233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2247 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2247  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized protein  100 
 
 		 364 aa  741    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.679143  normal  0.145902 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6703  translation initiation factor, aIF-2BI family  67.22 
 
 		 364 aa  481  1e-135  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0674  translation initiation factor, aIF-2BI family  65.29 
 
 		 365 aa  481  1e-135  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.887106  normal  0.0224655 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0662  aIF-2BI family translation initiation factor  65.01 
 
 		 365 aa  479  1e-134  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.437714 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4697  methylthioribose-1-phosphate isomerase  65.56 
 
 		 374 aa  477  1e-133  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.293654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4407  methylthioribose-1-phosphate isomerase  65.56 
 
 		 374 aa  477  1e-133  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.791642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5307  methylthioribose-1-phosphate isomerase  65.84 
 
 		 374 aa  472  1e-132  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0648  methylthioribose-1-phosphate isomerase  64.56 
 
 		 367 aa  468  1.0000000000000001e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6183  aIF-2BI family translation initiation factor  67.77 
 
 		 365 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.995024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0641  translation initiation factor, aIF-2BI family  65.84 
 
 		 365 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.173819 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4121  aIF-2BI family translation initiation factor  63.19 
 
 		 367 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0451  methylthioribose-1-phosphate isomerase  64.19 
 
 		 365 aa  457  1e-127  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4832  methylthioribose-1-phosphate isomerase  62.64 
 
 		 364 aa  456  1e-127  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.633545  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5890  methylthioribose-1-phosphate isomerase  62.64 
 
 		 364 aa  455  1e-127  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0342096  normal  0.365892 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4936  methylthioribose-1-phosphate isomerase  64.74 
 
 		 373 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.313039 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0521  methylthioribose-1-phosphate isomerase  63.26 
 
 		 367 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0665  aIF-2BI family translation initiation factor  60.22 
 
 		 362 aa  444  1e-123  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.360605  normal  0.588664 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0161  methylthioribose-1-phosphate isomerase  65.29 
 
 		 367 aa  443  1e-123  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4113  aIF-2BI family translation initiation factor  65.82 
 
 		 360 aa  439  9.999999999999999e-123  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3353  translation initiation factor, aIF-2BI family  61.43 
 
 		 366 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0360  methylthioribose-1-phosphate isomerase  63.22 
 
 		 390 aa  435  1e-121  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25341  methylthioribose-1-phosphate isomerase  61.31 
 
 		 370 aa  431  1e-119  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1050  methylthioribose-1-phosphate isomerase  62.05 
 
 		 364 aa  430  1e-119  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.246086  normal  0.396346 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1886  methylthioribose-1-phosphate isomerase  61.05 
 
 		 362 aa  429  1e-119  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.876537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2386  methylthioribose-1-phosphate isomerase  61.77 
 
 		 364 aa  427  1e-118  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1306  eIF-2B alpha/beta/delta-related protein  56.94 
 
 		 369 aa  377  1e-103  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0012837  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1913  methylthioribose-1-phosphate isomerase  56.7 
 
 		 375 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000486735  normal  0.985387 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3335  methylthioribose-1-phosphate isomerase  55.12 
 
 		 362 aa  347  2e-94  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000368125 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1971  methylthioribose-1-phosphate isomerase  48.6 
 
 		 359 aa  332  8e-90  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3292  methylthioribose-1-phosphate isomerase  51 
 
 		 356 aa  315  6e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.178535  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1543  translation initiation factor, aIF-2BI family  46.76 
 
 		 333 aa  268  2e-70  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0321135  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1992  translation initiation factor 2B subunit I  47.79 
 
 		 348 aa  267  2.9999999999999995e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.337411 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2349  aIF-2BI family translation initiation factor  46.43 
 
 		 358 aa  266  2.9999999999999995e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.944221  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4322  aIF-2BI family translation initiation factor  44.82 
 
 		 346 aa  263  3e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.394096  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0072  translation initiation factor 2B subunit I  44.63 
 
 		 346 aa  256  4e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.25912 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3379  aIF-2BI family translation initiation factor  44.76 
 
 		 346 aa  256  6e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3560  translation initiation factor, aIF-2BI family  44.76 
 
 		 357 aa  255  8e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0621  translation initiation factor 2B subunit I  43.4 
 
 		 342 aa  254  1.0000000000000001e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0997628  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0676  translation initiation factor, aIF-2BI family  41.3 
 
 		 339 aa  250  3e-65  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0103604  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1360  translation initiation factor, aIF-2BI family  41.26 
 
 		 342 aa  249  4e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0559648  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3544  methylthioribose-1-phosphate isomerase  42.07 
 
 		 347 aa  249  4e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0016  aIF-2BI family translation initiation factor  43.4 
 
 		 343 aa  246  6e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.570831  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0016  aIF-2BI family translation initiation factor  43.4 
 
 		 343 aa  246  6e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.339634  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0156  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized protein  45.92 
 
 		 354 aa  246  6.999999999999999e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0999  aIF-2BI family translation initiation factor  46.48 
 
 		 327 aa  245  9e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.260098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0510  aIF-2BI family translation initiation factor  42.58 
 
 		 346 aa  245  9.999999999999999e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4687  methylthioribose-1-phosphate isomerase  42.07 
 
 		 350 aa  241  1e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3596  translation initiation factor, aIF-2BI family  42.74 
 
 		 346 aa  241  2e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.82629  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1791  translation initiation factor 2B subunit I  42.15 
 
 		 321 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1175  translation initiation factor 2B subunit I  42.05 
 
