241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_1543 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_1543  translation initiation factor, aIF-2BI family  100 
 
 
333 aa  684    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0321135  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0621  translation initiation factor 2B subunit I  52.25 
 
 
342 aa  323  3e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0997628  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1360  translation initiation factor, aIF-2BI family  50.15 
 
 
342 aa  319  3.9999999999999996e-86  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0559648  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1791  translation initiation factor 2B subunit I  53.58 
 
 
321 aa  317  2e-85  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0676  translation initiation factor, aIF-2BI family  50.76 
 
 
339 aa  316  3e-85  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0103604  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0016  aIF-2BI family translation initiation factor  54.24 
 
 
343 aa  316  4e-85  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.570831  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0016  aIF-2BI family translation initiation factor  54.24 
 
 
343 aa  316  4e-85  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.339634  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0927  aIF-2BI family translation initiation factor  52.83 
 
 
323 aa  312  5.999999999999999e-84  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0072  translation initiation factor 2B subunit I  49.85 
 
 
346 aa  309  4e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.25912 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0027  aIF-2BI family translation initiation factor  50.74 
 
 
337 aa  309  4e-83  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3560  translation initiation factor, aIF-2BI family  48.72 
 
 
357 aa  308  9e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0254  aIF-2BI family translation initiation factor  51.51 
 
 
346 aa  306  2.0000000000000002e-82  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4322  aIF-2BI family translation initiation factor  50.15 
 
 
346 aa  307  2.0000000000000002e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.394096  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3749  putative translation initiation factor, aIF-2BI/5-methylthioribose-1-phosphate isomerase  47.2 
 
 
354 aa  306  3e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1052  aIF-2BI family translation initiation factor  52.35 
 
 
321 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0865  aIF-2BI family translation initiation factor  52.65 
 
 
321 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0114166 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0485  aIF-2BI family translation initiation factor  51.48 
 
 
353 aa  304  1.0000000000000001e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.646058  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0419  translation initiation factor 2B subunit I family (IF-2BI)  47.9 
 
 
347 aa  302  4.0000000000000003e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.04546  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0810  aIF-2BI family translation initiation factor  48.97 
 
 
349 aa  302  5.000000000000001e-81  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3379  aIF-2BI family translation initiation factor  48.36 
 
 
346 aa  302  6.000000000000001e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1519  aIF-2BI family translation initiation factor  50.87 
 
 
350 aa  301  1e-80  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.889993  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0510  aIF-2BI family translation initiation factor  50 
 
 
346 aa  300  3e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0595  translation initiation factor, aIF-2BI family  47.76 
 
 
328 aa  299  4e-80  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1881  aIF-2BI family translation initiation factor  49.42 
 
 
345 aa  299  5e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0999  aIF-2BI family translation initiation factor  49.37 
 
 
327 aa  296  3e-79  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.260098  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2349  aIF-2BI family translation initiation factor  47.29 
 
 
358 aa  296  4e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.944221  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1971  methylthioribose-1-phosphate isomerase  47.95 
 
 
359 aa  295  7e-79  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0156  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized protein  50.44 
 
 
354 aa  294  1e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232234  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3353  translation initiation factor, aIF-2BI family  48.7 
 
 
366 aa  294  2e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5890  methylthioribose-1-phosphate isomerase  48.12 
 
 
364 aa  291  1e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0342096  normal  0.365892 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3596  translation initiation factor, aIF-2BI family  47.93 
 
 
346 aa  290  2e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.82629  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0665  aIF-2BI family translation initiation factor  48.44 
 
 
362 aa  291  2e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.360605  normal  0.588664 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0161  methylthioribose-1-phosphate isomerase  48.15 
 
 
367 aa  289  4e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4832  methylthioribose-1-phosphate isomerase  47.41 
 
 
364 aa  288  8e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.633545  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4687  methylthioribose-1-phosphate isomerase  45.88 
 
 
350 aa  286  2.9999999999999996e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1647  translation initiation factor, aIF-2BI family  49.01 
 
 
329 aa  286  2.9999999999999996e-76  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3753  translation initiation factor, aIF-2BI family  50 
 
 
346 aa  286  4e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2170  aIF-2BI family translation initiation factor  49.85 
 
 
344 aa  286  5e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3646  translation initiation factor, aIF-2BI family  50 
 
 
346 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2078  methylthioribose-1-phosphate isomerase  45.1 
 
 
353 aa  283  2.0000000000000002e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.424406 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0648  methylthioribose-1-phosphate isomerase  46.8 
 
 
367 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3544  methylthioribose-1-phosphate isomerase  45.27 
 
 
347 aa  282  5.000000000000001e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25341  methylthioribose-1-phosphate isomerase  45.13 
 
 
370 aa  281  9e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2613  translation initiation factor, aIF-2BI family  46.04 
 
 
349 aa  280  2e-74  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1643  translation initiation factor  47.34 
 
 
344 aa  280  3e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.226672  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3816  methylthioribose-1-phosphate isomerase  48.5 
 
 
350 aa  280  3e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.732544 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0929  translation initiation factor, aIF-2BI family  45.72 
 
 
344 aa  279  4e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.119435  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2386  methylthioribose-1-phosphate isomerase  46.04 
 
 
364 aa  279  4e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1050  methylthioribose-1-phosphate isomerase  46.04 
 
 
364 aa  278  6e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.246086  normal  0.396346 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0451  methylthioribose-1-phosphate isomerase  45.79 
 
 
365 aa  278  8e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4334  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized protein  47.04 
 
