235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_2386 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_2386  methylthioribose-1-phosphate isomerase  100 
 
 		 364 aa  734    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1050  methylthioribose-1-phosphate isomerase  99.73 
 
 		 364 aa  732    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.246086  normal  0.396346 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1886  methylthioribose-1-phosphate isomerase  92.5 
 
 		 362 aa  664    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.876537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5890  methylthioribose-1-phosphate isomerase  71.82 
 
 		 364 aa  525  1e-148  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0342096  normal  0.365892 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4832  methylthioribose-1-phosphate isomerase  70.99 
 
 		 364 aa  516  1.0000000000000001e-145  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.633545  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0521  methylthioribose-1-phosphate isomerase  69.75 
 
 		 367 aa  501  1e-140  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4697  methylthioribose-1-phosphate isomerase  64.64 
 
 		 374 aa  458  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.293654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5307  methylthioribose-1-phosphate isomerase  65.19 
 
 		 374 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4407  methylthioribose-1-phosphate isomerase  63.26 
 
 		 374 aa  449  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.791642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0161  methylthioribose-1-phosphate isomerase  65.67 
 
 		 367 aa  450  1e-125  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0665  aIF-2BI family translation initiation factor  61.77 
 
 		 362 aa  439  9.999999999999999e-123  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.360605  normal  0.588664 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4936  methylthioribose-1-phosphate isomerase  63.26 
 
 		 373 aa  432  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.313039 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2247  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized protein  61.77 
 
 		 364 aa  432  1e-120  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.679143  normal  0.145902 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4113  aIF-2BI family translation initiation factor  64.97 
 
 		 360 aa  431  1e-120  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0451  methylthioribose-1-phosphate isomerase  61.75 
 
 		 365 aa  429  1e-119  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0360  methylthioribose-1-phosphate isomerase  63.04 
 
 		 390 aa  431  1e-119  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6703  translation initiation factor, aIF-2BI family  60.82 
 
 		 364 aa  428  1e-119  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0674  translation initiation factor, aIF-2BI family  60 
 
 		 365 aa  429  1e-119  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.887106  normal  0.0224655 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6183  aIF-2BI family translation initiation factor  62.5 
 
 		 365 aa  428  1e-119  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.995024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0662  aIF-2BI family translation initiation factor  59.73 
 
 		 365 aa  427  1e-118  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.437714 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3353  translation initiation factor, aIF-2BI family  59.39 
 
 		 366 aa  426  1e-118  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0641  translation initiation factor, aIF-2BI family  60.55 
 
 		 365 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.173819 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0648  methylthioribose-1-phosphate isomerase  61.58 
 
 		 367 aa  416  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4121  aIF-2BI family translation initiation factor  57.34 
 
 		 367 aa  401  1e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25341  methylthioribose-1-phosphate isomerase  56.95 
 
 		 370 aa  396  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1913  methylthioribose-1-phosphate isomerase  58.47 
 
 		 375 aa  385  1e-106  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000486735  normal  0.985387 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1306  eIF-2B alpha/beta/delta-related protein  56.39 
 
 		 369 aa  360  2e-98  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0012837  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3292  methylthioribose-1-phosphate isomerase  55.65 
 
 		 356 aa  345  6e-94  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.178535  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3335  methylthioribose-1-phosphate isomerase  54.27 
 
 		 362 aa  336  5e-91  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000368125 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1971  methylthioribose-1-phosphate isomerase  50.73 
 
 		 359 aa  334  1e-90  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1992  translation initiation factor 2B subunit I  47.99 
 
 		 348 aa  286  5e-76  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.337411 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1543  translation initiation factor, aIF-2BI family  46.33 
 
 		 333 aa  275  1.0000000000000001e-72  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0321135  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1360  translation initiation factor, aIF-2BI family  44.08 
 
 		 342 aa  273  2.0000000000000002e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0559648  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0621  translation initiation factor 2B subunit I  44.74 
 
 		 342 aa  273  4.0000000000000004e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0997628  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3560  translation initiation factor, aIF-2BI family  46.4 
 
 		 357 aa  267  2e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0254  aIF-2BI family translation initiation factor  45.83 
 
 		 346 aa  265  8.999999999999999e-70  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0156  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized protein  48.29 
 
 		 354 aa  265  1e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0016  aIF-2BI family translation initiation factor  45.48 
 
 		 343 aa  261  1e-68  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.570831  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0016  aIF-2BI family translation initiation factor  45.48 
 
 		 343 aa  261  1e-68  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.339634  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1175  translation initiation factor 2B subunit I  44.51 
 
 		 354 aa  260  3e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3749  putative translation initiation factor, aIF-2BI/5-methylthioribose-1-phosphate isomerase  45.82 
 
 		 354 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0485  aIF-2BI family translation initiation factor  46.99 
 
 		 353 aa  259  7e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.646058  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1647  translation initiation factor, aIF-2BI family  46.24 
 
 		 329 aa  255  9e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2349  aIF-2BI family translation initiation factor  47.01 
 
 		 358 aa  255  1.0000000000000001e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.944221  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0810  aIF-2BI family translation initiation factor  44.35 
 
 		 349 aa  254  2.0000000000000002e-66  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1944  translation initiation factor 2B subunit I  44.69 
 
 		 352 aa  254  2.0000000000000002e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00466755  normal  0.570212 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4322  aIF-2BI family translation initiation factor  44.22 
 
 		 346 aa  253  3e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.394096  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0676  translation initiation factor, aIF-2BI family  42.51 
 