 		 354 aa  239  5e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1647  translation initiation factor, aIF-2BI family  46.48 
 
 		 329 aa  239  6.999999999999999e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0927  aIF-2BI family translation initiation factor  41.59 
 
 		 323 aa  238  1e-61  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3816  methylthioribose-1-phosphate isomerase  41.95 
 
 		 350 aa  236  4e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.732544 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0254  aIF-2BI family translation initiation factor  41.62 
 
 		 346 aa  236  6e-61  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1643  translation initiation factor  41.21 
 
 		 344 aa  235  8e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.226672  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3753  translation initiation factor, aIF-2BI family  42.86 
 
 		 346 aa  235  9e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3646  translation initiation factor, aIF-2BI family  42.58 
 
 		 346 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0485  aIF-2BI family translation initiation factor  45.35 
 
 		 353 aa  234  2.0000000000000002e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.646058  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2613  translation initiation factor, aIF-2BI family  39.41 
 
 		 349 aa  234  3e-60  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2312  translation initiation factor, aIF-2BI family  45.86 
 
 		 378 aa  233  5e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1052  aIF-2BI family translation initiation factor  41.23 
 
 		 321 aa  232  7.000000000000001e-60  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4334  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized protein  45.43 
 
 		 337 aa  230  2e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1519  aIF-2BI family translation initiation factor  39.72 
 
 		 350 aa  231  2e-59  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.889993  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0327  methylthioribose-1-phosphate isomerase  41.26 
 
 		 348 aa  230  3e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3749  putative translation initiation factor, aIF-2BI/5-methylthioribose-1-phosphate isomerase  44.38 
 
 		 354 aa  230  4e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0865  aIF-2BI family translation initiation factor  40.94 
 
 		 321 aa  229  4e-59  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0114166 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0595  translation initiation factor, aIF-2BI family  38.6 
 
 		 328 aa  229  6e-59  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0394  methylthioribose-1-phosphate isomerase  40.34 
 
 		 348 aa  229  8e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0027  aIF-2BI family translation initiation factor  37.43 
 
 		 337 aa  228  9e-59  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3774  methylthioribose-1-phosphate isomerase  37.82 
 
 		 351 aa  228  1e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2078  methylthioribose-1-phosphate isomerase  40 
 
 		 353 aa  228  1e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.424406 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0846  methylthioribose-1-phosphate isomerase  40.76 
 
 		 356 aa  228  1e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4053  methylthioribose-1-phosphate isomerase  37.82 
 
 		 351 aa  228  1e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4924  methylthioribose-1-phosphate isomerase  40.69 
 
 		 348 aa  228  1e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.64519  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0319  methylthioribose-1-phosphate isomerase  42.12 
 
 		 347 aa  227  2e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1491  translation initiation factor, aIF-2BI family  43.02 
 
 		 353 aa  227  2e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.626941  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0419  translation initiation factor 2B subunit I family (IF-2BI)  39.77 
 
 		 347 aa  226  3e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.04546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0441  methylthioribose-1-phosphate isomerase  40.69 
 
 		 348 aa  226  4e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1099  methylthioribose-1-phosphate isomerase  37.99 
 
 		 353 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.767768 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1805  translation initiation factor, aIF-2BI family  39.94 
 
 		 354 aa  226  5.0000000000000005e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0332  methylthioribose-1-phosphate isomerase  41.55 
 
 		 348 aa  225  8e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0347  methylthioribose-1-phosphate isomerase  41.55 
 
 		 347 aa  225  8e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0379  methylthioribose-1-phosphate isomerase  41.55 
 
 		 348 aa  225  8e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1646  translation initiation factor, aIF-2BI family  44.74 
 
 		 340 aa  225  1e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4159  methylthioribose-1-phosphate isomerase  38.6 
 
 		 351 aa  225  1e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.109098  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3942  methylthioribose-1-phosphate isomerase  37.54 
 
 		 351 aa  224  2e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4251  methylthioribose-1-phosphate isomerase  37.54 
 
 		 351 aa  224  2e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0703  translation initiation factor 2B subunit I  46.61 
 
 		 351 aa  224  2e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000787843 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0316  methylthioribose-1-phosphate isomerase  41.26 
 
 		 348 aa  224  3e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3789  methylthioribose-1-phosphate isomerase  38.6 
 
 		 351 aa  223  3e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.700016  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1534  translation initiation factor, aIF-2BI family  43.02 
 
 		 348 aa  223  4e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0648  aIF-2BI family translation initiation factor  45.37 
 
 		 348 aa  223  6e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674044  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1741  methylthioribose-1-phosphate isomerase  43.18 
 
 		 355 aa  222  7e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0491  translation initiation factor 2B subunit I  44.35 
 
 		 337 aa  221  9.999999999999999e-57  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.23967 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0810  aIF-2BI family translation initiation factor  41.71 
 
 		 349 aa  221  9.999999999999999e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0169  aIF-2BI family translation initiation factor  38.24 
 
 		 345 aa  221  9.999999999999999e-57  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00178496 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1844  initiation factor 2B alpha/beta/delta  42.9 
 
 		 335 aa  221  1.9999999999999999e-56  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18480  putative translation initiation factor, aIF-2BI family  40.5 
 
 		 355 aa  221  1.9999999999999999e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0224403  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3765  translation initiation factor, aIF-2BI family  43.02 
 
 		 345 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0692423  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4139  methylthioribose-1-phosphate isomerase  36.87 
 
 		 353 aa  220  3e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.196624  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>