 
337 aa  278  8e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6765  translation initiation factor, aIF-2BI family  47.18 
 
 
369 aa  277  1e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1886  methylthioribose-1-phosphate isomerase  46.18 
 
 
362 aa  278  1e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.876537  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1203  translation initiation factor, aIF-2BI family  44.31 
 
 
358 aa  277  2e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1175  translation initiation factor 2B subunit I  47.87 
 
 
354 aa  276  3e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0648  aIF-2BI family translation initiation factor  46.65 
 
 
348 aa  275  7e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674044  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1015  translation initiation factor, aIF-2BI family  47.58 
 
 
350 aa  275  7e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.253315  unclonable  0.0000000000388932 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0893  translation initiation factor, putative, aIF-2BI family  47.58 
 
 
350 aa  275  7e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.592347  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4936  methylthioribose-1-phosphate isomerase  45.82 
 
 
373 aa  275  9e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.313039 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5307  methylthioribose-1-phosphate isomerase  46.38 
 
 
374 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0674  translation initiation factor, aIF-2BI family  46.85 
 
 
365 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.887106  normal  0.0224655 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0662  aIF-2BI family translation initiation factor  47.15 
 
 
365 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.437714 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2247  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized protein  46.76 
 
 
364 aa  273  2.0000000000000002e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.679143  normal  0.145902 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0521  methylthioribose-1-phosphate isomerase  44.8 
 
 
367 aa  272  6e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18480  putative translation initiation factor, aIF-2BI family  48.22 
 
 
355 aa  272  7e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0224403  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4697  methylthioribose-1-phosphate isomerase  45.58 
 
 
374 aa  271  1e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.293654  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2312  translation initiation factor, aIF-2BI family  46.34 
 
 
378 aa  270  2e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0518  aIF-2BI family translation initiation factor  46.69 
 
 
334 aa  270  2.9999999999999997e-71  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.294825  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1992  translation initiation factor 2B subunit I  44.55 
 
 
348 aa  269  5e-71  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.337411 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2064  aIF-2BI family translation initiation factor  47.59 
 
 
346 aa  269  5.9999999999999995e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000777983  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0494  translation initiation factor 2B subunit I  44.68 
 
 
332 aa  269  5.9999999999999995e-71  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.93452  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_459  methylthioribose-1-phosphate isomerase  46.06 
 
 
332 aa  268  7e-71  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.14852  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0623  putative translation initiation factor, aIF-2BI/5-methylthioribose-1-phosphate isomerase  46.04 
 
 
354 aa  268  8e-71  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.242304  normal  0.23951 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0964  translation initiation factor, aIF-2BI family  48.8 
 
 
351 aa  268  1e-70  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.518904  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4113  aIF-2BI family translation initiation factor  44.93 
 
 
360 aa  268  1e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4407  methylthioribose-1-phosphate isomerase  44.8 
 
 
374 aa  268  1e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.791642  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4121  aIF-2BI family translation initiation factor  45.05 
 
 
367 aa  268  1e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0846  methylthioribose-1-phosphate isomerase  44.28 
 
 
356 aa  267  2e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6703  translation initiation factor, aIF-2BI family  45.38 
 
 
364 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3396  methylthioribose-1-phosphate isomerase  46.92 
 
 
349 aa  265  8e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2717  methylthioribose-1-phosphate isomerase  46.92 
 
 
349 aa  265  8e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.143544  normal  0.136837 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1186  translation initiation factor, aIF-2BI family  50.32 
 
 
345 aa  264  2e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000144196  normal  0.031954 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1306  eIF-2B alpha/beta/delta-related protein  46.51 
 
 
369 aa  263  2e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0012837  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0076  translation initiation factor 2B subunit I  45.73 
 
 
355 aa  263  3e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4186  translation initiation factor 2B subunit I  46.11 
 
 
339 aa  262  6e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0779  S-methyl-5-thioribose-1-phosphate isomerase  45.32 
 
 
346 aa  262  6e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.404257  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3292  methylthioribose-1-phosphate isomerase  44.28 
 
 
356 aa  262  6e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.178535  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0360  methylthioribose-1-phosphate isomerase  45.51 
 
 
390 aa  262  8e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23250  methylthioribose-1-phosphate isomerase  47.01 
 
 
358 aa  261  8e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0078361 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4339  translation initiation factor, aIF-2BI family  45.79 
 
 
339 aa  261  1e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1944  translation initiation factor 2B subunit I  44.61 
 
 
352 aa  261  2e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00466755  normal  0.570212 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4317  translation initiation factor, aIF-2BI family  45.48 
 
 
339 aa  261  2e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3335  methylthioribose-1-phosphate isomerase  46.93 
 
 
362 aa  260  3e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000368125 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6183  aIF-2BI family translation initiation factor  44.44 
 
 
365 aa  259  4e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.995024  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2235  translation initiation factor, aIF-2BI family  45.77 
 
 
350 aa  259  4e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1036  translation initiation factor, aIF-2BI family  46.2 
 
 
347 aa  259  7e-68  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.313313  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1971  translation initiation factor, aIF-2BI family  42.68 
 
 
345 aa  258  8e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00568517  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3765  translation initiation factor, aIF-2BI family  47.66 
 
 
345 aa  258  1e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0692423  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0191  translation initiation factor, aIF-2BI family  46.06 
 
 
348 aa  258  1e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0703  translation initiation factor 2B subunit I  49.24 
 
 
351 aa  257  2e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000787843 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>