 		 339 aa  252  7e-66  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0103604  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0648  aIF-2BI family translation initiation factor  44.51 
 
 		 348 aa  251  1e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674044  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4334  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized protein  45.93 
 
 		 337 aa  251  2e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0072  translation initiation factor 2B subunit I  43.93 
 
 		 346 aa  250  4e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.25912 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1519  aIF-2BI family translation initiation factor  43.28 
 
 		 350 aa  248  1e-64  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.889993  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0394  methylthioribose-1-phosphate isomerase  43.03 
 
 		 348 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3379  aIF-2BI family translation initiation factor  42 
 
 		 346 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0327  methylthioribose-1-phosphate isomerase  43.32 
 
 		 348 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0441  methylthioribose-1-phosphate isomerase  42.73 
 
 		 348 aa  241  1e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2170  aIF-2BI family translation initiation factor  46.53 
 
 		 344 aa  239  4e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4924  methylthioribose-1-phosphate isomerase  42.43 
 
 		 348 aa  239  4e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.64519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0964  translation initiation factor, aIF-2BI family  42.47 
 
 		 351 aa  239  5.999999999999999e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.518904  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0510  aIF-2BI family translation initiation factor  43.64 
 
 		 346 aa  238  1e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3596  translation initiation factor, aIF-2BI family  43.06 
 
 		 346 aa  238  2e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.82629  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0999  aIF-2BI family translation initiation factor  42.38 
 
 		 327 aa  237  2e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.260098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0927  aIF-2BI family translation initiation factor  40.95 
 
 		 323 aa  237  2e-61  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0419  translation initiation factor 2B subunit I family (IF-2BI)  38.9 
 
 		 347 aa  236  3e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.04546  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0332  methylthioribose-1-phosphate isomerase  42.14 
 
 		 348 aa  236  4e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0379  methylthioribose-1-phosphate isomerase  42.14 
 
 		 348 aa  236  4e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0846  methylthioribose-1-phosphate isomerase  41.19 
 
 		 356 aa  236  4e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18480  putative translation initiation factor, aIF-2BI family  42.65 
 
 		 355 aa  236  4e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0224403  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0319  methylthioribose-1-phosphate isomerase  42.43 
 
 		 347 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0347  methylthioribose-1-phosphate isomerase  42.14 
 
 		 347 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0316  methylthioribose-1-phosphate isomerase  41.84 
 
 		 348 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3646  translation initiation factor, aIF-2BI family  44.83 
 
 		 346 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3753  translation initiation factor, aIF-2BI family  44.54 
 
 		 346 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3765  translation initiation factor, aIF-2BI family  45.45 
 
 		 345 aa  233  5e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0692423  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1881  aIF-2BI family translation initiation factor  40.75 
 
 		 345 aa  233  5e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4053  methylthioribose-1-phosphate isomerase  39.17 
 
 		 351 aa  232  8.000000000000001e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4098  methylthioribose-1-phosphate isomerase  39.61 
 
 		 351 aa  231  1e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.463174  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2235  translation initiation factor, aIF-2BI family  43.54 
 
 		 350 aa  231  1e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2877  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized proteins  43.36 
 
 		 350 aa  231  1e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4687  methylthioribose-1-phosphate isomerase  41.57 
 
 		 350 aa  231  1e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0027  aIF-2BI family translation initiation factor  40.23 
 
 		 337 aa  231  1e-59  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1491  translation initiation factor, aIF-2BI family  44.67 
 
 		 353 aa  231  2e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.626941  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3774  methylthioribose-1-phosphate isomerase  38.89 
 
 		 351 aa  231  2e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0865  aIF-2BI family translation initiation factor  41.96 
 
 		 321 aa  231  2e-59  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0114166 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1646  translation initiation factor, aIF-2BI family  45 
 
 		 340 aa  230  2e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0893  translation initiation factor, putative, aIF-2BI family  42.27 
 
 		 350 aa  231  2e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.592347  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1015  translation initiation factor, aIF-2BI family  42.27 
 
 		 350 aa  231  2e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.253315  unclonable  0.0000000000388932 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3816  methylthioribose-1-phosphate isomerase  42.69 
 
 		 350 aa  231  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.732544 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1791  translation initiation factor 2B subunit I  43.08 
 
 		 321 aa  231  2e-59  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2613  translation initiation factor, aIF-2BI family  39.17 
 
 		 349 aa  230  3e-59  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0169  aIF-2BI family translation initiation factor  39.5 
 
 		 345 aa  230  3e-59  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00178496 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1099  methylthioribose-1-phosphate isomerase  38.95 
 
 		 353 aa  230  4e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.767768 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1643  translation initiation factor  42.77 
 
 		 344 aa  229  4e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.226672  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2078  methylthioribose-1-phosphate isomerase  41.32 
 
 		 353 aa  229  4e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.424406 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4159  methylthioribose-1-phosphate isomerase  38.89 
 
 		 351 aa  230  4e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.109098  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15800  methylthioribose-1-phosphate isomerase  43.6 
 
 		 358 aa  229  8e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0503  translation initiation factor, aIF-2BI family  42.99 
 
 		 350 aa  229  8e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0595  translation initiation factor, aIF-2BI family  39.88 
 
 		 328 aa  229  8e-59  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3942  methylthioribose-1-phosphate isomerase  38.89 
 
 		 351 aa  228  9e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4251  methylthioribose-1-phosphate isomerase  38.89 
 
 		 351 aa  228  9e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>