteins  44.83 
 
 
349 aa  283  4.0000000000000003e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.307709  normal  0.360385 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1971  translation initiation factor, aIF-2BI family  42.49 
 
 
345 aa  282  6.000000000000001e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00568517  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2043  methylthioribose-1-phosphate isomerase  41.89 
 
 
354 aa  280  2e-74  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2349  aIF-2BI family translation initiation factor  43.9 
 
 
358 aa  280  3e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.944221  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0494  translation initiation factor 2B subunit I  46.25 
 
 
332 aa  279  5e-74  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.93452  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1381  translation initiation factor, aIF-2BI family  45.2 
 
 
362 aa  278  1e-73  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.705402  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0927  aIF-2BI family translation initiation factor  50.31 
 
 
323 aa  277  1e-73  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2124  methylthioribose-1-phosphate isomerase  41.42 
 
 
354 aa  277  2e-73  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.369854  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2493  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized protein  47.73 
 
 
351 aa  276  3e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1646  translation initiation factor, aIF-2BI family  47.18 
 
 
340 aa  276  5e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1491  translation initiation factor, aIF-2BI family  46.27 
 
 
353 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.626941  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2269  translation initiation factor 2B subunit I  42.86 
 
 
349 aa  272  5.000000000000001e-72  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2293  initiation factor 2B alpha/beta/delta  44.38 
 
 
348 aa  271  1e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0913  translation initiation factor 2B subunit I  45.48 
 
 
346 aa  271  1e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.659043  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0169  aIF-2BI family translation initiation factor  41.64 
 
 
345 aa  267  2e-70  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00178496 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1694  aIF-2BI family translation initiation factor  42.31 
 
 
353 aa  265  8e-70  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0703  translation initiation factor 2B subunit I  45.19 
 
 
351 aa  264  1e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000787843 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>